Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001198909.2
Sequence Length
762 nt
GC Content
0.5486
GUUUCAGUGGCUUCUGGUGCUCUAGGGUGAGCUCUGCCCGGCUGCAGGGAUGGCGGGGAGGGGUAAGCUCAUCGCAGUGAUCGGAGACGAGGACACGGUGACUGGUUUCCUGCUGGGCGGCAUAGGGGAGCUUAACAAGAACCGCCAUCCCAAUUUCCUGGUGGUGGAGAAGGAUACAACCAUCAAUGAGAUCGAAGACACUUUCCGUUCACUUGGAAGCCUUCCGGGCAGUGUUGUAGAAGCCAACCCUAAUCAGCGUGACCCUCCGCUUUGGGAUGAAAUUGAUUCUAGGCAAUUUCUAAACCGGGAUGACAUUGGCAUCAUCCUCAUCAACCAGUACAUCGCAGAGAUGGUGCGGCAUGCCCUGGACGCCCACCAGCAGUCCAUCCCCGCUGUCCUGGAGAUCCCCUCCAAGGAGCACCCAUAUGACGCCGCCAAGGACUCCAUCCUGCGCAGGGCCAGGGGCAUGUUCACUGCCGAAGACCUGCGCUAGGGGACUCCUCAUAGCCCUCAGCCCUUCCCUCGUUUCCAGGCCUCUCCCCAGGCUUGCCAUCAGCCUUCUUUACUUUUUGAGCCUCUGAUUUCCAAUUCCCUGCUCCUUCCCACUCCAUUAAGAGGCUAGGUGAGGCGCUUCUAGGUUGCUGGGGCUCUGCUGGUUAAGGAACAGGAAGCCUGACCAUCUCCCUCCACUACCUCUUCCCUGUGCUGUUACACAGUGUCAUUGUUGAUGUUAAAUUAAAGUCAUAUUCUUGCUUCUCUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-260.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -271.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((...(((((((......))))...))).)))))).)))))...(((((((((((((..((((((((((((.((((((.((..........)).)))))).((((((((((((((((((((((...)))....................((((((((((..((......))..........((...(((((((((((......)))))((((...))))))))))...)).......(((((..((((.((...)))))))))))..(((((((........)))))))......(((((((........)))))))...................((((((((..(((....((((....((.((((((((.........((..((((((((.....)))).))))))..................((((.(((..((((((((((......((((.......)))).....))))))).)))))).))))...(((((.(((((((.....(((((((.(((((((....(((((.......)))))............((((....((........))...))))...............)))))))..).)))))).....)))..)))))))))))))))))...))..))))..)))..)))))))).)))))))))).)))))))))))))))...))))))))))).)))))..................))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((...(((((((......))))...))).)))))).)))))...(((((((((((((..((((((((((((.((((((.((..,.......)).)))))).(((((((((((((((((((,,.....,|....................((((((((((..((......}}.,,...,.,.{(...(((((((((((......)))))((((...))))))))))...)}.......(((((..((((.({...}))))))))))..(((((((........)))))))......(((((((........))))))}.........,|.,,.,.}.((((((((..(((.,..((((..,.{{.((((((((.........{,,.((((((((.....))))},)))}}........|.........((((.(((..((((((((((......((((.......)))).....))))))).)))))).))))...(((((.(((((((.....(({{{{({(((((,,....|||||}}....,||||}.,,.........((((....((........)}...))))...............))))))).}),)))))).....)))..))))))))}))))))))...})..))))..)))..)))))))).)))))))))).))))))))))))))}...)))))))))))}}))))..................))))))))))))).
Back