Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001242886.2

Sequence Length

1835 nt

GC Content

0.4894

AACUGUCACUGUGGAGAGGAGAGAGAGAGGACAGAGAGCAAGUCACUCCCGGCUGCCUUUUUCACCUCUGACAGAGCCCAGACACCAUGAACGCAAGUGAAUUCCGAAGGAGAGGGAAGGAGAUGGUGGAUUACAUGGCCAACUACAUGGAAGGCAUUGAGGGACGCCAGGUCUACCCUGACGUGGAGCCCGGGUACCUGCGGCCGCUGAUCCCUGCCGCUGCCCCUCAGGAGCCAGACACGUUUGAGGACAUCAUCAACGACGUUGAGAAGAUAAUCAUGCCUGGGGCGGCAAGCCCAGCAUGCACAGAGCUGGAGACUGUGAUGAUGGACUGGCUCGGGAAGAUGCUGGAACUACCAAAGGCAUUUUUGAAUGAGAAAGCUGGAGAAGGGGGAGGAGUGAUCCAGGGAAGUGCCAGUGAAGCCACCCUGGUGGCCCUGCUGGCCGCUCGGACCAAAGUGAUCCAUCGGCUGCAGGCAGCGUCCCCAGAGCUCACACAGGCCGCUAUCAUGGAGAAGCUGGUGGCUUACUCAUCCGAUCAGGCACACUCCUCAGUGGAAAGAGCUGGGUUAAUUGGUGGAGUGAAAUUAAAAGCCAUCCCCUCAGAUGGCAACUUCGCCAUGCGUGCGUCUGCCCUGCAGGAAGCCCUGGAGAGAGACAAAGCGGCUGGCCUGAUUCCUUUCUUUAUGGUUGCCACCCUGGGGACCACAACAUGCUGCUCCUUUGACAAUCUCUUAGAAGUCGGUCCUAUCUGCAACAAGGAAGACAUAUGGCUGCACGUUGAUGCAGCCUACGCAGGCAGUGCAUUCAUCUGCCCUGAGUUCCGGCACCUUCUGAAUGGAGUGGAGUUUGCAGAUUCAUUCAACUUUAAUCCCCACAAAUGGCUAUUGGUGAAUUUUGACUGUUCUGCCAUGUGGGUGAAAAAGAGAACAGACUUAACGGGAGCCUUUAGACUGGACCCCACUUACCUGAAGCACAGCCAUCAGGAUUCAGGGCUUAUCACUGACUACCGGCAUUGGCAGAUACCACUGGGCAGAAGAUUUCGCUCUUUGAAAAUGUGGUUUGUAUUUAGGAUGUAUGGAGUCAAAGGACUGCAGGCUUAUAUCCGCAAGCAUGUCCAGCUGUCCCAUGAGUUUGAGUCACUGGUGCGCCAGGAUCCCCGCUUUGAAAUCUGUGUGGAAGUCAUUCUGGGGCUUGUCUGCUUUCGGCUAAAGGGUUCCAACAAAGUGAAUGAAGCUCUUCUGCAAAGAAUAAACAGUGCCAAAAAAAUCCACUUGGUUCCAUGUCACCUCAGGGACAAGUUUGUCCUGCGCUUUGCCAUCUGUUCUCGCACGGUGGAAUCUGCCCAUGUGCAGCGGGCCUGGGAACACAUCAAAGAGCUGGCGGCCGACGUGCUGCGAGCAGAGAGGGAGUAGGAGUGAAGCCAGCUGCAGGAAUCAAAAAUUGAAGAGAGAUAUAUCUGAAAACUGGAAUAAGAAGCAAAUAAAUAUCAUCCUGCCUUCAUGGAACUCAGCUGUCUGUGGCUUCCCAUGUCUUUCUCCAAAGUUAUCCAGAGGGUUGUGAUUUUGUCUGCUUAGUAUCUCAUCAACAAAGAAAUAUUAUUUGCUAAUUAAAAAGUUAAUCUUCAUGGCCAUAGCUUUUAUUCAUUAGCUGUGAUUUUUGUUGAUUAAAACAUUAUAGAUUUUCAUGUUCUUGCAGUCAUCAGAAGUGGUAGGAAAGCCUCACUGAUAUAUUUUCCAGGGCAAUCAAUGUUCACGCAACUUGAAAUUAUAUCUGUGGUCUUCAAAUUGUCUUUUGUCAUGUGGCUAAAUGCCUAAUAAACAAUUCAAGUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-594.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -626.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 460.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((.((((((.((((((.(((((((.....((...(((((((..(((.(((((((...((((...))))((((........((...((((.((....(((((((((((((((((((((((((....((((........))))...(((.(((.(((((((((((.....))))((.(((...))).)).((((((((((.((.((((((.((((.((((((.....((((.......(.((..((((((((.((...((.((........(((((...((((.....)))).))))).......)).))...))))))))))..)).)((((.(((((((((((.....))...)))))))))...))))....))))....))))).).))))...))))))...(((((((..(((((....)))))..)))))))((((........))))...)).))))))))))..)))))))))).)))........))))))))...((((((((...))))).))).....(((((((.((...((((((.......)))))).....(((((((((..........((((((......)))))).))))))))).((.(((((((.(.((.((((....)))).)).)))))...)))))))))))))))))))))))..(((((.(((...))).)))))..........))))))))....)).))).)...))(((((...(((((.((.((.(((.....