Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001252204.2
Sequence Length
5289 nt
GC Content
0.5816
AGAAGGUAGCAGACAGACAGACGGAUCUAACCUCUCUUGGAUCCUCCAGCCAUGAGGCUGCUCUGGGGGCUGAUCUGGGCAUCCAGCUUCUUCACCUUAUCUCUGCAGAAGCCCAGGUUGCUCUUGUUCUCUCCUUCUGUGGUUCAUCUGGGGGUCCCCCUAUCGGUGGGGGUGCAGCUCCAGGAUGUGCCCCGAGGACAGGUAGUGAAAGGAUCAGUGUUCCUGAGAAACCCAUCUCGUAAUAAUGUCCCCUGCUCCCCAAAGGUGGACUUCACCCUUAGCUCAGAAAGAGACUUCGCACUCCUCAGUCUCCAGGUGCCCUUGAAAGAUGCGAAGAGCUGUGGCCUCCAUCAACUCCUCAGAGGCCCUGAGGUCCAGCUGGUGGCCCAUUCGCCAUGGCUAAAGGACUCUCUGUCCAGAACGACAAACAUCCAGGGUAUCAACCUGCUCUUCUCCUCUCGCCGGGGGCACCUCUUUUUGCAGACGGACCAGCCCAUUUACAACCCUGGCCAGCGGGUUCGGUACCGGGUCUUUGCUCUGGAUCAGAAGAUGCGCCCGAGCACUGACACCAUCACAGUCAUGGUGGAGAACUCUCACGGCCUCCGCGUGCGGAAGAAGGAGGUGUACAUGCCCUCGUCCAUCUUCCAGGAUGACUUUGUGAUCCCAGACAUCUCAGAGCCAGGGACCUGGAAGAUCUCAGCCCGAUUCUCAGAUGGCCUGGAAUCCAACAGCAGCACCCAGUUUGAGGUGAAGAAAUAUGUCCUUCCCAACUUUGAGGUGAAGAUCACCCCUGGAAAGCCCUACAUCCUGACGGUGCCAGGCCAUCUUGAUGAAAUGCAGUUAGACAUCCAGGCCAGGUACAUCUAUGGGAAGCCAGUGCAGGGGGUGGCAUAUGUGCGCUUUGGGCUCCUAGAUGAGGAUGGUAAGAAGACUUUCUUUCGGGGGCUGGAGAGUCAGACCAAGCUGGUGAAUGGACAGAGCCACAUUUCCCUCUCAAAGGCAGAGUUCCAGGACGCCCUGGAGAAGCUGAAUAUGGGCAUUACUGACCUCCAGGGGCUGCGCCUCUACGUUGCUGCAGCCAUCAUUGAGUCUCCAGGUGGGGAGAUGGAGGAGGCAGAGCUCACAUCCUGGUAUUUUGUGUCAUCUCCCUUCUCCUUGGAUCUUAGCAAGACCAAGCGACACCUUGUGCCUGGGGCCCCCUUCCUGCUGCAGGCCUUGGUCCGUGAGAUGUCAGGCUCCCCAGCUUCUGGCAUUCCUGUCAAAGUUUCUGCCACGGUGUCUUCUCCUGGGUCUGUUCCUGAAGUCCAGGACAUUCAGCAAAACACAGACGGGAGCGGCCAAGUCAGCAUUCCAAUAAUUAUCCCUCAGACCAUCUCAGAGCUGCAGCUCUCAGUAUCUGCAGGCUCCCCACAUCCAGCGAUAGCCAGGCUCACUGUGGCAGCCCCACCUUCAGGAGGCCCCGGGUUUCUGUCUAUUGAGCGGCCGGAUUCUCGACCUCCUCGUGUUGGGGACACUCUGAACCUGAACUUGCGAGCCGUGGGCAGUGGGGCCACCUUUUCUCAUUACUACUACAUGAUCCUAUCCCGAGGGCAGAUCGUGUUCAUGAAUCGAGAGCCCAAGAGGACCCUGACCUCGGUCUCGGUGUUUGUGGACCAUCACCUGGCACCCUCCUUCUACUUUGUGGCCUUCUACUACCAUGGAGACCACCCAGUGGCCAACUCCCUGCGAGUGGAUGUCCAGGCUGGGGCCUGCGAGGGCAAGCUGGAGCUCAGCGUGGACGGUGCCAAGCAGUACCGGAACGGGGAGUCCGUGAAGCUCCACUUAGAAACCGACUCCCUAGCCCUGGUGGCGCUGGGAGCCUUGGACACAGCUCUGUAUGCUGCAGGCAGCAAGUCCCACAAGCCCCUCAACAUGGGCAAGGUCUUUGAAGCUAUGAACAGCUAUGACCUCGGCUGUGGUCCUGGGGGUGGGGACAGUGCCCUUCAGGUGUUCCAGGCAGCGGGCCUGGCCUUUUCUGAUGGAGACCAGUGGACCUUAUCCAGAAAGAGACUAAGCUGUCCCAAGGAGAAGACAACCCGGAAAAAGAGAAACGUGAACUUCCAAAAGGCGAUUAAUGAGAAAUUGGGUCAGUAUGCUUCCCCGACAGCCAAGCGCUGCUGCCAGGAUGGGGUGACACGUCUGCCCAUGAUGCGUUCCUGCGAGCAGCGGGCAGCCCGCGUGCAGCAGCCGGACUGCCGGGAGCCCUUCCUGUCCUGCUGCCAAUUUGCUGAGAGUCUGCGCAAGAAGAGCAGGGACAAGGGCCAGGCGGGCCUCCAACGAGCCCUGGAGAUCCUGCAGGAGGAGGACCUGAUUGAUGAGGAUGACAUUCCCGUGCGCAGCUUCUUCCCAGAGAACUGGCUCUGGAGAGUGGAAACAGUGGACCGCUUUCAAAUAUUGACACUGUGGCUCCCCGACUCUCUGACCACGUGGGAGAUCCAUGGCCUGAGCCUGUCCAAAACCAAAGGCCUAUGUGUGGCCACCCCAGUCCAGCUCCGGGUGUUCCGCGAGUUCCACCUGCACCUCCGCCUGCCCAUGUCUGUCCGCCGCUUUGAGCAGCUGGAGCUGCGGCCUGUCCUCUAUAACUACCUGGAUAAAAACCUGACUGUGAGCGUCCACGUGUCCCCAGUGGAGGGGCUGUGCCUGGCUGGGGGCGGAGGGCUGGCCCAGCAGGUGCUGGUGCCUGCGGGCUCUGCCCGGCCUGUUGCCUUCUCUGUGGUGCCCACGGCAGCCGCCGCUGUGUCUCUGAAGGUGGUGGCUCGAGGGUCCUUCGAAUUCCCUGUGGGAGAUGCGGUGUCCAAGGUUCUGCAGAUUGAGAAGGAAGGGGCCAUCCAUAGAGAGGAGCUGGUCUAUGAACUCAACCCCUUGGACCACCGAGGCCGGACCUUGGAAAUACCUGGCAACUCUGAUCCCAAUAUGAUCCCUGAUGGGGACUUUAACAGCUACGUCAGGGUUACAGCCUCAGAUCCAUUGGACACUUUAGGCUCUGAGGGGGCCUUGUCACCAGGAGGCGUGGCCUCCCUCUUGAGGCUUCCUCGAGGCUGUGGGGAGCAAACCAUGAUCUACUUGGCUCCGACACUGGCUGCUUCCCGCUACCUGGACAAGACAGAGCAGUGGAGCACACUGCCUCCCGAGACCAAGGACCACGCCGUGGAUCUGAUCCAGAAAGGCUACAUGCGGAUCCAGCAGUUUCGGAAGGCGGAUGGUUCCUAUGCGGCUUGGUUGUCACGGGACAGCAGCACCUGGCUCACAGCCUUUGUGUUGAAGGUCCUGAGUUUGGCCCAGGAGCAGGUAGGAGGCUCGCCUGAGAAACUGCAGGAGACAUCUAACUGGCUUCUGUCCCAGCAGCAGGCUGACGGCUCGUUCCAGGACCCCUGUCCAGUGUUAGACAGGAGCAUGCAGGGGGGUUUGGUGGGCAAUGAUGAGACUGUGGCACUCACAGCCUUUGUGACCAUCGCCCUUCAUCAUGGGCUGGCCGUCUUCCAGGAUGAGGGUGCAGAGCCAUUGAAGCAGAGAGUGGAAGCCUCCAUCUCAAAGGCAAACUCAUUUUUGGGGGAGAAAGCAAGUGCUGGGCUCCUGGGUGCCCACGCAGCUGCCAUCACGGCCUAUGCCCUGACACUGACCAAGGCGCCUGUGGACCUGCUCGGUGUUGCCCACAACAACCUCAUGGCAAUGGCCCAGGAGACUGGAGAUAACCUGUACUGGGGCUCAGUCACUGGUUCUCAGAGCAAUGCCGUGUCGCCCACCCCGGCUCCUCGCAACCCAUCCGACCCCAUGCCCCAGGCCCCAGCCCUGUGGAUUGAAACCACAGCCUACGCCCUGCUGCACCUCCUGCUUCACGAGGGCAAAGCAGAGAUGGCAGACCAGGCUUCGGCCUGGCUCACCCGUCAGGGCAGCUUCCAAGGGGGAUUCCGCAGUACCCAAGACACGGUGAUUGCCCUGGAUGCCCUGUCUGCCUACUGGAUUGCCUCCCACACCACUGAGGAGAGGGGUCUCAAUGUGACUCUCAGCUCCACAGGCCGGAAUGGGUUCAAGUCCCACGCGCUGCAGCUGAACAACCGCCAGAUUCGCGGCCUGGAGGAGGAGCUGCAGUUUUCCUUGGGCAGCAAGAUCAAUGUGAAGGUGGGAGGAAACAGCAAAGGAACCCUGAAGGUCCUUCGUACCUACAAUGUCCUGGACAUGAAGAACACGACCUGCCAGGACCUACAGAUAGAAGUGACAGUCAAAGGCCACGUCGAGUACACGAUGGAAGCAAACGAGGACUAUGAGGACUAUGAGUACGAUGAGCUUCCAGCCAAGGAUGACCCAGAUGCCCCUCUGCAGCCCGUGACACCCCUGCAGCUGUUUGAGGGUCGGAGGAACCGCCGCAGGAGGGAGGCGCCCAAGCUGACCUCCCUCUCUGACCGUUACGUGAGUCACUUUGAGACCGAGGGGCCCCACGUCCUGCUGUAUUUUGACUCGGUCCCCACCUCCCGGGAGUGCGUGGGCUUUGAGGCUGUGCAGGAAGUGCCGGUGGGGCUGGUGCAGCCGGCCAGCGCAACCCUGUACGACUACUACAACCCCGAGCGCAGAUGUUCUGUGUUUUACGGGGCACCAAGUAAGAGCAGACUCUUGGCCACCUUGUGUUCUGCUGAAGUCUGCCAGUGUGCUGAGGGGAAGUGCCCUCGCCAGCGUCGCGCCCUGGAGCGGGGUCUGCAGGACGAGGAUGGCUACAGGAUGAAGUUUGCCUGCUACUACCCCCGUGUGGAGUACGGCUUCCAGGUUAAGGUUCUCCGAGAAGACAGCAGAGCUGCUUUCCGCCUCUUUGAGACCAAGAUCACCCAAGUCCUGCACUUCACCAAGGAUGUCAAGGCCGCUGCUAAUCAGAUGCGCAACUUCCUGGUUCGAGCCUCCUGCCGCCUUCGCUUGGAACCUGGGAAAGAAUAUUUGAUCAUGGGUCUGGAUGGGGCCACCUAUGACCUCGA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2117.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2208.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 1673.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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