Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001256709.2

Sequence Length

1585 nt

GC Content

0.3470

GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAGUUUCGGCAAGCAGCCAGGUCUGGAAACUGUAACAGGACAUUCAGUUAGUAAUGAUGGUUGCAGGUUGAAUAGUCUCGCCCUAGAUCUCACCUAACUUGCAGUAAGUAUCAAGUGCUUGUGUGCCGAUUAAAGAACAACUUCGGAUACAAUGGGAGGUGUCAAGGAAACGAAUAUUUUAAAAAUGACUACACCAAACAAGACACCUCCUGGUGCUGACCCCAAGCAGUUGGAAAGGACUGGAACAGUACGGGAAAUUGGGUCACAAGCUGUUUGGUCACUCUCAUCUUGCAAACCAGGAUUUGGAGUGGAUCAGUUACGAGAUGACAAUCUAGAAACUUAUUGGCAAUCAGAUGGUUCCCAGCCUCAUUUAGUGAACAUCCAAUUCAGAAGAAAAACAACAGUGAAGACAUUAUGUAUUUAUGCAGACUACAAAUCUGAUGAAAGCUAUACUCCAAGCAAGAUCUCAGUCAGAGUAGGAAAUAAUUUUCACAACCUUCAAGAAAUUCGGCAACUUGAGUUGGUGGAACCAAGUGGCUGGAUUCAUGUUCCCUUAACUGACAAUCAUAAGAAGCCAACUCGUACAUUCAUGAUACAGAUUGCUGUUCUAGCCAAUCACCAGAAUGGAAGAGACACCCAUAUGAGACAAAUUAAAAUAUACACACCAGUAGAAGAGAGCUCCAUUGGUAAAUUUCCUAGAUGUACAACUAUAGAUUUCAUGAUGUAUCGUUCAAUAAGGUGACUUUAAAAUGAGACGAAAAUCAUUAAACGUAUCUUUGUUUUAUCCUGUAUUUAAAUAAUAUAUCAUGUACCUUUAUUGAACAAGGCAUCCGUUAUAUCUAAUUUUGUAUAUGUUUAAAAAUAUUUUAUUGUAACUUUGACAAAUAAAUUUGGGGUCAUAUUAUCUUUAUUUUCUUUAACAUGUAAUAAAGCUCACAUAUUUUACAUUACUAAAAAUGGAUUUGAAGCCAAUCAUUUUAUUUUCCCUUGUAUCAAAAGAAAAGAGUUCCUUGUAUCAAAAGAAAAGAGUUGAACUGAAAAUUUCAGUAUAUACACAAUUAUAAUAGCUAGGUGAUUAUUUCAUUAGUGUUCAUACAUUAGAGUAAUGGUUUAUUGCAUAUUUGAGAACAAGACUGUGUUUUAUCAAUAUAUAUCAUCUUUAAUAGGUCAAAAUUACUAUUUUUUCUACCCAGAGGAAGGUUAUUCUUUUAAUACUGGAUCUUUUAAAAAACAGUGUCAAAUAAGCUUAGUGUUAGGUUGUCUGAUGAGAACCAAUCUAAUAUGGGGAGUAUAAUUAAUUGUCUCAUAUUCACCUUCACGGAAUACUUACAGCCCUAGGGUUGUCUGUAUCCUAAUGAUAUUAUGUAAAGAUUGCCUGUAUAAUCUAGCAGUACUUAUGGAAGAGUUCUAGCAGUACUUAUGGAAGAGUUAUUUUCAAAUUUGUGUCUGACAUUGUAGCAUUCCCUGGGCAGUCAUAUAUCCCAUAAAAUCGUAAAAGUAUGUGAAAUUUUUUAUAUAUAUUAAAAGAUUUUAAAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-362.45 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -396.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 408.90

