Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001242.5

Sequence Length

1245 nt

GC Content

0.5928

CUUCAAAGGUUGGCUUGCCACCUGAAGCAGCCACUGCCCAGGGGGUGCAAAGAAGAGACAGCAGCGCCCAGCUUGGAGGUGCUAACUCCAGAGGCCAGCAUCAGCAACUGGGCACAGAAAGGAGCCGCCUGGGCAGGGACCAUGGCACGGCCACAUCCCUGGUGGCUGUGCGUUCUGGGGACCCUGGUGGGGCUCUCAGCUACUCCAGCCCCCAAGAGCUGCCCAGAGAGGCACUACUGGGCUCAGGGAAAGCUGUGCUGCCAGAUGUGUGAGCCAGGAACAUUCCUCGUGAAGGACUGUGACCAGCAUAGAAAGGCUGCUCAGUGUGAUCCUUGCAUACCGGGGGUCUCCUUCUCUCCUGACCACCACACCCGGCCCCACUGUGAGAGCUGUCGGCACUGUAACUCUGGUCUUCUCGUUCGCAACUGCACCAUCACUGCCAAUGCUGAGUGUGCCUGUCGCAAUGGCUGGCAGUGCAGGGACAAGGAGUGCACCGAGUGUGAUCCUCUUCCAAACCCUUCGCUGACCGCUCGGUCGUCUCAGGCCCUGAGCCCACACCCUCAGCCCACCCACUUACCUUAUGUCAGUGAGAUGCUGGAGGCCAGGACAGCUGGGCACAUGCAGACUCUGGCUGACUUCAGGCAGCUGCCUGCCCGGACUCUCUCUACCCACUGGCCACCCCAAAGAUCCCUGUGCAGCUCCGAUUUUAUUCGCAUCCUUGUGAUCUUCUCUGGAAUGUUCCUUGUUUUCACCCUGGCCGGGGCCCUGUUCCUCCAUCAACGAAGGAAAUAUAGAUCAAACAAAGGAGAAAGUCCUGUGGAGCCUGCAGAGCCUUGUCAUUACAGCUGCCCCAGGGAGGAGGAGGGCAGCACCAUCCCCAUCCAGGAGGAUUACCGAAAACCGGAGCCUGCCUGCUCCCCCUGAGCCAGCACCUGCGGGAGCUGCACUACAGCCCUGGCCUCCACCCCCACCCCGCCGACCAUCCAAGGGAGAGUGAGACCUGGCAGCCACAACUGCAGUCCCAUCCUCUUGUCAGGGCCCUUUCCUGUGUACACGUGACAGAGUGCCUUUUCGAGACUGGCAGGGACGAGGACAAAUAUGGAUGAGGUGGAGAGUGGGAAGCAGGAGCCCAGCCAGCUGCGCCUGCGCUGCAGGAGGGCGGGGGCUCUGGUUGUAAAACACACUUCCUGCUGCGAAAGACCCACAUGCUACAAGACGGGCAAAAUAAAGUGACAGAUGACCACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-484.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -502.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 211.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......((((((((.((........))))))..(((((..((((((.(((.(((.((((..(((((((......).))))))...((((((((((((((((......(((((..((..((..(((.((((((((.........((((((((((.......))))))))))(((((((((...((((.(.((((...)))).).)))).)))).)))))))))))).).))).))..(((((((((((....((((((((((((...(((((..((((.((((((...(((((.((....((((((.......((((((..((((....(((.......(((((((((............))))......))))).......).))..)))).)))).))......))))))...)).)))))....(((.......))).......)))))).)))))))))....))))))))))))(((..((((..((((...))))..))))..)))....(((..(.(((((....))))).)..))))))))))))))....))..)))))..((((.((.....)).)))).)))))))).((((((((.(((((((((...((((...(((.(((....))).))))))).))))))).)).))........))))))......((((((...((...))...))))))..(((((....)))))...)))))))).)))).))).))).))))))(((((((((.((((((((.(......).))))...)))).........((((.....))))((((..(((((((.....(((....)))((((.(.(((((.((((..(((((((...((((((.....)).))))..(((.....))).).)))))).))))))))).).))))..)))))))..))))......)))))))))......(((((((((((...(((((((((..........))).((((......)))).(((((..(((((((..(((((.((...((((.........)))))).)))))..)))))..))..)))))...........)))))).))))).).))))).((((((((..(((((((..((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))..........))))))))((.............))........)))))................))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.......((((((({{({.....,..))}}}}.,{((((,,((((((.(((.(((.((((.,,(,(((({{.{{{..|{||||..{(,,,,|||,,||||||..}}}}}||||.,,{,..(({((,.{{((,(((({{{.....((((((((((.......))))))))))(((((((((...((((.(.((((...)))).).)))).))))},))))||||,,,.,.))),....(((((((((((....((((((((((((...(((((..((((.((((((...(((((.((....((((((.,,,,..,(((((..((((,,,,{,{{{{,,..(((((((((............))))......)))))......,},)}}}))}),)))).)),.....))))))...)).)))))....(((.......})}...,),.)))))).)))))))))....))))))))))))(((..((((..((((...))))..))))..)))....(((..{.(((((....))))).}..))))))))))))))....,|{{||,,...((((.((.....)).)))).).,))))).((((((((.(((((((((...((((...(((.(((....))).))))))).))))))).)).))........))))))......,,|,||}}}|},}}))}}},,,},...(((((....))))).,,,,,}}))}.)))).))).))).))))))(((((((((.{(((((((.(......).)))),..}}}}.........((((.....))))((((..(((((((.....(((....)))((((.(.(((((.((((.{(((((((...((((((.....)).))))..(((.....))).),}))))).))))))))).).))))..)))))))..))))}.....)))))))))......(((((((((((...(((((((((..........))).((((......)))).(((((..(((((((..(((((.((.,,{(((....,,,.,)})))).)))))..)))))..))..)))))...........)))))).))))).).))))).((((((((..(((((((..((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))..........)))))))){{,...........,}}........))))).......,|,......,}})...