Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001206929.2
Sequence Length
1468 nt
GC Content
0.5892
AGACAGAGCCAGGACCCUGGAAGGAAGCAGGAUGGCUGCCGGAACAGCAGUUGGAGCCUGGGUGCUGGUCCUCAGUCUGUGGGGGGCAGUAGUAGGUGCUCAAAACAUCACAGCCCGGAUUGGCGAGCCACUGGUGCUGAAGUGUAAGGGGGCCCCCAAGAAACCACCCCAGCGGCUGGAAUGGAAACUGAACACAGGCCGGACAGAAGCUUGGAAGGUCCUGUCUCCCCAGGGAGGAGGCCCCUGGGACAGUGUGGCUCGUGUCCUUCCCAACGGCUCCCUCUUCCUUCCGGCUGUCGGGAUCCAGGAUGAGGGGAUUUUCCGGUGCCAGGCAAUGAACAGGAAUGGAAAGGAGACCAAGUCCAACUACCGAGUCCGUGUCUACCAGAUUCCUGGGAAGCCAGAAAUUGUAGAUUCUGCCUCUGAACUCACGGCUGGUGUUCCCAAUAAGGUAGUGGAAGAAAGCAGGAGAAGUAGAAAACGGCCCUGUGAACAGGAGGUGGGGACAUGUGUGUCAGAGGGAAGCUACCCUGCAGGGACUCUUAGCUGGCACUUGGAUGGGAAGCCCCUGGUGCCUAAUGAGAAGGGAGUAUCUGUGAAGGAACAGACCAGGAGACACCCUGAGACAGGGCUCUUCACACUGCAGUCGGAGCUAAUGGUGACCCCAGCCCGGGGAGGAGAUCCCCGUCCCACCUUCUCCUGUAGCUUCAGCCCAGGCCUUCCCCGACACCGGGCCUUGCGCACAGCCCCCAUCCAGCCCCGUGUCUGGGAGCCUGUGCCUCUGGAGGAGGUCCAAUUGGUGGUGGAGCCAGAAGGUGGAGCAGUAGCUCCUGGUGGAACCGUAACCCUGACCUGUGAAGUCCCUGCCCAGCCCUCUCCUCAAAUCCACUGGAUGAAGGAUGGUGUGCCCUUGCCCCUUCCCCCCAGCCCUGUGCUGAUCCUCCCUGAGAUAGGGCCUCAGGACCAGGGAACCUACAGCUGUGUGGCCACCCAUUCCAGCCACGGGCCCCAGGAAAGCCGUGCUGUCAGCAUCAGCAUCAUCGAACCAGGCGAGGAGGGGCCAACUGCAGGCUCUGUGGGAGGAUCAGGGCUGGGAACUCUAGCCCUGGCCCUGGGGAUCCUGGGAGGCCUGGGGACAGCCGCCCUGCUCAUUGGGGUCAUCUUGUGGCAAAGGCGGCAACGCCGAGGAGAGGAGAGGAAGGCCCCAGAAAACCAGGAGGAAGAGGAGGAGCGUGCAGAACUGAAUCAGUCGGAGGAACCUGAGGCAGGCGAGAGUAGUACUGGAGGGCCUUGAGGGGCCCACAGACAGAUCCCAUCCAUCAGCUCCCUUUUCUUUUUCCCUUGAACUGUUCUGGCCUCAGACCAACUCUCUCCUGUAUAAUCUCUCUCCUGUAUAACCCCACCUUGCCAAGCUUUCUUCUACAACCAGAGCCCCCCACAAUGAUGAUUAAACACCUGACACAUCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-587.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -613.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 406.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((.((((....(((...(((....((((......))))..)))...))))))).))))..))).))))(((((((((.......(((.(((...((((..((((((((..(((....))))))).))))..))))..))).))).........(((..((((...))))..))).....((((((.(((((((((((.((((((((((((((.((..(((((((.(....))))))))(((((...))).))(((((((((.((((((.............)))))).))))...))))))).)))))))))))).))..((((.......(((.(((...(((.......))).....)))..)))(.((((((..((((.((((....)))).)))))))))).)))))))))...)).))))).)))))).......(((.((((((((((((.((................((((....))))((((((((...((((....(((((((.(((.((((........(((((...((((((.((..((....)))).))))))...)))))))))))).(((((......))))).(((((((....(((.(.(((((..(((((((.....(((((.(...(((((..((((((..((((((.....))))))..(((((((((......((((((.(((((((..((((.(((((.((((..((.((...))...))....)))).))))).)))))))((.((((((...)))))).))..))).).)))))).)))))))))(((....))).)))).)).)))))...)))))).))))))).)))))).))).(((((((((...(((.((.((((((((.((((((.(((..(((((((((((...(((.......(((((((((....((((((((((((....(((...)))...((((.((((....))))..))))....((((((......(((((((((.......))))))..........))).....))))))..))).))))))))))))))))))((((((((.....)))))))))))...)))))....))).)))..))).))).))).)))..))))).))(((((...)))))...((((....))))..)))))))))))).(((((..((((...((((.(((((((((((((........((((...)))).((((....((((((..((.((.....((.(((..((((((....)))))).)))))...))))..)).))))))))))))))))))))))))).....)))))))))...........))))))).....)))))))....)))).))))))))..))..)))))))))))).)))...)))))))))...((((.(((......)))..))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((.(((((((.((((....{({...(({....((((......))))..)))...))))))).)))),.))).)))|(((((((((.......(({,(((...((((..((((((((..(((....))))))).))))..))))..,})}))}}........(((..((((...))))..)))....,((((((.((((((((((,.{(({{{,||{|{|||||,.(((((((.(....}))))))),.{{{,.((({.{{,{((({,{{{..,|,{(((((.((((((({,...,))))}...}))).)))))).,,{(((,{{,|{{.,,..,,.}}.}}},|}}.}}}}}.}}..}}))),,}}.,,|||}|,{.((((((..((((.((((....)))).)))))))))).}.),}))}}...}}.))))).)))))).......(((.((((((((((((.{(....{{.....,}.,|((((....))))((((((((...{{{{,{.{(((((({.,.,...,{(((((,..(((((...((((((.((..((....)))).))))))...))))){((((((.(((({...,,,}}})}.((((......}|||.{.(((((..(((((((.....(((((.(.,.(((((..((((((..((((((.....))))))..{((((((((..,,..((((((.(((((((..((((.(((((.((((..,(.{,...}}...}}....)))).))))).))))))))}.||{{{{,..)))))){|,..,)).).))))))}))))))))|(((....))),)))).)).)))))..,,))))).))))))).))))),,},,.(((((((((....((((.{(((({{((.{(((((.(((..(((((({{,(({(((({,.,..|{(((((((((....{((((((({{{(....|({,..|||,{,,{{||{|||,..,}},,,,},}},.,,((((((......(({((((((.......))))))..........))).....))))))..}}),))))))))))))))))}|{((((((({...,)))))))}))},}})))),....))).)))..))).))},))},|||,{{{...,))}}))))).)))),...((((....))))))))))))).|,||.,{{{,,,{({{...((((,((((((((((((({..{..,..(((..(({({(,...}}..|||}..))}{,,.,....((.(((..((((((....)))))).)))))...}}.,..},.,}.))))})))))))))))))))))..,,,))))))))}},,,...}))))))))))}}...,})))))},)})))}.)))))))).,))..)))))))))))).)))...))))))))),..((((.{{,......}},..))))...
Back