Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001243342.2
Sequence Length
3543 nt
GC Content
0.5676
AGCGUCGCCUAGCAACGGGAAAUGGCGGAACCGGGCGGCGCGGCGGGCCGGUCCCAUCCGGAAGAUGGAUCGGCUUCUGAGGGAGAGAAGGAAGGGAAUAAUGAAAGCCACAUGGUGUCACCACCAGAGAAGGAUGAUGGCCAGAAAGGUGAAGAAGCUGUCGGUAGCACAGAGCAUCCUGAGGAAGUCACAACCCAAGCGGAAGCUGCAAUUGAAGAGGGGGAGGUGGAGACAGAAGGGGAAGCAGCAGUGGAAGGGGAAGAGGAGGCUGUGUCCUAUGGAGAUGCUGAAAGCGAAGAGGAAUAUUACUAUACAGAAACUUCAUCCCCGGAAGGGCAAAUCAGUGCUGCAGAUACGACUUACCCGUAUUUCAGUCCUCCUCAGGAACUGCCUGGAGAGGAGGCAUACGAUAGUGUUAGCGGGGAGGCUGGUCUCCAAGGCUUCCAGCAAGAGGCCACCGGUCCACCAGAAUCCAGAGAAAGGAGGGUCACCUCCCCAGAGCCAUCCCACGGAGUCUUAGGCCCGUCGGAGCAAAUGGGCCAGGUCACCUCUGGGCCAGCAGUGGGCAGAUUGACAGGAUCCACAGAGGAGCCCCAGGGGCAGGUGCUCCCAAUGGGCGUCCAGCACCGCUUCCGGCUGAGCCACGGGAGCGACAUCGAGUCCUCAGACCUGGAGGAGUUCGUCUCGCAGGAGCCAGUGAUCCCCCCAGGGGUGCCCGAUGCCCACCCCAGGGAAGGAGACCUGCCAGUGUUCCAGGACCAGAUCCAGCAGCCCAGCACCGAGGAGGGGGCCAUGGCAGAGAGAGUGGAGUCCGAGGGGAGUGACGAGGAAGCAGAAGACGAAGGGUCCCAGCUGGUGGUUUUGGACCCAGACCACCCCCUGAUGGUAAGAUUCCAGGCUGCCCUGAAGAACUACCUGAACCGACAGAUCGAAAAGUUGAAGCUGGACCUCCAAGAGCUGGUUGUGGCUACCAAGCAGAGCCGAGCCCAGCGGCAGGAGCUGGGGGUGAAUCUCUAUGAGGUGCAGCAGCACCUGGUACACCUGCAGAAGCUGCUGGAGAAGAGUCACGACCGCCACGCAAUGGCCUCGAGCGAGCGCAGGCAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCCGCCCGCGCUCUCUACACCAAGACCUGCGCAGCCGCCAACGAGGAGCGCAAAAAGUUGGCGGCUCUGCAGACUGAGAUGGAGAACUUGGCCCUGCAUCUCUUCUACAUGCAGAACAUCGACCAGGACAUGCGUGACGACAUCCGCGUGAUGACACAAGUGGUAAAGAAGGCCGAGACGGAGAGGAUCCGGGCAGAAAUCGAGAAGAAAAAGCAGGACCUGUAUGUGGACCAGCUCACCACUCGAGCCCAGCAACUGGAAGAAGACAUUGCCCUGUUUGAGGCUCAGUACUUGGCCCAAGCUGAGGACACCCGGAUUUUAAGGAAAGCAGUGAGUGAGGCCUGCACCGAGAUCGACGCCAUCAGCGUGGAGAAGAGGCGCAUCAUGCAGCAAUGGGCCAGCAGCCUGGUGGGCAUGAAGCACCGCGACGAGGCGCACAGGGCGGUGCUGGAGGCGCUCAGAGGAUGCCAGCAUCAAGCCAAAUCCACCGACGGCGAGAUUGAGGCCUAUAAGAAAUCCAUCAUGAAGGAGGAAGAAAAGAACGAGAAGCUGGCGAGCAUCCUGAACCGGACAGAGACGGAAGCCACACUGCUGCAGAAGCUCACCACCCAGUGCCUGACCAAGCAGGUGGCCCUGCAGAGCCAGUUCAAUACCUACAGGCUCACCCUGCAGGACACAGAGGAUGCCCUCAGCCAGGACCAGCUGGAACAAAUGAUACUCACGGAGGAGUUGCAGGCCAUCCGCCAAGCCAUCCAGGGCGAGCUGGAGCUCAGGAGGAAGACGGAUGCUGCCAUCCGGGAGAAGCUGCAGGAGCACAUGACCUCCAACAAGACCACCAAAUACUUCAACCAGCUCAUCCUGAGGCUGCAGAAGGAGAAGACCAACAUGAUGACACAUCUUUCCAAAAUCAACGGUGACAUUGCCCAGACCACCCUGGACAUCACACACACCAGCAGCAGGCUGGACGCACACCAGAAGACCCUGGUGGAGCUGGACCAGGACGUGAAGAAAGUCAACGAGCUCAUCACCAACAGCCAGAGCGAGAUCUCCCGGCGCACGAUCCUGAUCGAGAGGAAGCAAGGGCUCAUCAACUUCCUCAACAAGCAGCUGGAGCGGAUGGUCUCCGAGCUGGGGGGGGAAGAAGUGGGGCCCCUGGAGCUUGAAAUCAAAAGGCUGAGCAAGCUGAUCGACGAGCACGAUGGCAAGGCGGUCCAGGCCCAGGUGACCUGGCUGCGCCUGCAGCAGGAGAUGGUCAAGGUGACACAGGAGCAGGAGGAGCAGCUGGCCUCCCUGGACGCAUCCAAGAAGGAGCUCCACAUCAUGGAGCAGAAGAAACUACGAGUAGAAAGCAAGAUUGAGCAGGAGAAGAAGGAGCAGAAGGAGAUCGAGCACCACAUGAAGGACCUGGACAACGACCUGAAGAAGCUCAACAUGUUGAUGAAUAAAAACCGGUGCAGCUCGGAGGAGCUGGAGCAGAACAACCGGGUGACAGAGAAUGAGUUCGUGCGCUCGCUGAAGGCCUCUGAGAGGGAGACCAUCAAGAUGCAGGACAAGCUGAACCAGCUCAGCGAGGAGAAGGCGACCCUCCUGAAUCAACUGGUGGAAGCAGAACACCAGAUUAUGCUUUGGGAGAAAAAAAUCCAACUGGCAAAAGAGAUGCGUUCCUCAGUGGAUUCCGAGAUCGGCCAGACGGAGAUCCGGGCCAUGAAGGGCGAGAUCCACAGGAUGAAGAAAUAUUGCAGAACAACACAGGACGCACACAGGCACGUGCACGAACAACACGGGACGCACGCAGGCACGUGCACGAAGAACACGGGACGCGCGCAGGCACGUGCACGAACAACACGGGACGCGCGCGGGCACGUGCACGAACAACACGGGACGCGCGCAGGCACGUGCACGAACAACACGGGACGCGCGCAGGCACGUGCACGAACAAGGGACGCGCGCAGGCACGUGCACGAACACAGGACACACACAGCACGUGCAUGAACAACACAGGACACACACAGCACGUGCAUGAACAACACAGGACACACACAAGCACGUGCAUGAACAACACAGGACACACACAAGCACGUGCAUGUCAUCUCACAAAACGCUGUUUUAUUCCUACUCCAUGUAAUCACAGCACGCUGGUAUUUUUAAAUGCCGGUUGUAACCCUCAAACUUUGUGACCCUCUAACGUAUCCCACUGUGAGACAGUCUCACACCACAGAAGGGCUCAGAGAGCACCCCCAUCUCAUCCUUCACAGCCGCGUUGUCUCUCCAUGGUCACAAUUAGAUUUCAUUGCCUUUAAAAGGCUGGUAAUUAAAUUGCAAGUGGUCAUCAAGCUAAAGGUUCAGGGCCUUAAGGAUAACAGUAAGAGCAGUUCAUAAAAUAAAUGGGCCUCACUUUCACCAUGCCAUGCUAAAUAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1248.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1307.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 798.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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