Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001257331.2
Sequence Length
1769 nt
GC Content
0.5726
GCAUUGGCGCGGGGAGGAGCAGGGAUCUUGGCAGCGGGCGAGGAGGCUGCGAGCGAGCCGCGAACCGAGCGGGCGGCGGGCGCGCGCACCAUGGGGGAGAAACCCGGGACCAGGGUCUUCAAGAAGUCGAGCCCUAACUGCAAGCUCACCGUGUACUUGGGCAAGCGGGACUUCGUAGAUCACCUGGACAAAGUGGACCCUGUAGUGUUUGUGACCCUCACCUGCGCCUUCCGCUAUGGCCGUGAAGACCUGGAUGUGCUGGGCUUGUCCUUCCGCAAAGACCUGUUCAUCGCCACCUACCAGGCCUUCCCCCCGGUGCCCAACCCACCCCGGCCCCCCACCCGCCUGCAGGACCGGCUGCUGAGGAAGCUGGGCCAGCAUGCCCACCCCUUCUUCUUCACCAUACCCCAGAAUCUUCCAUGCUCCGUCACACUGCAGCCAGGCCCAGAGGAUACAGGAAAGGCCUGCGGCGUAGACUUUGAGAUUCGAGCCUUCUGUGCUAAAUCACUAGAAGAGAAAAGCCACAAAAGGAACUCUGUGCGGCUGGUGAUCCGAAAGGUGCAGUUCGCCCCGGAGAAACCCGGCCCCCAGCCUUCAGCCGAAACCACACGCCACUUCCUCAUGUCUGACCGGUCCCUGCACCUCGAGGCUUCCCUGGACAAGGAGCUGUACUACCAUGGGGAGCCCCUCAAUGUAAAUGUCCACGUCACCAACAACUCCACCAAGACCGUCAAGAAGAUCAAAGUCUCUGUGAGACAGUACGCCGACAUCUGCCUCUUCAGCACCGCCCAGUACAAGUGUCCUGUGGCUCAACUCGAACAAGAUGACCAGGUAUCUCCCAGCUCCACAUUCUGUAAGGUGUACACCAUAACCCCACUGCUCAGCGACAACCGGGAGAAGCGGGGUCUCGCCCUGGAUGGGAAACUCAAGCACGAGGACACCAACCUGGCUUCCAGCACCAUCGUGAAGGAGGGUGCCAACAAGGAGGUGCUGGGAAUCCUGGUGUCCUACAGGGUCAAGGUGAAGCUGGUGGUGUCUCGAGGCGGGGAUGUCUCUGUGGAGCUGCCUUUUGUUCUUAUGCACCCCAAGCCCCACGACCACAUCCCCCUCCCCAGACCCCAGUCAGCACCCACCCCCACACCCCCUCUUCCCGUCCCCCCAGCCGCUCCGGAGACAGAUGUCCCUGUGGACACCAACCUCAUUGAAUUUGAUACCAACUAUGCCACAGAUGAUGACAUUGUGUUUGAGGACUUUGCCCGGCUUCGGCUGAAGGGGAUGAAGGAUGACGACUAUGAUGAUCAACUCUGCUAGGAAGCGGGGUGGGAAGAAGGGAGGGGAUGGGGUUGGGAGAGGUGAGGGCAGGAUUAAGAUCCCCACUGUCAAUGGGGGAUUGUCCCAGCCCCUCUUCCCUUCCCCUCACCUGGAAGCUUCUUCAACCAAUCCCUUCACACUCUCUCCCCCAUCCCCCCAAGAUACACACUGGACCCUCUCUUGCUGAAUGUGGGCAUUAAUUUUUUGACUGCAGCUCUGCUUCUCCAGCCCCGCCGUGGGUGGCAAGCUGUGUUCAUACCUAAAUUUUCUGGAAGGGGACAGUGAAAAGAGGAGUGACAGGAGGGAAAGGGGGAGACAAAACUCCUACUCUCAACCUCACACCAACACCUCCCAUUAUCACUCUCUCUGCCCCCAUUCCUUCAAGAGGAGACCCUUUGGGGACAAGGCCGUUUCUUUGUUUCUGAGCAUAAAGAAGAAAAUAAAUCUUUUACUAAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-641.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -674.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 418.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((((((((((((((((.((((..(((((((.((.((.((((.(((..((((...((....))...)))).))).)))))).((((((.(....(((((.(((((((((....((((((..(((((((.((((.........)))).)))))...))..))))))..))))..)))))....((((((...(((((.....((((...)))))))))...))))))..((..(.((((.((((((.(((((((((..(((..........)))..)))))..).))).).))))).)))))..))(((.....)))...))))))))))))))))))))).((...((.((..(((((((.(((((......)))))...)))))))..))))...)))))).)))..)).)))))).)).).)))).)))))((.(((((.(((.(((((.(((((.(((((((((((((((..(((....((((((((......))).))))).........(((..(((((..(((((((((((((..((((...((((.....)))).))))...))..(((.....)))..))))))....)))).)....)))))..))).((((.((((..((((....(.(((((((((((...((........)).))).)))))))).)....)))).(((....)))..................)))))))).)))..)))))))).