(((((((......)))))))..((((((....(((..(...(((((((((....((((......((((.(((((((.((((((((((((((((.((((..((((((((..((((...((((........))))....)))))))))).))....(((......)))...((((.(((((((.((((((((((.....((...((((((...(((((((((..(((.(((((.(((((.....(((.(((((......((((((((((((......))))).........((((((.....(((((((((.((((....)))).))....))))))))))))).)))))))))).)).)))......))))).))))).))).))))))......)))...))))))...))......)))))..........)))))))))))).))))...)))))))))))).....)))))))).....................))))))).))))..))))..))))))).)).)..))))))))).....((((((((....))).)))))..)))..)).))))))).))))))))).............(((.(((((......))))).)))))))))).))).))))))).))..((((((((((.((.....(((((((((((((.((((.....)))).....(((((.(((((.(((((...((((((.(((((((..(..(.....(((.......)))...)..)..)))..)))))))))).)))))))))).))))).)))))))(((((((((((....((((..((((((..((((((((.((.....))...))))))))....)))))).)))))))))))))))..............)))))))))))))))))).((((....))))(((....)))(((.((((((.((((.((.((.............))..)).)))).)))))).)))))))))....).)))))).))((..(((.....)))..))......)))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((((.(((((({({{{(({(((((((,,.{.({...{({|||{..{||,||||||||.,||||{{{{{{{({(((,{,,{,{{,,,.{,,||{..,{{({,,{{{({((({{(({((((((((....((((........))))...(((.(((.(((((((((((.....))))((.(((...))).)).((((((((((.,,.((((((.((((.((((((.....((((.,.....{.((..((((((({,({...((.((........(((({,{{(({(.....))))}))))).......)).))...})))))))))..)).}((({.(((((((((((.....)),..}))))))))...})))...,))))....))))).).))))...)))))){(((((((({..(((((....)))))..})))))}|})}.(({.{,...}).})),.))))))))))..)))))))))).)))......,,||||||}|...{{{{{({|,,,))))).|}}.,,,{{((((((.{,..,({((((.......)))))).....(((((((((..........((((((......)))))).))))))))).((,({,((((.(.((.((((....)))).)).}))))...))}||}})))))}}}}}}}))}},.{((((.(({...})).))))}.......{|{||||||||,,..{{{,,.,},.|||(((((...((((,.{{.((.{||.....(((((((......)))))))..(((((({{{.({{..{...||(((((((....((((......((((.(((((((.{((((((((((((((,,((((..((((((({..((((...((((.,....,.))))....)))))))))).))....{,{......}}}...{(((,((((((({(,((,(((((....,({...((((((...(((((((((..(((.(((((.(((((.,..,({{,(({{(,,,...((((((({{{{{...,..}}}}}.........((((((.....(((((((((.((((....)))).))....))))))))))))).)))))))}))})),)}).,,...))))).))))).))).))))))......)))...)))))),,.))......)))))}}.}}},||,}}})))}})))),))))...}))))))))))).....)))))))}..........,..........))))))).))))..))))..))))))).|}.}..))))))))).....((((((((....})).)))))..,}}.,)).))))))).)))))|}}}......,,...,.(((.(((((......))))).))),}})))),))),)))))}}.}}}.(((((((((({{{,...,{{{,{{(((((((.{{{,....,|}},.....(((((.(((((.(((((...((((((.(((({{{.,{..,...{{((,...}}}}},}...,..,..)))..)))))))))).)))))))))).))))).)))))))(((((((((({...,((((..((((((.,((((((((.,(,....))...))))))))....)))))).)))))))))))))))............,.})))}}}))))))))))).,{{{...,}|||{{{...,))}{{|.((((((.((((.((,((.............))..)).)))).)))))).)))))))))....),)))))),)),{..(((.....)))..},......,})})))))..