Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001190850.2
Sequence Length
3538 nt
GC Content
0.4435
GGAGGAGUCUUACCCUAAUGUAAGAUGGUGGCCCGUCUGGCUGUGGAACCCACCGAAAGCUGAGAGUCUCUCUCUCAGCCGUAAAGGUCGGACUCGCUGAAGCAAUCAGGCCCGGUUCUGAAGAGUUUUUUCCCCGACGCUCGUUCGGUGGUUUCUUGUGAGGACGCGGCAGCCCGUGGAGUCGGCUGAGGGAAAAGCGAGGCAAGGCAGGCGGGUCGUCAAAGUCCUACAUUUUAGCUUUCAGUGCUGAACUUCCUUCUCCCUUAAAUUAUUAUAAACUUUUGCUGCUGUUUAAUAAACGUGAAGAUGUCUCGCAGUCCUGAUGCGAAGGAAGACCCUGUGGAGUGCCCUCUUUGCAUGGAGCCCUUGGAGAUAGAUGAUAUCAACUUUUUCCCUUGCACCUGUGGCUACCAGAUUUGCCGAUUUUGUUGGCAUCGAAUUCGCACUGAUGAAAAUGGGCUUUGUCCUGCAUGUAGAAAGCCAUAUCCAGAAGACCCAGCAGUUUAUAAACCACUCUCCCAGGAAGAGCUGCAAAGGAUAAAGAAUGAGAAAAAACAGAAACAAAAUGAGAGAAAACAGAAAAUAUCAGAAAAUCGCAAACAUUUGGCUAGUGUACGUGUCGUACAAAAAAACCUCGUCUUUGUUGUAGGUUUAUCUCAGCGCCUAGCAGACCCAGAGGUUUUAAAACGACCAGAAUAUUUUGGGAAGUUUGGUAAAAUACAUAAAGUUGUCAUCAAUAAUAGCACAUCAUAUGCAGGCUCACAGGGUCCAAGUGCCAGUGCUUAUGUAACCUAUAUCCGGUCAGAAGACGCUCUCAGAGCCAUACAGUGUGUCAACAAUGUGGUAGUAGAUGGCAGAACACUUAAGGCAUCUCUAGGUACAACAAAAUACUGCAGUUACUUCUUAAAGAAUAUGCAGUGUCCAAAACCUGACUGCAUGUAUCUUCAUGAAUUGGGGGAUGAGGCGGCCAGCUUCACAAAAGAGGAAAUGCAGGCGGGUAAACACCAAGAAUAUGAACAGAAGCUACUUCAAGAAUUAUAUAAAUUAAAUCCCAAUUUUCUUCAGCUAUCUACGGGUUCAGUUGAUAAAAAUAAGAACAAAGUGACACCACUGCAGAGGUACGAUACCCCCAUUGACAAACCUUCAGAUUCUCUCAGUAUAGGGAACGGUGAUAAUUCCCAGCAGAUAUCUAACAGUGAUACGCCUUCACCACCACCUGGUUUGUCAAAAUCCAAUCCAGUCAUCCCCAUCAGUUCAUCCAAUCACAGUGCACGGUCCCCUUUUGAAGGGGCAGUAACAGAGUCACAGUCGUUAUUCUCAGACAAUUUUCGCCAUCCCAACCCUAUCCCAAGUGGGCUUCCUCCUUUCCCCAGCUCCCCACAGACAUCCAGUGACUGGCCUACAGCACCAGAACCACAGAGCCUCUUCACAUCAGAAACAAUCCCAGUAUCAUCCUCUACAGACUGGCAAGCAGCUUUUGGCUUUGGUUCUUCUAAACAACCAGAGGAUGACUUGGGUUUUGAUCCCUUCGAUGUCACUCGAAAAGCCUUAGCAGACCUGAUUGAGAAGGAACUGUCCGUUCAAGACCAACCUUCCCUUUCGCCCACAUCUCUUCAGAACUCCUCUUCACACACUACAACCGCCAAAGGUCCAGGCUCUGGAUUCCUGCAUCCUGCUGCAGCUACAAAUGCCAAUUCUCUCAAUAGUACCUUUUCAGUCUUGCCCCAGAGGUUCCCUCAAUUUCAGCAGCACCGAGCGGUUUAUAAUUCAUUCAGUUUUCCAGGCCAGGCAGCCCGCUAUCCUUGGAUGGCCUUUCCACGCAAUAGCAUCAUGCACUUGAACCACACAGCAAACCCCACCUCAAAUAGUAAUUUCUUGGACUUGAAUCUCCCGCCACAGCACAACACAGGUCUGGGAGGGAUCCCUGUAGCAGACAACAGCAGUUCUGUAGAGAGUUUAAAUAUGAAGGAAUGGCAGGACGGGCUAAGGGCACUUCUACCCAACAUUAACAUCAACUUUGGUGGACUGCCCAAUUCUUCUUCCCCCUCCAACGCCAACCACAGUGCACCAACGUCCAACACUGCCACCACCGACAGCCUGAGUUGGGACAGCCCUGGCAGCUGGACAGACCCAGCCAUCAUCACAGGUAUUCCAGCGUCUUCAGGAAACAGUUUAGACUCUCUUCAAGAUGACAAUCCUCCACACUGGCUAAAAUCCCUUCAGGCCCUCACAGAGAUGGACGGCCCCAGCGCUGCUCCAUCACAGACCCACCACAGCGCCCCCUUCAGCACACAGAUCCCGCUGCACAGAGCCAGUUGGAAUCCCUACCCUCCUCCUUCAAACCCUUCCAGCUUCCACUCCCCACCCCCAGGCUUUCAGACAGCCUUCAGACCCCCCAGCAAAACCCCCACAGAUUUACUACAGAGUUCAACACUGGACCGCCAUUAGGCAAAGAGGAGCAACCAUUAGAAAAUGCAGGAUUUGUCCCACUCUGUUUUCUCCCUCUCAGCCCACCACCCACAGCUCCCUUCUCAUCUCUUAUGUUCUGAAGAAUCCAGUACCUGAUCAAUUUUUUUUCUCCCUAACCCCAGAUGCAAUGCGAUCACAGGGUCAUUACCAUCUCUUUAUUAAUUGUAAAAAUUUUUGUUGAUCCAGCAUUUGAGUGACACUGUUGAAUGUUUCUAAAAAUGCCUUUUUAAGGAGAGAAAAAAAAAUCAAAGGGCAGUCUCAAUACUUAGAAAAUUAUUGUUUGUCUGUUGCGCAUAAUAAUGACAUAAUCUGCUUAGCAGAAAAUGACGAUUAAUCUAUAGGAAAGCUCAAGUAAAUGCAUUAUCAACUGCAGAAGUUUGAAAACCAGGUUCAUUUACGUGAGAUUGCUAAAUGCAUGGGGGAAAGCAGUGGUCCUAGCAUCCAUCUUGUAUUCAGCUUAUCAUUAUUGCAGGGAAAAUGCUUUUAAUUUAAAUUAAUUUUUAAUUCUUUUGGCAAGUUGAUGGCAAGGACUUGAUUGUGUCAUUAAGCAAAAGAAUGUAUUGGAAGUUGAUGGAAAGACAAAUUCAUCUGUAGUAGUAACUGGCCGAUUGCUAAAGAGUUCAUAAGGAGGUGAGAAGUAAUUUUUUUAAAGGAGAAAAAUUUUUUGGCUUUAGAUUUAAAGUAAAUUGAAAUGUUUUAAAGAAAAAAGUAUUCACAGAUUUAAUACCUAUUAAUAAUAUAAGAGCUGAAAUGUAAGUCAUUUCUUCAGUCCUUCUCCUCUGUCGGAAUCUUUUUUGUUUUACCAUAAAUUCACCUGACGAGGGCACUCUGAGAUAGCACUGCUCUGGGGCCAUCUGAUCACCAUCGGGAGCAAAUCUCUGACCUCCUUGCCUGCAGCUUUUACUUAACCCUGUAGUUUCUGGACGUUUGUGCAGUAUUGAAAAGACAGGAGAAAAGAAAACAGAAACCUGGUUAUAACCUGACGCUAAAACUAAAAACAAGGAAAUGUACCUCUUUCUUCAGAAUUAAAACUAAAAUCUUAAAUAAAACAGAAAACUUGAUGGUGACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-885.24 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -957.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 1144.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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