Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001199723.2

Sequence Length

1013 nt

GC Content

0.5499

AUCCACUUACUAGCGCAGGAGAAGGCUAUCUCGGUCCCCAGAGAAGCCUGGACCCACACGCGGGCUAGAUCCAGAGAACCUGACGACCCGGCGACGGCGACGUCUCUUUUGACUAAAAGACAGUGUCCAGUGCUCCAGCCUAGGAGUCUACGGGGACCGCCUCCCGCGCCGCCACCAUGCCCAACUUCUCUGGCAACUGGAAAAUCAUCCGAUCGGAAAACUUCGAGGAAUUGCUCAAAGUGCUGGGGGUGAAUGUGAUGCUGAGGAAGAUUGCUGUGGCUGCAGCGUCCAAGCCAGCAGUGGAGAUCAAACAGGAGGGAGACACUUUCUACAUCAAAACCUCCACCACCGUGCGCACCACAGAGAUUAACUUCAAGGUUGGGGAGGAGUUUGAGGAGCAGACUGUGGAUGGGAGGCCCUGUAAGAGCCUGGUGAAAUGGGAGAGUGAGAAUAAAAUGGUCUGUGAGCAGAAGCUCCUGAAGGGAGAGGGCCCCAAGACCUCGUGGACCAGAGAACUGACCAACGAUGGGGAACUGAUCCUGACCAUGACGGCGGAUGACGUUGUGUGCACCAGGGUCUACGUCCGAGAGUGAGUGGCCACAGGUAGAACCGCGGCCGAAGCCCACCACUGGCCAUGCUCACCGCCCUGCUUCACUGCCCCCUCCGUCCCACCCCCUCCUUCUAGGAUAGCGCUCCCCUUACCCCAGUCACUUCUGGGGGUCACUGGGAUGCCUCUUGCAGGGUCUUGCUUUCUUUGACCUCUUCUCUCCUCCCCUACACCAACAAAGAGGAAUGGCUGCAAGAGCCCAGAUCACCCAUUCCGGGUUCACUCCCCGCCUCCCCAAGUCAGCAGUCCUAGCCCCAAACCAGCCCAGAGCAGGGUCUCUCUAAAGGGGACUUGAGGGCCUGAGCAGGAAAGACUGGCCCUCUAGCUUCUACCCUUUGUCCCUGUAGCCUAUACAGUUUAGAAUAUUUAUUUGUUAAUUUUAUUAAAAUGCUUUAAAAAAAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-347.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -367.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 243.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

............(((.((((((((.(((....((((((((((((...((((.(((......)))))))...(((.....)))..(((((((.(.(((((..(((......))).....(((...))).((.(((((......))))))).(((((......)))))))))).).)).((((..........))))..((((......)))).(((((....))))).....(((((...(.(((((((((....(.((((((((.(((((((.((((((.(((.((......))..(((((((((.......((((((......))))))..........)))))).....)))))))))))).)))...))))..(((.(((((((((...((((((((((....(((.(.((((((((((((((((((((......(((.(.(((.((.......(((..((((((((...(((((...)))))((..(((((.....((((((..(((....))).)).)))))))))..))(((((((..(((.((((((.....)))))))))...)))))))...........(((((((((((..(((......(.(((....)))))))..)))))..))))))....)))).)))).))).......)).))))))).....)))))...(((.((((....((((((......))))))......)))))))))))))))))))))).).)))))))..)))))).)))))))))...)))......((((...((..(...((((((.((........)).)))))).).))...))))......)))))).)))..))))....))))).).)))))))))))))))...))))))).(((((((...............)))))))))))))))..))).)))..(((((.....)))))....................(((((.(((((....))))).)))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

...........,((({((({((((((({,,,,((({{(({{(({|||{{((.(((......)))||||..{((({{{,.,||..{,{,{(({(.(((,(,|({{{{{{{,....}}}))},.|,|||{.(,(((((......))))),,,|{{||},.,,.}))))))))},}.,,.,|{,,,..}}}}}})),,.,}||,......{((..(((({....)))))}}}..(((((...(.(((((((((....(.({((((((,({,((((.((((((.(((.((......}}..({{((((((.......,{{((({,,...))))))..........)))))).....)))))))))))).}))}..})))..(((.(((((((((...(((((({{({....(((.(.((((((((((((((((((((.{,...(((.(.(((.((.......(((..((((((((...(((((...)))))((..(((((.....((((((..(((....))).)),}))))))))..))(((((((..(((.((((((.....)))))))})...))))))).........{.(((((((((((..(((......{.(((....)))))))..))))),.})))))}...)))),,))).))).......)).)))}))),..,.)))))...{{{,{{((....((((((......)))))).,.,..)))},))))))))))))))))).).))))}})..)))))).)))))))))...)))......({((...((,.{...((((((.((........)).)))))).,.,,}.})))),.,...)))))).))}..))))}...})))),}.)))))))))})}}}}.,,|||}}||.(((((((....,......,.,,))))))),))}})}}.}))),)}}.,||||{,....}}}))...,,,.,,,,,.,,|,,,.{{{{{.,,{||....,}))).,}))),...