Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001256712.2
Sequence Length
1312 nt
GC Content
0.3377
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAGUUUCGGCAAGCAGCCAGAAUAUUUUAAAAAUGACUACACCAAACAAGACACCUCCUGGUGCUGACCCCAAGCAGUUGGAAAGGACUGGAACAGUACGGGAAAUUGGGUCACAAGCUGUUUGGUCACUCUCAUCUUGCAAACCAGGAUUUGGAGUGGAUCAGUUACGAGAUGACAAUCUAGAAACUUAUUGGCAAUCAGAUGGUUCCCAGCCUCAUUUAGUGAACAUCCAAUUCAGCAACUUGAGUUGGUGGAACCAAGUGGCUGGAUUCAUGUUCCCUUAACUGACAAUCAUAAGAAGCCAACUCGUACAUUCAUGAUACAGAUUGCUGUUCUAGCCAAUCACCAGAAUGGAAGAGACACCCAUAUGAGACAAAUUAAAAUAUACACACCAGUAGAAGAGAGCUCCAUUGGUAAAUUUCCUAGAUGUACAACUAUAGAUUUCAUGAUGUAUCGUUCAAUAAGGUGACUUUAAAAUGAGACGAAAAUCAUUAAACGUAUCUUUGUUUUAUCCUGUAUUUAAAUAAUAUAUCAUGUACCUUUAUUGAACAAGGCAUCCGUUAUAUCUAAUUUUGUAUAUGUUUAAAAAUAUUUUAUUGUAACUUUGACAAAUAAAUUUGGGGUCAUAUUAUCUUUAUUUUCUUUAACAUGUAAUAAAGCUCACAUAUUUUACAUUACUAAAAAUGGAUUUGAAGCCAAUCAUUUUAUUUUCCCUUGUAUCAAAAGAAAAGAGUUCCUUGUAUCAAAAGAAAAGAGUUGAACUGAAAAUUUCAGUAUAUACACAAUUAUAAUAGCUAGGUGAUUAUUUCAUUAGUGUUCAUACAUUAGAGUAAUGGUUUAUUGCAUAUUUGAGAACAAGACUGUGUUUUAUCAAUAUAUAUCAUCUUUAAUAGGUCAAAAUUACUAUUUUUUCUACCCAGAGGAAGGUUAUUCUUUUAAUACUGGAUCUUUUAAAAAACAGUGUCAAAUAAGCUUAGUGUUAGGUUGUCUGAUGAGAACCAAUCUAAUAUGGGGAGUAUAAUUAAUUGUCUCAUAUUCACCUUCACGGAAUACUUACAGCCCUAGGGUUGUCUGUAUCCUAAUGAUAUUAUGUAAAGAUUGCCUGUAUAAUCUAGCAGUACUUAUGGAAGAGUUCUAGCAGUACUUAUGGAAGAGUUAUUUUCAAAUUUGUGUCUGACAUUGUAGCAUUCCCUGGGCAGUCAUAUAUCCCAUAAAAUCGUAAAAGUAUGUGAAAUUUUUUAUAUAUAUUAAAAGAUUUUAAAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-300.38 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -331.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((...))))...(((((((((((.((((((((((.......))))))).((((.((((.....................................)))))))).))))).)))))))))...((.(((((((((((.(((((..((((((.((.((((((((((((((((.((((((.....))))))..))))))....((((.(.((((....)))).).))))..((((.((((....)))).))))..((((...)))).((.(((((((((....)))))))))))..))))))))))))))))))..)))))....(((...(((((..(((.............)))))))).)))..)))))))))))))........))))......(((.((((.((...((((..((((((((....((((((.((.......)).))))))...........((((((((...(((((.....(((((...(((((((((((((........((((((((((................))))))))))..((((((.....)))))).....)))).)))))))))...)))))......)))))...))))))))........))))))))))))...............)).)))))))......((((((...(((((((.((((((.(((..(((((((((((.............(((((.(((.(.((((....((((.((((((......(((((((.....((((((........((((((((.....((((((...))))))..................((.....(((((((.(.(((((((....))))))).).)))))))....))(((((((((((((......)))))..)))).))))...((((.....))))...........)))))))).....)))))).....))))))).((((((..............))))))............((((((((((((((....)))..))))))))))))))))).))))...)))).)))).))))).......(((.(((..((((((....))))))..))))))..(((((.(((((....((((((((............((((((..(((((...)))))..))))))...((((..(((((..(((.((....)).)))....))))).))))..))))))))........))))).))))).)))))))))))..))).))))))...)).)))))...))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((..((((...))))...(((((((((((.((((((((((.......))))))).((({.((((.............,{.......,......,.......)))))))).)))))}}))))))))...((.(((((((((((.(((((..((((((.(,{((({((((((((((((.((((((.....))))))..)))))),,,.((((.{.((((....)))).}.)))).,||((.((((....)))).))}}..((((...)))).((.(((((((({....}))))))))))..))))))})))))))))))..)))))....(((...(((((..{{{{,......}}...))}))))).)))..)))))))))))))..,,.,,,...}}|..,.{{,.,,,({((((((({{,{(((,.((({{..{(((((.(({(....|}}.}}}))}.....,...{.((((((((...(((((...{{(((((...(((((((((((({.,......(((((((({{..||,,.....|....})))))))}}..((((((.....))))))....}))))))))))))))...))))).}}...)))))...)))))))).}....,.,}|,}}}}||||,..||,,||,..,,,|,.|||}}|}.,,,,,{{{{{{...{{{{{{{.{((({{,{((,,{{,{{{{{{{{,{,,,....,,{{((({,.((,.,.||||}|.}||,{,{((,,{{{...,,,,,|{{{{{{,,{((||{{{{.|{{{({{,|{{{,{{,((((({...}))))).,,.,......,,,....((.,,{{(({{{{,,|.|((((((....))))))}.},})))}}},}}})){|{{{{{({((((......)))))..}})),}},,.,}},||},,,{|{},.,,,....}},}}||||||....,}})))},,,..))))))).||||,|}}.,,,,,......}}}}}}.,,,....|,,.((((((((((((((....)))..)))))))))))}))}})}))).}}})))))))))}))}}...,,,..((,{(((..((((((....))))))..))))))..,{{{{.{{((({,..((((((((,.....,{{,..((((((..(((({...}))))..))))))..,|||{,.((({{..|{{.,,..,,}}.}})....))))).}},,.,)))))))).,,},...})}||,|||}}.,},||||||||,.||||)))))),,.})}}}}))}}})),,)),.
Back