Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001205179.2
Sequence Length
878 nt
GC Content
0.5251
GUCUUUCCCACCACGAGGCCACCAGGGUGACUGCGGGAUUCCGAUCUGCGCCGGAGCUGCGAUGCUAGAGCACUCUUGCCACCCCCACCCCACGGACGUGUUGCAGUGAUAUCAGAAUUUUGCGACAUGGUUUUAAACUUUAAAAUGAAAAUGUGAAACUAGGAAUGUUGCUGUGAGACCCCUUGGACAAACAGAUUUUUGCACUGGGGAUAGAACUUGAGCAAUUUCUGUCUUGGCCUCGCCACUGACGUCCCUUCUUUCCUGUGGGGACAGGAUGGACAGAUUCCUGGUGAAAGGGGCUCAAGGGGGCCUUUUGAGGAAGCAGGAGGAGCAAGAGCCAACUGGAGAAGAGCCAGCUGUGUUGGGAGGAGACAAAGAAAGCACAAGGAAGAGGCCCAGGAGAGAGGCCCCAGGGAAUGGAGGCCACUCAGCAGGCCCUAGCUGGCGGCACAUUCGGGCUGAGGGCCUGGACUGCAGUUACACAGUCCUGUUUGGCAAAGCUGAGGCAGAUGAGAUUUUCCAAGAGUUGGAGAAAGAAGUAGAAUAUUUUACAGGUAUAAAGAUGGCUGUGACCACAUCGGGGAGCACCGAGAUGAUGAAAGAGAACUGGCCCCUGGGAGCCCCAUUGCCUCUGUCUCCUUCGGUGCCUGCAGAGACUUUGUCUUCCGGCAUAAGGAUUCCCGUGGGAAAAGCCCCUCCAGGAGGGUGGCGGUGGUCAGGCUGCCGCUGGCCCACGGGAGCUUACUAAUGAUGAACCACCCGACCAACACGCACUGGUACCACAGUCUUCCCGUGAGAAAGAAGGUUCUGGCUCCACGGGUGAAUCUGACUUUUCGUAAAAUUUUGCUUACUAAAAAAUAAAAACAUUUUUAACAGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-305.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -321.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 191.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((.....((((((((...(((((...(((((.......)))))((.((((.(((.........))))))).))))))).....(((.((..((.(((((((((((((..(.(((((((...(.(((((((...))))))).)...))))))).)..).)))))))))))).)).)).)))....(((((...((((.(.((........)).).))))..)))))..))))))))........((((((.(......).)))))).))).))))...((((((.(..(((((((((....))))))))).....).))))))((((((((........((((((.(((((.((((((((..((((((((((...(((((((((((((((...((.....((((((((((.......(((((((..((((((((((((.(.........).)))).))))))))(((((........)))))(((((((((...))).))))))......((((((((...))))))))..............((((((.(((....))).)))))).((..((((......))))..))......)))...))))))))))).)))))...))))))...)))))..))))((....)).))))))))(((.......)))((((((((((...((((((((...))))).((((((......)))))))))..))))))))))...................))..))))))))..)))))....(((....((((((((..(((....)))..)).)))))).....))).))))))......))))))))(((.((((((......))))))...))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((.....((((((((,,.(((((...((((,,,,{{,.,,||,({,({{{.{{{...,,....)))}))).))))})}.....{,,.||..((,(((((((((({{{..,.{{{||||,,,|,((((((,...|)))))).}...})))))).,.,)}})})))))))}).)),||.}}}.,,,({{{{..,|||{.|.||||.,....}},,.)})).,))))),.))))))))........((((((.(......).)))))).))).))))...{(((((.(..(((((((((....))))))))).....).)))))}((((((((.....,..((((((.(((((.((((((((..((((((((((...((((,{(((((((((..,((...,.((((((((({......{(((((((..((((((((((((.(.{.......).)))),})))))))(((((........)))))(((((((((...))),))))))......((((((({...})))))))....,,........{(((((.(((....))).)))))}.((,,((((......))))..))......}}}...))))))))))).)))}).,,)))))),,,)))))..)))){{....}}.)))))))){{(......,|}}{(((((((((...,{{(((((...))))).((((((,,,...)))))))))..)))))))))).,,.....,}.........))..))))))))..)))))....(((..,,((((((((..(((....)))..))}}))))).},..))).)))))),,....)))))))).,,.{{({{{......}}))))...,,..
Back