Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001206954.2
Sequence Length
1233 nt
GC Content
0.5734
AGACAGAGCCAGGACCCUGGAAGGAAGCAGGAUGGCUGCCGGAACAGCAGUUGGAGCCUGGGUGCUGGUCCUCAGUCUGUGGGGGGCAGUAGUAGGUGCUCAAAACAUCACAGCCCGGAUUGGCGAGCCACUGGUGCUGAAGUGUAAGGGGGCCCCCAAGAAACCACCCCAGCGGCUGGAAUGGAAACUGAACACAGGCCGGACAGAAGCUUGGAAGGUCCUGUCUCCCCAGGGAGGAGGCCCCUGGGACAGUGUGGCUCGUGUCCUUCCCAACGGCUCCCUCUUCCUUCCGGCUGUCGGGAUCCAGGAUGAGGGGAUUUUCCGGUGCCAGGCAAUGAACAGGAAUGGAAAGGAGACCAAGUCCAACUACCGAGUCCGUGUCUACCAGAUUCCUGGGAAGCCAGAAAUUGUAGAUUCUGCCUCUGAACUCACGGCUGGUGUUCCCAAUAAGGUGGGGACAUGUGUGUCAGAGGGAAGCUACCCUGCAGGGACUCUUAGCUGGCACUUGGAUGGGAAGCCCCUGGUGCCUAAUGAGAAGGGAGUAUCUGUGAAGGAACAGACCAGGAGACACCCUGAGACAGGGCUCUUCACACUGCAGUCGGAGCUAAUGGUGACCCCAGCCCGGGGAGGAGAUCCCCGUCCCACCUUCUCCUGUAGCUUCAGCCCAGGCCUUCCCCGACACCGGGCCUUGCGCACAGCCCCCAUCCAGCCCCGUGUCUGGGAGCCUGUGCCUCUGGAGGAGGUCCAAUUGGUGGUGGAGCCAGAAGGUGGAGCAGUAGCUCCUGGUGGAACCGUAACCCUGACCUGUGAAGUCCCUGCCCAGCCCUCUCCUCAAAUCCACUGGAUGAAGGAUAACCAGGCGAGGAGGGGCCAACUGCAGGUGAGGGGUUUGAUAAAGUCAGGGAAGCAGAAGAUAGCCCCCAACACAUGUGACUGGGGGGAUGGUCAACAAGAAAGGAAUGGAAGGCCCCAGAAAACCAGGAGGAAGAGGAGGAGCGUGCAGAACUGAAUCAGUCGGAGGAACCUGAGGCAGGCGAGAGUAGUACUGGAGGGCCUUGAGGGGCCCACAGACAGAUCCCAUCCAUCAGCUCCCUUUUCUUUUUCCCUUGAACUGUUCUGGCCUCAGACCAACUCUCUCCUGUAUAAUCUCUCUCCUGUAUAACCCCACCUUGCCAAGCUUUCUUCUACAACCAGAGCCCCCCACAAUGAUGAUUAAACACCUGACACAUCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-480.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -500.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((.((((....(((...(((....((((......))))..)))...))))))).))))..))).))))(((((((((.....((((((((....((((..((((((((..(((....))))))).))))..))))..((((((.((((.........(((.((((((((((.(((..(((...(((((((...(((....)))...)).))))).....)))(((((.((((..(((((.((...(((....))))))))))..)))).)))))))))))))))))).)))((((.........))))(((((....(((..(.........)..)))...)))))(((((((((.(((..(((((((.((((((..((((.((((....)))).)))))))))).)(.(((((((.(.(((.....(((((((((......)))))))))))).)))))))).).((......))..)))))).))).))).)))))).))))..)))))))))))))).((((((((((((.(((((......)))))..((((((....(((.(.(((((..(((((((.....(((((.(...(((((..((((((..((((((.....))))))..(((((((((......((((((.(((((((..((((.(((((.((((..((.((...))...))....)))).))))).)))))))((.((((((...)))))).))..))).).)))))).)))))))))(((....))).)))).)).)))))...)))))).))))))).)))))).)))...))))))...((((...))))...((....)).(((((((.((((.....((((((.((((((((..(((.((((((((..((........)).)))........)))))((((((((((((.............((..(((((..((((...((((.(((((((((((((........((((...)))).((((....((((((..((.((.....((.(((..((((((....)))))).)))))...))))..)).))))))))))))))))))))))))).....))))))))))))))))..))))))))))..)))))))).))))))...)))).)))))))..)))))))))).))......)))))))))...((((.(((......)))..))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((.(((((((.((((....{({...(({....((((......))))..)))...))))))).)))),.))).)))|(((((((((..,..((((((((,...((((..((((((((..(((....))))))).))))..))))..{((({{.{{{,.....,,..{((,({{{((({{,.(({..{{{..,{(|(((({{{(({..,{|,}..,)}}|))))}}.{{|||((,(,.,,||}}||||{.,{...|||,.,}))}}|}}}}}..))}|{||||}||||||||}}}}},))),...||||.,|||}|.,{(((({{{,(((,.{........||,.|||...}},,.||{{{|||{.(({..((((((,,((((((..((((.((((....)))).)))))))))}.}{.(((((({,(.(((,....(((((((((......)))))))))))).)))))))).).({......)),.)))))).))),))),)))))).})))..))))))}))})))}.{{((((((((((.(((((......)))))..((((((....(((.(.(((((..(((((((.....(((((.(.,.(((((..((((((..((((((.....))))))..{((((((((..,,..((((((.(((((((..((((.(((((.((((..,(.{,...}}...}}....)))).))))).))))))))}.||{{{{,..)))))){|,..,)).).))))))}))))))))|(((....))),)))).)).)))))..,,))))).))))))).)))))},)))...))))))...((((...))))...{{....}}.(((((((.((((.....((((((.((((((((..(({.{(((((((..((........)),))}........))}})((((((((((((..,..........|,,.{((({.,((((...((((.((((((((((((({,.{,.,..(((..(({({{,..,},..||||..}}}{,,,,....((.(((..((((((....)))))).)))))...}},,..},.,},))))}))))))))))))))))).....)))))))))}.)))))..))))))))))..)))))))).))))))...)))).)))))))..)))))))))).},......))))))))),..((((.{{,......}},..))))...
Back