Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001190.4
Sequence Length
1563 nt
GC Content
0.6040
ACAGUUACGCGCCGCACGGAUCAUGGCCGCAGCCGCUCUGGGGCAGAUCUGGGCACGAAAGCUUCUCUCUGUCCCUUGGCUUCUGUGUGGUCCCAGAAGAUAUGCCUCCUCCAGUUUCAAGGCUGCAGACCUGCAGCUGGAAAUGACACAGAAGCCUCAUAAGAAGCCUGGCCCCGGCGAGCCCCUGGUGUUUGGGAAGACAUUUACCGACCACAUGCUGAUGGUGGAAUGGAAUGACAAGGGCUGGGGCCAGCCCCGAAUCCAGCCCUUCCAGAACCUCACGCUGCACCCAGCCUCCUCCAGCCUCCACUACUCCCUGCAGCUGUUUGAGGGCAUGAAGGCGUUCAAAGGCAAAGACCAGCAGGUGCGCCUCUUCCGCCCCUGGCUCAACAUGGACCGGAUGCUGCGCUCAGCCAUGCGCCUGUGCCUGCCGAGUUUCGACAAGCUGGAGUUGCUGGAGUGCAUCCGCCGGCUCAUCGAAGUGGACAAGGACUGGGUCCCCGAUGCCGCCGGCACCAGCCUCUAUGUGCGGCCUGUGCUCAUUGGGAACGAGCCCUCGCUGGGUGUCAGCCAGCCCACGCGCGCGCUCCUGUUCGUCAUUCUCUGCCCAGUGGGUGCCUACUUCCCUGGAGGCUCCGUGACCCCGGUCUCCCUCCUGGCCGACCCAGCCUUCAUCCGGGCCUGGGUGGGCGGGGUCGGCAACUACAAGUUAGGUGGGAAUUAUGGGCCCACCGUGUUAGUGCAACAGGAGGCACUCAAGCGGGGCUGUGAACAGGUCCUCUGGCUGUAUGGGCCCGACCACCAGCUCACCGAGGUGGGAACCAUGAACAUCUUUGUCUACUGGACCCACGAAGAUGGGGUGCUGGAGCUGGUGACGCCCCCGCUGAAUGGUGUUAUCCUGCCUGGAGUGGUCAGACAGAGUCUACUGGACAUGGCUCAGACCUGGGGUGAGUUCCGGGUGGUGGAGCGCACGAUCACCAUGAAGCAGUUGCUGCGGGCCCUGGAGGAGGGCCGCGUGCGGGAAGUCUUUGGCUCGGGCACCGCUUGCCAGGUCUGCCCAGUGCACCGAAUCCUGUACAAAGACAGGAACCUCCACAUUCCCACCAUGGAAAAUGGGCCUGAGCUGAUCCUCCGCUUCCAGAAGGAGCUGAAGGAGAUCCAGUACGGAAUCAGAGCCCACGAGUGGAUGUUCCCGGUGUGAAGCUGCAGGCUGUGCUCCAGAUCCACCGACCCGUAGCAUCUCGUCACGCCAGCACUCGCCUCCCUACCAAUGACUCACCUGAAGUGCAAUACGAAAUAAAAGGCCAGCGGGCGGCGUCUGGGUCUCUGGCGCCCCCAUGUGGUUGCGACACUCCCAAAGCCGUAAGGGCCGACCCAGGCAUCUUGGCCCCCAGCCCCUCGUCGCGGGUUCAGGUCCGCCCAUUACUCCUUGUCGUGCGGUCAAGGAUACACCUUGGCCCCGAUUCCGGAUCUCUCCGUUCUCAGGCCAGACCCCUGGUGCUGCCGUUGAUUUUUUUUUCUCUGUCUUUGCUGCAAUUUUGAAAUAAAAUGCCAAAGAACACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-627.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -658.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 379.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.((.((((((.((.(((((((....))...((((((((...((((......))))...))))))))..(((((((((((((...((.......))...))....(((((..(((((((....))))))).))))).))))))))))).........((((((((((((((((...((((..(((((((..........((((((((((.(((.(((....((((......(((((((((..(......)..)))))))))))))..)))))).(((((((((((((((..((((((((((((((((...((((..((...((((((((.((((((.(....((........))..).))))))..((((..((((......)).))..)))).((((....))))))))).)))..)))))).)))).((((..((((((...(((......)))....))))))..))))))))))...)).))))((.(((((((.....(((((..(((.(.....).)))..)))))))))))).))))).....)))))))).))))((((((.((((.((.((((((((.(.((((..(.((...((((((.(.((.(((((.(((((..(((......)))