Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001257334.2
Sequence Length
5695 nt
GC Content
0.4548
CAUUUUGUCCCAGUCAGUCCGGAGGCUGCGGCUGCAGAAGUACCGCCUGCGGAGUAACUGCAAAGAUGCUGUCCGUGCGCGUUGCUGCGGCCGUGGUCCGCGCCCUUCCUCGGCGGGCCGGACUGGUCUCCAGAAAUGCUUUGGGUUCAUCUUUCAUUGCUGCAAGGAACUUCCAUGCCUCUAACACUCAUCUUCAAAAGACUGGGACUGCUGAGAUGUCCUCUAUUCUUGAAGAGCGUAUUCUUGGAGCUGAUACCUCUGUUGAUCUUGAAGAAACUGGGCGUGUCUUAAGUAUUGGUGAUGGUAUUGCCCGCGUACAUGGGCUGAGGAAUGUUCAAGCAGAAGAAAUGGUAGAGUUUUCUUCAGGCUUAAAGGGUAUGUCCUUGAACUUGGAACCUGACAAUGUUGGUGUUGUCGUGUUUGGAAAUGAUAAACUAAUUAAGGAAGGAGAUAUAGUGAAGAGGACAGGAGCCAUUGUGGACGGUCCAAUUGGUUCCAAGACGCGUAGGCGAGUUGGUCUGAAAGCCCCCGGUAUCAUUCCUCGAAUUUCAGUGCGGGAACCAAUGCAGACUGGCAUUAAGGCUGUGGAUAGCUUGGUGCCAAUUGGUCGUGGUCAGCGUGAACUGAUUAUUGGUGACCGACAGACUGGGAAAACCUCAAUUGCUAUUGACACAAUCAUUAACCAGAAACGUUUCAAUGAUGGAUCUGAUGAAAAGAAGAAGCUGUACUGUAUUUAUGUUGCUAUUGGUCAAAAGAGAUCCACUGUUGCCCAGUUGGUGAAGAGACUUACAGAUGCAGAUGCCAUGAAGUACACCAUUGUGGUGUCGGCUACGGCCUCGGAUGCUGCCCCACUUCAGUACCUGGCUCCUUACUCUGGCUGUUCCAUGGGAGAGUAUUUUAGAGACAAUGGCAAACAUGCUUUGAUCAUCUAUGACGACUUAUCCAAACAGGCUGUUGCUUACCGUCAGAUGUCUCUGUUGCUCCGCCGACCCCCUGGUCGUGAGGCCUAUCCUGGUGAUGUGUUCUACCUACACUCCCGGUUGCUGGAGAGAGCAGCCAAAAUGAACGAUGCUUUUGGUGGUGGCUCCUUGACUGCUUUGCCAGUCAUAGAAACACAGGCUGGUGAUGUGUCUGCUUACAUUCCAACAAAUGUCAUUUCCAUCACUGACGGACAGAUCUUCUUGGAAACAGAAUUGUUCUACAAAGGUAUCCGCCCUGCAAUUAACGUUGGUCUGUCUGUAUCUCGUGUCGGAUCCGCUGCCCAAACCAGGGCUAUGAAGCAGGUAGCAGGUACCAUGAAGCUGGAAUUGGCUCAGUAUCGUGAGGUUGCUGCUUUUGCCCAGUUCGGUUCUGACCUCGAUGCUGCCACUCAACAACUUUUGAGUCGUGGCGUGCGUCUAACUGAGUUGCUGAAGCAAGGACAGUAUUCUCCCAUGGCUAUUGAAGAACAAGUGGCUGUUAUCUAUGCGGGUGUAAGGGGAUAUCUUGAUAAACUGGAGCCCAGCAAGAUUACAAAGUUUGAGAAUGCUUUCUUGUCUCAUGUCGUCAGCCAGCACCAAGCCUUGUUGGGCACUAUCAGGGCUGAUGGAAAGAUCUCAGAACAAUCAGAUGCAAAGCUGAAAGAGAUUGUAACAAAUUUCUUGGCUGGAUUUGAAGCUUAAACUCCUGUGGAUUCACAUCAAAUACCAGUUCAGUUUUGUCAUUGUUCUAGUAAAUUAGUUCCAUUUGUAAAAGGGUUACUCUCAUACUCCUUAUGUACAGAAAUCACAUGAAAAAUAAAGGUUCCAUAAUGCAUAGUUGUUUUCUGUCAUUUGUGUUAUUCUUUAAAACCAAGAUCAAAUUGAGAAAUUGGUAAGCAAAUGCUUCUUGAUCUAUUUUACUUGAAUAUUGGUACAGUCAACUGGGCUAGAUAAUUCAAGGCUGAGCUCUUUGUAAGUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUGAGACUGAUUCUCACUCUGUCACUGAGGCUGGAGUGCAGUGGCACCCUGUCGGCCCACUGCAACCUCCGUCUCCGGGUUCAAGCAAUUCUCUUGCCUCAGCCUCCCACGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCACCACCACGCCUGGCUAGUUUUUUAGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCCGGUCACGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCUGCCUUGGCCUACCUACCACAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCGCACCCGGCUGCUCUUUGUAAGUUUCUAGAGUACUUUGUGUUUAAGAGAAAUUCCUAAACUGGAUAUAUGUGGCAGGCUGACAAUACUGAAGAGCAUAGCUGGCUUCUCUGCCCAGAGGAUGUACCUGCAUAAAGAGGUACUGUAGGCAGGAAAAUAAUAGGACAGUUAAAAUUCUCAGGGAAAUGAAAAAAUUGCUGGAACAAAAGCUGAGAAGAUAGAAUGCAUAGGAUUAUGAAAACUUGUCAAUAUCUCUUUUGUUUGUUUUGUGACAGGGUCUCCAUCUCUCUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCAGCUCACUGCAGCUUCUGCCACCUGGGUUCAAUUGAUUCUUCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGGUUACAGGCACAUACCACCACGCCCAGCCAAUUUUUCUACUUUUUGUAGAGGGAGGGUCUUGCCAUGUUGUCCAGGCUGAUGAUGAACUCCUUGGCUCAAGUGAUCCUCCUGCCUUGGUCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAACUACCAUGCCCGGCCAUCUUUUAAUAUUUUCACAGCUACUUUAUUUCCUCUGUUACUAGCUUUUCAUAGCCUUUGCUCAUUCUUACUGCAUUAAAUUUUUUUUACUGAUUUAUUUAUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCUCUGUCACCUAGGCUGGAGAGCAGUGGCGUAAUCUCAGCUCACUGCACCUUUCACCUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUUAGCCUCCCAAUUAGCUGGGACCACAGGCCCAUGCCACCACACCCGGCUAACAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAAGGUUUCACCAUGUUGGCCAUGCUGCUCUUGAGCUCCUGACCUCGUGGUCUGCCCGCCUCAGCUUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACGCCCAGCCUACUGAUUUAUUUAUUUACUUUUAAUUUUUCAUAGCCUUUGCUCAUUCUUAAUGUGUUACCUUUUUUUUUACUUAGUUAUUUAUUUAUUUGAGAUGGAGUCUCCGUCGUCCAGGCUGGAGUGCAGUGACCUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCAGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGAAGCUGGAACUACAGGCACCCACCACCAUGCCCUGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGGCGGGGUUUCACCAUAUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUUGUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCCCACAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACACCUGGCCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCACUGUCUCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCGAUGUCGGCUCACUGCAAGCUCUGCCCCCUGGGUUUGCGCCGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAUUAGCUGGUACUACAGGCGCCUGCCAUCACGCCCAGCUAAUUUUUUUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUCGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCAUGAUCCACUUACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCUUGAGCCACCGCGCCCGGCCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUACUGAUAUAUAAAGGCUUUUGUCUGUAAGGGUCAUACAUGGUCAUGUUCUAAAAUAUUUUUCCUAGGGUUCCCCCUUCCUUGCCAUUUUAUUUUGUUGAUGGGGAUUUGCUGUACCGAAACUUCAUUCUUAUCCAUCUCUCUGUCUCCAGUAAGUCAAAAUAUAUUUACAUAUGUGGGCUCCAAUAUCUUUGGUAGGAAAAGGAGAGUUCUUAAAGUACUCAUAAGUCCUUUUCAGUACUUAGAGGAACACUAAACUUGAUAGCAGUUGGUCAUUUCUGAUCAACUCUUGCUUUCUAGCUACUUGAGAAAUAACUUCUAGAUCUGAUUUUCCUUUUCUGAAAUAAGGAAGUUACUUUUAGUUAGAAGGUUCUGCACAUUUCGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUUGAGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCACGAUCUCGGCUCACCACAACCACCGCCUCCUGGGGUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGGCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCACCACCACGCCUGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUUAGGUGGUCCACCGGCCUCCCAAAGUACUGGGAUUACAGGGGUGAGCCACUGCGCCCGGCUUGUUGGAGCAUUUUAUACCUAGUGUCAGUGGUGAUUACUACUUUGGAGAAAAAUACUUUGGCUAAUGGAUUGGAAUUAAUUUAUUACUGGGAGUAUGUAUUGUUUGUUUGUUGACUGGAUCUCGUAGCCCACUCCUGGCACGUAAAUGCUCAAUAAACUUCUCAAAUGAAGACAACCAUGUUUGUCCAUUAUAAAUCAAAUUCCAAAUGUUAACUACUGGUCUGGUCUGAUGAGAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUUUUGUUUUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCGCGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCCUACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGUGAUUAUAGGUGUGCACCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUU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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1872.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1975.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 1521.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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