Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001256030.2
Sequence Length
1486 nt
GC Content
0.5074
CUUUUUCUAGCCAGGCUCUCAACUGUCUCCUGCGUUGCUGGGAAGUUCUGGAAGGAAGCAUGUGCUCCAGAGGUUGGGAUUCGUGUCUGGCUCUGGAAUUGCUACUGCUGCCUCUGUCACUCCUGGUGACCAGCAUUCAAGGUCACUUGGUACAUAUGACCGUGGUCUCCGGCAGCAACGUGACUCUGAACAUCUCUGAGAGCCUGCCUGAGAACUACAAACAACUAACCUGGUUUUAUACUUUCGACCAGAAGAUUGUAGAAUGGGAUUCCAGAAAAUCUAAGUACUUUGAAUCCAAAUUUAAAGGCAGGGUCAGACUUGAUCCUCAGAGUGGCGCACUGUACAUCUCUAAGGUCCAGAAAGAGGACAACAGCACCUACAUCAUGAGGGUGUUGAAAAAGACUGGGAAUGAGCAAGAAUGGAAGAUCAAGCUGCAAGUGCUUGACCCUGUACCCAAGCCUGUCAUCAAAAUUGAGAAGAUAGAAGACAUGGAUGACAACUGUUAUCUGAAACUGUCAUGUGUGAUACCUGGCGAGUCUGUAAACUACACCUGGUAUGGGGACAAAAGGCCCUUCCCAAAGGAGCUCCAGAACAGUGUGCUUGAAACCACCCUUAUGCCACAUAAUUACUCCAGGUGUUAUACUUGCCAAGUCAGCAAUUCUGUGAGCAGCAAGAAUGGCACGGUCUGCCUCAGUCCACCCUGUACCCUGGGUAAGAAGGAUCCCUGGGAGCUGAGGGGGGCACAGGGUAACUGGAGUUGUUUUGAACAAAGAAAGGCUGGGGGUCCUAUUCAGCCUCCUUGCACAGUGUGGUGGUGAAUCCCUAAGGUGUCUGGGAGAGCUGGGAGACGUGGGUUCUGCCACCAGCUCUACCACCACCUCCCAGCCAGCUUACCUCAACUUCGUGGGGGCUCAGUGUUCUCACCUGCAAAGGACGUUUGGGAGAGAUCUCUGAUACUCCUCUUCCCUCUCCCGCUCUAACAAAGCAUAGUCCUAACAUCUGAGGCCAGGGUCAUCAUAGAGUAGACUGAAACAUCAGGGUGAGCAGGGAGAAGGAAGGGCAAGUGGGCGAGCAGCUGUCUAGAGGGGCUUCAUUAGACAGCCGAAGUCAGCCAAGGAAAGAGGGACCGAGGUCAUUAGACCGCCAAAGUCAGCCAGGGAAAGAGGGACUGAGGAGACGGGCCUGAGAGAGGCCGUCGAGGAGGCGUGAGAGCCUGAGCCUCAGGCGAAGCUUCUCCUCCCCAGCCUGAUGUUCCUAGAUGAACUUAGGAAGCCAGAUUCCCCUGUCUCCUGGGAGGAUCCACUCAUGAGUGUCACACCUGGCUCUAGAUCAGGCCUACACUGGUGCUAGCAUGGGACAGCUAAGGCCAUGGGUUUUAGAGUCAGUCAUACCUGGGGUCACUUCUAGGACUGUCACUUACUAGCUAAACAAGUUACUUAGCUUCCCCAAGUCAUGUUCUUCCUAAAUAAAGGACAAAAUAACAGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-511.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -539.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((.(.((...............)).).)))))))(((((((((((......((.(((((((((((((((...((((((..((((((((((((((..(((((((...(((((.((.(((((((.........))))))).))...........)))).)...))))))).(((.(((((((..((((((((...(((((((..(((((((((....((...((((((..(....)..)))))).)).))))))....((((((.(((............)))))))))...)))..))))))).)))))...)))..))))))).))).................((((.......))))..((((((((.((...)).)))))))).....((((((.((...(((.(..((......))..))))....(((((..........)))))(((((.((........)).)))))..((((((((((((....))))))))....))))..(((((((((((((.(.((((.((.((((....)))).)).))))....(((((((....)))).)))........(((.((.(((........))).))))).......).))))))))))))))).)).)))))))))))))).)))).........))))))((((.(((((((((.(.((...((((((.(.....((.(((((.((((.(((((..(((.(((.....)))..(((......))).......(((((((((.........((......)).....(((((((((..((((..........))))(((((((......(((......)))))))))))))))))))))))))))).)))..))))).))))((((((((.....))))))))......((((.((.(.((((....)))).).))))))(((((.((((((((((..................((.(((((......((((...........))))......))))))))))).)))))).)))))........(((((...(((((((((.((....)).))))))))).....)).)))........)))))))..((((....)))).........).))))))..)).)))))))))))))).(((((.....)))))...(((((((.((....((((((...))))))...)).)))))))))))))))(((.(((((((..((.....((((......))))....))..))))))).)))((((....))))......(((((((((((....(((((...((((..((((........))))..))))))))))))))))))))......))))))))))))))))))))...((((...((((((.........)))))).....))))..(((((((........)))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,{{{((({((({.,.,....|,,,|||}|,}.}||||||{((((((((((,.,,,..{,((((((((((((((({{,(,{(|{|.{(((|(((((((({,,{((((((..,(((((,,,.|||||{{.........|||||)},|},,||..||||,||||,|.,.}||||},.(((.(((((((..(((((({{,..(((((((..{{,{{{{{{....((...((((((..{....}..)))))).)).))))}}....((((({,(({............}}}))))))...}))..))))))).)))))...)))..))))))).)))..,|,,.....,,...,((((.......))))..((((((((.({...}).)))))))).....{{{{{{,,,...{{..,..,{{..,.||{{{{,......}))))),,,},}.,,},.,,(((((.((........)).)))))..{{{{{(((((((....)))))))}....}))),,||||{((((((((.({((,{.{{.|||{}.,,|})}|}|{||}}....{({((({....}))).))),,,.....(((,((.{{{........))).))))),,.....}.)))))))))))))||||},,)}}}))))))))).)))).})}.},}}}}}}},((((.(((((((((.(.((...((((((.{.....((.(((((.((((.(((((..(((.(((.....)))..,(({{,...})),,.....(((((((((....,,,{,{({.{{..||...,,{{||{||||,,||||..,,,,,..,||}|(((((((..{.,,{{{...,..)},)))))))),)))})))))))))))).)))..))))).))))((((((((.....)))))))),,,,..{{{{.{{.{.((((....)))).).}))))|(((((.((((((((((...,......,,{{,.,.,{.((((({{{...,|||.}},..,,,},))))}.....}}}},..)))).)))))).)))))}},...,,((({,.{.(((((((((.({....}).))))))))).,..,)}.)))........))))))),.((((....)))).,.......}.))))))..)).)))))))))))))).(((((.....))))),,|(((((((|||....|||||,.}.})}))),..)),)))}})}))))))))(({,{((((((..({.{||,(({{....{,||||.,.}}}..}})))})})))({({....}}}}......((((((((((({{{(((((...{(({(.{({,,.,},.,)}),,,}}))),)))}}))))))))))).....,)))))))),)))))))))}}|,.{{{,...(((({{...,,,,..}})))),,,..}})}..{((((((........))))))}...........
Back