Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001257392.1
Sequence Length
777 nt
GC Content
0.5045
GCCCGGCAGCCAUGGCGGUGGAAGGAGGAAUGAAAUGUGUGAAGUUCUUGCUCUACGUCCUCCUGCUGGCCUUUUGCGGGGCUACCCCUGGCUCUCUGUUGCCAGUGGUCAUCAUCGCAGUGGGUGUCUUCCUCUUCCUGGUGGCUUUUGUGGGCUGCUGCGGGGCCUGCAAGGAGAACUAUUGUCUUAUGAUCACGUUUGCCAUCUUUCUGUCUCUUAUCAUGUUGGUGGAGGUGGCCGCAGCCAUUGCUGGCUAUGUGUUUAGAGAUAAGGUGAUGUCAGAGUUUAAUAACAACUUCCGGCAGCAGAUGGAGAAUUACCCGAAAAACAACCACACUGCUUCGAUCCUGGACAGGAUGCAGGCAGAUUUUAAGUGCUGUGGGGCUGCUAACUACACAGAUUGGGAGAAAAUCCCUUCCAUGUCGAAGAACCGAGUCCCCGACUCCUGCUGCAUUAAUGUUACUGUGGGCUGUGGGAUUAAUUUCAACGAGAAGGCGAUCCAUAAGGAGGGCUGUGUGGAGAAGAUUGGGGGCUGGCUGAGGAAAAAUGUGCUGGUGGUAGCUGCAGCAGCCCUUGGAAUUGCUUUUGUCGAGGUUUUGGGAAUUGUCUUUGCCUGCUGCCUCGUGAAGAGUAUCAGAAGUGGCUACGAGGUGAUGUAGGGGUCUGGUCUCCUCAGCCUCCUCAUCUGGGGGAGUGGAAUAGUAUCCUCCAGGUUUUUCAAUUAAACGGAUUAUUUUUUCAGACCGAAAAGAGAUGGUCUGAGUUUGUCUUAGAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-274.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -289.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.((((.((((((..(((((((........((((.(((....))).)))))))))))...((((((....))))))(((.(((((........))))).)))...)))))).)))).))))...((((....((.((((..((((((((.(...).))))))))((((((.(((...((((((.(((((.((.(((((..((((((((((.(((.(((((.((((((((((((((.....))).)))).(((..(((((((((......))))....)))))..)))))))))).))))))))))))).....................((((((..(((((....)))))..))))))((((((((.((((((.((((((((.((((((((((((((((.......)))))).)))......((.(((((((((((.((.((((((((((.((((........)))).))))..(((.....)))(((..(((....)))..))))))))))).)).)))))))))))...........)))).))))))))))).)).)))).))))))))(((((((..((((((...((.((......)).))....))))))..))))))).))))))))))...)).)))))))))))...))))))))).)))).))..((((((((((...........)))))))))).............((((......(((((((((........)))))))))...)))).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.((((.(((((({.(((((((.......{((,(.{((....))),)))))))))))..{((((({....})))))|{(,(((((........))))).)),..,)))))).)))).))))...((((....((,((((..{{{|||||,|,..|,||}}||}}((((({,(((...((((((.(((((.((.(((({..(((((,((((,.(((((..,.,((((((((((((({...,))).)))).{{(..(((((((({......))))....}))}}..))}))))))((((((((.,(((,({{{.((((({......,....((((((..(((((....)))))..))))))((((((((.((((((.(((((((,,(((((((,,{{(((({....,,,)||||,.,||......((.(((((((((((,((,({((((((((.((((........)))).))))}}{((.....}}}(((..(((....)))..)))}))))))).}}.))))))))))),,..,,,....)))).))))))))))).)},)))).))))))))||{|{,|,,|||}})))))))}}}}.))),,..)))))))).)))))})))...))))))))))...)).)))))))))))...))))))))),)))).))..{{((((((((.,,......,.))))))))||,,.......,,,,{(({......(((((((((........)))))))))...))}}.))))..
Back