Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001204863.2

Sequence Length

1961 nt

GC Content

0.3830

CUUUCGACUGCCCCGGAACCCACCGGAGCAGGCAGCUGGGGGUGGGGGGGCGGCCCUGGGAUAGGGGCUGUGGCAGUACGCGGGGACCCGGCUGCGGUGGCUGCGGGACUGACGAAUGGAGAGGAGAAAACCUAUGGUGGCUGUGAAGGACCUGAUGCCAUGUAUGUCAAAUUGAUAUCAUCUGAUGGCCAUGAAUUUAUUGUAAAAAGAGAACAUGCAUUAACAUCAGGCACGAUAAAAGCCAUGUUGAGUGGCCCAGGUCAGUUUGCUGAGAACGAAACCAAUGAGGUCAAUUUUAGAGAGAUACCUUCACAUGUGCUAUCGAAAGUAUGCAUGUAUUUUACGUACAAGGUUCGCUACACUAACAGCUCCACCGAGAUUCCUGAAUUCCCAAUUGCACCUGAAAUUGCACUGGAACUGCUGAUGGCUGCGAACUUCUUAGAUUGUUAAAUAAAAUAAAUUAUAAUAAACUGUUAACUCUUUUCAGUAUUUAAUACCUGUAGUUCAGUUAGUAACUUUUUCAUAUAUAGCAUGUUGCCUGUAUGCAGUUGAACUAUAUAAAGUUCAUUGCAAAGCAGAUUAUCUUGUUUUUUUGCAUAGCAAUCAAAGUUGAAAUUUGUUUGCUACAUCAACAAAUUAAGGACAUUUUCACAAACUGAGAAAUAAACAAAUAUGCCAAUUCGUAGGUGGUUUUGCCUUAUCCUUUGAAUGUGACUUAAAAUCAGCAAUGAUGAUAUAGUAAAUACUGAAAUUUAGGUGUAAAUCAAUACGUUCUACAGGGAAAUAAUGAGGCUAAGUAUUUUUAUGUUUUUAGUGGUUUUUUAGAAACCUAAUCUUAUAGCCGCCAUUAGCAUUACUAGAGUUAUGCAAAUAAUUGCAUUAUAAACAUGUUUAUAACUUAGCCAAAACAUUGAUUUUUAUAACUCUCCAAGUAUGAGUUGAAAUUUCUUAUGUCUUUUGAUAAACUGCAGUAUUCUUUAAGUGUACUUUGUCCUUUUGUUUAUUGCUACAAUUUAAGAACUUUAUUUAAAAACAAUUUUGGAAGGUUACUAGGUACAGCUUUUGCAGAAGAAACUGAACUGUAGCCAGAUGGUCAGCAAGUAAACUACAUGACUUAGAGUUCUUGUGCAUUAUACAUUUUGGGUAAUUCAAAGUACUGUAUUUGCAUUGACUAUAAAGCGUCGUUUGCAAUAUUUAUUCUUCCUUCAUAGUCCCUUGUUGUGAUUAUACUUCCAGUUGUUUAAAUGUAUUUUAAAAGACUCACUAUUAACUUUAUUCAGAUCUUAAAAGCUACACCUUUUUGAACUAUUCCAGUCUUUCUCCAUCCAAUUAGAAUGUUAUGGAAUAACAUGUGAAGAGAUACAGUGAAAAUCAUAUUAUAAUGCAUUGAAGAUAUCCUACAUGAAUUAUCUUCUAUUAAAAUAUGUCCCAAUAAAUAUACCCAUAAUCAGUGGGUCUUCUACUGAAAUCAAGCUCAUUCAGCUUUUCUAUUAAGCAGCCAAAAAAUUUUUUGAAAAAAUAUGACAGCAUCAUUCCUUAUGCAUGGGGAAAGAAGCACUGGAGAUGGGUUUAGUAUUGUCUUUAUCUCAGAGGUGGAACAAAGUUGUCAUUAUAGGGUCUAUAAACUUAAGUCUCCAGCUUAUUUGAGACUGGCUUAAUAUGGCUGAGCCCGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUCAGAGGACGAGGCGGGUAGAUCACUUGAGGCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCACCAUGGCAAAACCCCAUCUCUACCAAAAAUGCAAAAAUUAGCUAGGCCAUGGUGGCACACGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGUGAGGCUGAGGCAUGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGUGGAGGUGGCAGUGAGCCGAGAUCGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCGAGACUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-514.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -553.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 476.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((((....((((((....(((....)))..))))))))))))(((((......)))))((.((((((.(((.(..(((((((((((((((.(((((((((((((.......(((......)))..((((((((((((((.(((((((..((((((((..........((.(((....((.(((....))).))....)))))))))))))...)))))))...(((....(((((.....)))))....))).((((.((((((.....(((.....)))...))))))..)))).))))))))...)))))).(((((((....))))))).))).)..)))))(((.((((..((.(((((((.(((((((((.....(((..((((........)))).))).((((((((..((((((............(((((((((..........(((((...)))))...........)))))))))..)))))))))).))))................(((((((..((((.((((((.(((((......)))))))))))..)))).....((((.(((.(((..((((((.((((.......)))).))))))...))).))).))))....((((((.....)))))).......)))))))....((.((((((((((((((((.(((((((((.(((.......((((....))))((((.((..(((((((((....((((((((.(((..(((......(((((....((((((((((((((...(((((((.((((((((....(((.......)))...))))))(.((((.....)))).)..((((((....)))))))).)))))))...)).))))))))........((..(((.((((((.........)))))))))..))...((((....)))).(((..((....))...)))(((((((((((...(((.((.(((.(((.....((((((((((((((((....))))))).((((((..(((.(((.((((.....)))).))).)))))))))....(((((...((....))...)))))))))))))))))))).)).)))....))).....)))))))).....(((((.((((........))))..)))))..............))))..))))))))..)))))))))))..((((.((((((.....)))))).))))..............((((((..................))))))((((((((((((((((((((.((....(((((...((..(((.....(((((((...(((((((...((((((.(((((....(((((((............)))))))))))).)))))).............((((((.....)))))).))).))))........))).))))((((.......))))...(((((....)))))......)))..))....)))))....)).)))))))))))....))))).)))).)))))))))..)).))))((((((.((((((.(((((.....(((((...))))))))))..)).)))).)))...)))..((((..(.(((.(((((((((....)))))).)))))).)..))))))).))))))))).))))))...)))))))))).)).)))))))))...((..((.(((((((((((((.......................((........))...))))))))))).)).))..))..((((((...(..((((..((.(....).))..))))..)...))))))))))))).))..)))))))......))))))))))).....)))).))))..)...)))..)))))).))..................