....)))))..((((((((.(((..((((((....))))))))).)))))))).(((........)))))))).)).).)))))).)))..))))))))))))))).)....)))))))))......(((..((.((((.....)))).))..)))..(((...)))(((((..(((((.(((....))).)).))).)))))......((((((((((((((.(.(((((((((((((...((......)).((((((..((((((..(((......)))....)))).))..))(.(((((((((...(((((.((((.((..........(((.(.((.((((((((((..((((((((.((.((.(((((....((....(((.(((((((........)))..)))))))((((((..((((((......))))))((.(((((.((((......))))..((((((((((((((((.((((((((.....)))))....)))))).))))......)))).)))))...))))).))...))))))))..))))).)).)).))))...))))..).))))))))).))).)))...........)))))))))))...))))))))).)..................))))))))))).))))))).)).))))))))))))))))))))))......)))))))((((..((((((......))).)))))))..))))...))))))).))).))))))................((((.(.((((((((.....)))))))))))))..((((....))))......))))))).))...)))).)))).)))))..........((((((((..(((.(((......))).)))))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((((.((.((((((.((.(((((((....))...((((((((...((((......))))...))))))))..(((((((((((,({..,,,..,....,.,,,...,.,{(((..(((((((....))))))),))))).)))))))))))......|,.((((((((((((((((...((((.,(((((({.{....,...((((((((((.(({.(((,,..((((......(((((((((..{......,..)))))))))))))..}))}}}.((((((((((((,,,.,((((((((((({{({{...{({{{,.,,,{{({(({{..{{{{{|,,,,.(((..,{,{(.{{{{{|((({....{{{(,,{(((,.....}}.)).,)))}.}},)}}),..))).,))))))}))))))).)))).{{({..{(({((.|.(((.,,...)))..,.))))))..)))})))))}..,)).))))|{.(((((((.....(((((..(((.(.....).)))..)))))))))))).}}||}.....)))))))).)))){(((((.((({.((.((((((((.(.((({..,.((.,.((((((.(,({.(((((.(((((..(((......)))....)))))..((((((((.(((..((((({....})))))))).)))))))).{((....,,,.}},))))).}}.).)))))).)}),.})))))))))))))).)....))))))))),,,.,.{{{,.{{.{(({....,)))).}}}})})}}|||,..,,}(((({..{{{,{.{((....})),,..})).)))))...,..((((((((((((((.(.(((((((((((((...((,.,...}|.(((,,{..,{(({||.{,{.{{{,.,,}..,.,)))}).,||}(.(((((((((...(((((.((((.((..........{({.(.((.((((((((((,,((((({({,((,((,((((((,,(,(,.{{({|{(({{,{|,,..||,,)),|}}))),,{((((((..,{((((......)))||{((.(((((.{(((......)))}..((((((((((((((({{(((((((({....)))))....)))))),})))......)))).)))))...))))).))}},))))))...,))))),)),)).))))...}}}}..).))))))))).))).))).}........,)))))))))))...))))))))).).||...............},))))))))).))))))).)).)))))))))))))))))))))).,,..}))))))){{{,..{({(((,.....))).}}))))),,))))...))))))).)))}})))))................{(((.(.((((((((.....))))))))))))}..((((....))))......))))))).))...)))).))))},)))}..........{(((((((..(((.((({,...,)))}))))))))},)}..
Back