((((...))))))))))).(((((.....(((((....((((((.((....)).))).)))....)).)))..)))))((((((.((.(((((((.((...((((((..(((....)))...(((((.((.(((..((.....)).))).)).)))))...(((..((.(((....(((......)))....))).)).))).....(((((.((......)).)))))..)).)))))).)))))))))))))))(((((..((((((..((((..((((((((.((((.(.((.((((((((...(((((.(((......(((......))).....))).)))))...))))))))..))).)))).))).)))))...)))).......(((.(((((((((((((.((((((..((((.(.((((.((((...(((((((.((..(((((..(((((...............))))))))))..))))))))).)))))))))))))...))))))..))))))....(((.((......).).))).((((((((....))))))))))))))).))).((((((((((..(((((((((((((((.((((...(((((((.(.......))))))))))))..)))).......(((((........)))))..................)))).)))))))))))))))))(((..........)))....(((((((..(((((.((((..........(((.(((((((.((((.((((.((...)).).))).))))))))))).)))..((..........))..(((((.(((((.((..((((((....((((...((((((((......))))..))))...)))).......)).))))..)).))))).))))))))).)))))...))))))).))))))...))))).))))).))))).)))))))).))....((((((.......)))))).....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{((((((((((((((((({(((((((((({(((((.(.((.(((((((.((,.(((((...{{....}}}}})),,}).)})(((((..((((({(...,((((,{({{(((((({{,.((((((..(((((({.((({.{.....,.)))).}))))...))..))))))..,},...,,|||.((.((((((...{((((.,...((({...}))))))))...)))))).)).}}|,||||}}||||..||{|||||{,|((,.,,..,,,},)})..}}}},..||{.....,,,))}}))))))},))))).........,,}))))})}).)))))})))}||,..((.((..(((((((.(((((......)))))...)))))))..))))....,,,,,....,))).)))))).)).).)))).))))}((.(((({{(((.(((((,(((((.(((((((((((((((..((({{{((((,(((({{...{|,,.,,,,),....}},,}||.}|||..}}}{{,((((((((((.,.((..,((((({{...|||{|({,.....,,(((.....}}}.,,,|}}}.........,.....,,,,..,}},}||,}))|,.)))))}}},|.(((((((((((...((........)).))).))))))))......{{{...,,...,,}}............}}}}..),)))))}.)))..)))))))),((((...))))})))))).(((((,,.,,{{{{{....((((((.((....)).))).)))....}}.}},..))))){(((((.{{.(((((((.((,,.{({{{{..(({,...}}}...(((((.((.(((..((.....)).))).)).)))))...(((..((.(((....(((......)))....))).)).))).{{{.(((((.((.,,..,)).))))),..}..))})).))))))),,))))))(((((..((((((..((((..((((((((.((((.(.((.((((((((...{((((.(((......(((......))).....))).)))))...)))))))),,)}}.)))).))).)))))...)))).......{((,(((((((((((((.((((((..((((.(.((((.((((,,.,((((({,((..(((((..(((((....,,....,}...))))))))))..))))))))},)))))))))))))...))))))..))))))...,{{,.,,......,.,.,)).((((((((....))))))))))))))}.))).((((((((((..(((((((((((((((.((((...(((((((.{.......))))))))))))..)))).......(((((........)))))..................)))).))))))))))))))))){{,.........,))).,,,{((((((..(((((.((((..........(((.{((((((.((((.({((,((...}}.},))).))))))))))).)))..{{..........}).,|((({.(((((.{({,((((((...{((((,..(({(((((......)))),.))}),..)))).......},)))))..}}.))))),))))))))).)))))...))))))).)))))).},))))).))))).))))),)))))))).))....((((((.......)))))).....)).
Back