Thermodynamic Ensemble Prediction

........{(((((....((((((..,,(,,...,))}..)))))))))))|(((((......)))))|(.((((((.(((.,..(((((((((((((((.(((((..({..{....,...(((......))).,((((((((((((((.(((((((..((((((((,....,,,|,{{,{,,,,|,{{.||{.,,,},},}}....}}}},}))))))}...)))))))..,{{{....(((((.....)))))....))).{{((.(({{{{.....{((.....))),..})))}}.,}},,.))))))))...)))))),,,,{{{{|.,,|||},,}.}))}),.}}|||(((.((((..((.(((((((.(((((((((...,,(((..((((........)))).})),{{((((((,{((((({,,,,.,,,{{.{(((({{{{{....,,....,,||,.{{{(..|,....,..}}})}},,,}}}.,})})))})})}}}}},...............(({{{{|},((((.(((((,{(((((......)))))))))))..))))....,((({.({{.{((..((((((.((((.......)))).))))))...))).))}.}}))}...{(((((.....)))))).......,}}}))),...{(.{(((((((((((((((.(((((((((.(((.,,....((((....)))){{{{.({,.(((((((({....{((((({{{(((..(((..,.,.(((((....((({((((((((((...(((((({.{,((((((....(({.......}}}...))))))..,{{(,....},},.},.{(((({....})))))}}.}))))))...)),})))))))...{{{{.((..(((.((((((.........)))))))))..))..}|||,....||||.({(,.({....,,...}}}(((((((({((...(((.((.(((.(({....,((((((((((((((({....})))))).((((((..(((.(((.((((.....)))).))).)))))))))....(((((...((....))...)))))))))))))))))))).)).)))....))).....)))))))).{{{,{((((.((((........))))..)))))}},.........,,)))),,))))})))..))))))))))}..{(({.{(((((.....)))))}.}))}..............,{{{{,....,{{{{......}},))})},((((((((((((((((((((.{{....{{(((,,,({..|||.}}|,{{{{{{{,{.{{{{{{....((((((.(((((....(((((((........,...)))))))))))).)))))).............{(((((.....)))))}.,}},)))),......,||,.,,,}{{{{.......})))...(((({....}))))......,}}..,,,,,,}}}}}....)).))))))))))}...,)))))},))).)))))))))..)).}}||{{{(((.(((({(.{((({....{(((((...)))))))))}..}}.)))).))}..,))))}((((..{.{((.(((((((((....)))))).)))})).}..))))))).))))))))).))))))}..,))))))))).)}.)))))))))...,,{{((.(((((((((((((.......................{{........)}...))))))))))).)).)),}),..((((((...(..((((..((.{....}.))..))))..).,.))))))))))))).))..))))))),}},.,))))))))))),....}))).))))..}...)))..)))))).)}..................