Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001184761.2
Sequence Length
1073 nt
GC Content
0.5452
CCGCUUUACCCGUCUCCCUCCUGGCGCUUGUCCUCCUCUCCCAGUCGGCACCACAGCGGUGGCUGCCGGGCGUGGUGUCGGUGGGUCGGUUGGUUUUUGUCUCACCGUUGGUGUCCGUGCCGUUCAGUUGCCCGCCAUGGCUGAGCUGGAUCCGUUCGGCGCCCCUGCCGGCGCCCCUGGCGGUCCCGCGCUGGGGAACGGAGUGGCCGGCGCCGGCGAAGAAGACCCGGCUGCGGCCUUCUUGGCGCAGCAAGAGAGCGAGAUUGCGGGCAUCGAGAACGACGAGGCCUUCGCCAUCCUGGACGGCGGCGCCCCCGGGCCCCAGCCGCACGGCGAGCCGCCGGGGGGUCCGGAUGCUGUUGAUGGAGUAAUGAAUGGUGAAUACUACCAGGAAAGUAAUGGUCCAACAGACAGUUAUGCAGCUAUUUCACAAGUGGAUCGAUUGCAGUCAGAGCCUGAAAGUAUCCGUAAAUGGAGAGAAGAACAAAUGGAACGCUUGGAAGCCCUUGAUGCCAAUUCUCGGAAGCAAGAAGCAGAGUGGAAAGAAAAGGCAAUAAAGGAGCUAGAAGAAUGGUAUGCAAGACAGGACGAGCAGCUACAGAAAACAAAAGCAAACAACAGCAGAAGAAGCCUUUGUAAAUGACAUUGACGAGUCGUCCCCAGGCACUGAGUGGGAACGGGUGGCCCGGCUGUGUGACUUUAACCCCAAGUCUAGCAAGCAGGCCAAAGAUGUCUCCCGCAUGCGCUCAGUCCUCAUCUCCCUCAAGCAGGCCCCGCUGGUGCACUGAAGAGCCACCCUGUGGAAACACUACAUCUGCAAUAUCUUAAUCCUACUCAGUGAAGCUCUUCACAGUCAUUGGAUUAAUUAUGUUGAGUUCUUUUGGACCAAACCUUUUUGUCUUUAGAGUUGUUCAUUGUUUGUGAUUGCAUGUUUCCUUCCUUCAACUGUGUUCUCCCUGGCAUUCAGAGAGGAGGGAGAGGAGGAAGAGGAAGGGGAGGGAAGCUUCCCAAGAGUAGCCUCAACCUGUGCUUCUGUGCAUUAUUCUGAGAAUAAAUUUCUGUUUCAAACUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-388.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -406.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 356.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........((((.(.((((((((((.(((((((((.((((((..........((((.((((((((((...((((((((((((.((((.((.......)).))))..((((.(((.((.(((((((((((......)))..))))))))..)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))).))).)))))))).)).).))))...((((((.((.....))))))))..((((..((((((...(((((((((..(..(.((((.((((((((((....((((((((...(((((((((..(((..(((....))).)))))))))))).))))))))..)))........)))))))((((..((((...(((((((((((...((.((((....))))...)).....)))))).)))))........))))..))))(((((...((..........)).)))))..)))).)..)..))))))))).((((((((((((((((((((.((.(......((((((((.(((((..(((((((((((((.(((.(((.(((((((((.((..............((........)).......((((..(...(((((........))))).)..)))).....(((((((((..(((((..(((((..(((((.......)))))..)).))).)))))....))).))))))..)))))).)))))..))).......))).)))((((.((((..((....)).))))..))))..............((((((.(((((((....(.(((((....))))).).....)))))))..)))))).))))))))))......))))))))))))).....(((((((.....))))..)))..((((((((((((..((.(.(((((.(((.....))).))))).).)).)))))))).)))).((((((....))))))..(((....)))..))).))))))).)))....)))))))))).))))))..))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{{,.....((,((((((((....(({.((((((((((((....((((((((....)))).))))((((((,(((((.(.((({.(((.(({{{{{(((,...,.(((((((((((,((((((..((((.(((({.(((((((((((.{(,|{{(||((((..|{{{||||||(({((((......))))))))..,}},},})),))))}}))))..},,)).)))))).)))))....}))))..))))..))))).}...))))))))))},...)))))))))...)))}}))}.)))}}).)))))}(((((((((..{{,..((({,..,))})))))))))))).{((,(((({.(((,,,,,,.,(((((,,,,,|}}}|(({{{{,..{({{{{{{,{(({{(({.{((((((,{{({.((((((..((.{{(((..((((...))))..)),((({....,)))..........,)),)).))))))},||{(({{,,((({..((((({,..((.,,,,}},..,}|}..,}}}.,|||}...}}}}.}||,,,,|||}|||.||||,|||(((({((((,(({...,,..,{,,,,({........||,,,.,..((({.,{...(((((........)))))....}}}},{{{{((({({,((,,(((((..(((((..(((((.......)))))..))},)).)))))....,}}.}))))}.,,)))))}))))).......,,,..,|}|}|,({{{.((({|.,,....,),})))..))))...........,,,((((({.(((((((....,.(((((....))))).}.....)))))))..)))))).}}))),))))}},,..,}))))))),))}..))))))))}}))))))).,}}}),,.,|||||})).))}}).)},{((((.(((,...,))).))))})))))))))))).))),...)))))))).}),,,.,.,|{||,,.||{,...,((((.....,)))}..,},))))||,....,,,,.............
Back