Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001195054.1
Sequence Length
1028 nt
GC Content
0.4961
GAGGUCAGAGACUUAAGUCUAAGGCACUGAGCGUAUCAUGUUAAAGAUGAGCGGGUGGCAGCGACAGAGCCAAAAUCAGAGCUGGAACCUGAGGAGAGAGUGUUCAAGAAGGAAGUGUAUCUUCAUACAUCACCACACCUGAAAGCAGUACAACUUUACCUACAAAAACAGGCAUCAGACCAGCUUGCCAACUUGUGGCAUAGACUGUUUGCUACAUGGAGCUUGUUCCAGCCACUCCCCAUUAUCCUGCAGAUGUGCUUUUCCAGACUGAUCCAACUGCAGAGAUGGCAGCUGAGUCAUUGCCUUUCUCCUUCGGGACACUGUCCAGCUGGGAGCUGGAAGCCUGGUAUGAGGACCUGCAAGAGGUCCUGUCUUCAGAUGAAAAUGGGGGUACCUAUGUUUCACCUCCUGGAAAUGAAGAGGAAGAAUCAAAAAUCUUCACCACUCUUGACCCUGCUUCUCUGGCUUGGCUGACUGAGGAGGAGCCAGAACCAGCAGAGGUCACAAGCACCUCCCAGAGCCCUCACUCUCCAGAUUCCAGUCAGAGCUCCCUGGCUCAGGAGGAAGAGGAGGAAGACCAAGGGAGAACCAGGAAACGGAAACAGAGUGGUCAUUCCCCAGCCCGGGCUGGAAAGCAGCGCAUGAAGGAGAAAGAACAGGAGAAUGAAAGGAAAGUGGCACAGCUAGCUGAAGAGAAUGAACGGCUCAAGCAGGAAAUCGAGCGCCUGACCAGGGAAGUAGAGGCGACUCGCCGAGCUCUGAUUGACCGAAUGGUGAAUCUGCACCAAGCAUGAACAAUUGGGAGCAUCAGUCCCCCACUUGGGCCACACUACCCACCUUUCCCAGAAGUGGCUACUGACUACCCUCUCACUAGUGCCAAUGAUGUGACCCUCAAUCCCACAUACGCAGGGGGAAGGCUUGGAGUAGACAAAAGGAAAGGUCUCAGCUUGUAUAUAGAGAUUGUACAUUUAUUUAUUACUGUCCCUAUCUAUUAAAGUGACUUUCUAUGAGCCAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-332.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -350.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((....))))..((((((((((((...))))).....((((.((((((..((......)).....(((((((((....(((.((((((..((((((....((..((((((....))))))..))....(((....)))......................((((...........))))....(((((((.........))))))).((((((((((((.((((((((.((((.(((((..((((.(((....(((.(((..(((.((....)).))))))))))))))))..((((((((((((.(.(.((((((((((.((.(((((....((((....(((((((.....)))))))....)))).........((((((((..((((((...((((((.....((((((((((........)))))....)))))(((((((((..((((((((..((......))..))))))))...))))).))))........(((((.....((((.((((((....(((((((((......))))))..))))).))))))))........)))))..))))))....))))))....))).)))))))))))).))))))...)))).)).))))))))))))..))))).))))...)))..)))))...((((((((...........)))))..))).))))..(((((((((..............))))).)))).))))))))((((.(((....))).))))(((.....)))))))))...((((.......)))).....((((........)))).)))))))))...))))).)))))))))).)))).))))))).......))).))))..((((.(........))))).(((((...(((((.........(((((...(((((((.((((.(((.(((.((......))))).))).)))).)))..)))))))))))))))))))...............
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((....))))..((((((({(({(...}}))}...|.((((.(((((({,({......||,..,{(((((((({{..{(((.{{,(((.,((((({....((..((((((....})))))..))....{{{,.,,|,|,....,,,,.,{{.......,}||{..,,{..,{{{{||{|,...{((((({.,,...,,.))))}}},(((({,,{||||,((((((((.((({.(((((,,{,,,.{{,....{{(.{((..{((.((,,..}}.)}))))})),))))},,.((((((((((((.(.(.((((((((((.((.(((((....((((....(((((((.....)))))))....))))........{((((((((..((((((...((((((.....,{({{(((((........)))))....||}}|(((((((((..((((((((..((......))..))))))))...))))).))))}.......(((((.,..,((((.((((((....(((((((((......))))))..))))),})))))))..,.,...)))))..))))))...,))))))....))).)))))))))))).)))))),..}))).)).))))))))))))..))))).})))...))}.,)))))...||||||||.......,}}}))}))}.,})}))....(((((((((.,,.......},..))))).)))),),))))))||||.,,{,..{|||{,,,,,,|}}}}.,)..,..|,..{(((,{{....}},,)}},.,||((,,......}})}.}}}}},,})..,))))).))),)))))).)))),))))))).......)))))}))..((((.(.......,})))).(((((...(((({........,(((((...(((({{(.((((.(((.(((.{,......,,))).))).)))).)))..)))))))))))))))))))...............
Back