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((((((...))))))(((((.(((((((((((.......)))))))..(((((((........(((((............)))))........)))))))((((.((...((((......)))).)))))).)))).)))))(((((...)))))(((((.((((.............)))))))))..((((((((((......................................)))))))))))))).((((((((((...(((..((((.(((((((((((.(((((..((((((.((.((((((((((((((((.((((((.....))))))..))))))....((((.(.((((....)))).).))))..((((.((((....)))).))))..((((...)))).((.(((((((((..............(((((......((((....))))..((((...((((((((..(((........)))......))).)))))))))((((....)))).....)))))..............)))))))))))..))))))))))))))))))..)))))....(((...(((((..(((.............)))))))).)))..)))))))))))(((.((....)).)))..................((((..((((((((....((((((.((.......)).))))))...........((((((((...(((((.....(((((...(((((((((((((........((((((((((................))))))))))..((((((.....)))))).....)))).)))))))))...)))))......)))))...))))))))........))))))))))))..))))..))).....)))))))))).....((((((...(((((((.((((((.(((..(((((((((((.............(((((.(((.(.((((....((((.((((((......(((((((.....((((((........((((((((.....((((((...))))))..................((.....(((((((.(.(((((((....))))))).).)))))))....))(((((((((((((......)))))..)))).))))...((((.....))))...........)))))))).....)))))).....))))))).((((((..............))))))............((((((((((((((....)))..))))))))))))))))).))))...)))).)))).))))).......(((.(((..((((((....))))))..))))))..(((((.(((((....((((((((............((((((..(((((...)))))..))))))...((((..(((((..(((.((....)).)))....))))).))))..))))))))........))))).))))).)))))))))))..))).))))))...)).)))))...))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,,..(((({{{|||,..}|||||((((({,((((((((((.......)))))))..(((((((.,,{{{,.,{(((...,.,..,.,,}}}}}..,,.,..}}))))){(({{((...{{{{......)))),)}}}}}.}}}},}}}}}{{{{{...})))|(((((.((((.............))))))))),.((((((((((..{..........,,........,...........,..)))))))))))))),|{|||||{||}},||||...((.(((((((((((.(((((..((((((.(,{((({((((((((((((.((((((.....))))))..)))))),,,.((((.{.((((....)))).}.)))).,||((.((((....)))).))}},.((((...)))).((.(((((((((..............(((((......{({,....}}}}..((((...((((((((..(((........)))....,.}},})))))))))((((....)))).....)))))..............}))))))))))..))))))})))))))))))..)))))....(((...(((((..{{{{,......}}...))}))))).)))..)))))))))))))..,,.,|,..,|||....,....}}||,{{,,{({{.,(((,,(((....((((((.({,{....})}.))))))....,,...{.((((((((...(((((...{{(((((...(((((((((((({.,......(((((((({{..||,,.....|....})))))))}}..((((((.....))))))....}))))))))))))))...))))).}}...)))))...)))))))).}......}}}}}}}}||||...,,,.,},,..,,,,}))))))),.....((((((...((((({{.((((((.{((..((((((((((({{........,,,(((({.((,.{.||{|,,.,||{{,{(({{{,{,...,,,,|{{{{{{{,(((,,{{{{.{{{((({,{{{{,{{,((((({...}))))).,,.,......,,,....((.,,,{(({{{{,.|.{((((((....))))))}.},}))}}}},,}})){{{{{{{((((((......)))))..}))),}},,.}}},||},,,{{{,,........}}}}}||||||....,}))))},,,..))))))).}))),))}.}}}},......|||||}.......,,,,.{(((((((((((((....)))..)))))))))))})))})})))},,.)))),)))),)))},...,,..((,{(((..((((((....))))))..))))))..,{{{{.{(((({,..((((((((,.....,{{,..((((((..(((({...}))))..))))))..,|||{,.(((({..{{{.,,..,,}}.}})....))))).}},,.,)))))))).,.,,...))}}}.}}})),}}}})))))))..}}},))))))...})}}}}))...))))))..