Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001257400.2
Sequence Length
926 nt
GC Content
0.5108
GCCCCUCUCCCCCUUUCCCUCCUCCCAGCGCUUGGGGGCCUGUGCAGUGGGACUGAUUGCCGUGGGUGUCGGGGCACAGCUUGUCCUGAGUCAGACCAUAAUCCAGGGGGCUACCCCUGGCUCUCUGUUGCCAGUGGUCAUCAUCGCAGUGGGUGUCUUCCUCUUCCUGGUGGCUUUUGUGGGCUGCUGCGGGGCCUGCAAGGAGAACUAUUGUCUUAUGAUCACGUUUGCCAUCUUUCUGUCUCUUAUCAUGUUGGUGGAGGUGGCCGCAGCCAUUGCUGGCUAUGUGUUUAGAGAUAAGGUGAUGUCAGAGUUUAAUAACAACUUCCGGCAGCAGAUGGAGAAUUACCCGAAAAACAACCACACUGCUUCGAUCCUGGACAGGAUGCAGGCAGAUUUUAAGUGCUGUGGGGCUGCUAACUACACAGAUUGGGAGAAAAUCCCUUCCAUGUCGAAGAACCGAGUCCCCGACUCCUGCUGCAUUAAUGUUACUGUGGGCUGUGGGAUUAAUUUCAACGAGAAGGCGAUCCAUAAGGAGGGCUGUGUGGAGAAGAUUGGGGGCUGGCUGAGGAAAAAUGUGCUGGUGGUAGCUGCAGCAGCCCUUGGAAUUGCUUUUGUCGAGGUUUUGGGAAUUGUCUUUGCCUGCUGCCUCGUGAAGAGUAUCAGAAGUGGCUACGAGGUGAUGUAGGGGUCUGGUCUCCUCAGCCUCCUCAUCUGGGGGAGUGGAAUAGUAUCCUCCAGGUUUUUCAAUUAAACGGAUUAUUUUUUCAGACCGAAAAGAGAUGGUCUGAGUUUGUCUUAGAGUGAUGCUUGAUUCCUUCCUUUCCUUACUGAUGUUCCCUGUCCUCUGGGACCUUAAUGCAUGUGUACUUCGAGGUCUAUUUUGGGGGGUGUUUGGGAAAGGAGGACUUUGCGAAGGUGUUGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-324.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -344.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..(.((....((((((((.(((((.....((((((.(((((..(((.(((.((....)).))).)))..)))))((..((((((((.(((.((((((.(((((((....)))))))......((((((((.((....((((......))))....)).....))))))))..)))))).))))).))))))..)).((((((.(((...((((((.(((((.((.(((((..((((((((((.(((.(((((.((((((((((((((.....))).)))).(((..(((((((((......))))....)))))..)))))))))).))))))))))))).....................((((((..(((((....)))))..))))))((((((((.((((((.((((((((.((((((((((((((((.......)))))).)))......((.(((((((((((.((.((((((((((.((((........)))).))))..(((.....)))(((..(((....)))..))))))))))).)).)))))))))))...........)))).))))))))))).)).)))).))))))))(((((((..((((((...((.((......)).))....))))))..))))))).))))))))))...)).)))))))))))...)))))))))..))))))....))))))))).)))).(((((((((.(((............((((((.......((((((((........))))))))))))))))).))).))))))......(((((((((((....(((((((((((.......((((((((((((....))).)).)))))))....))))))))))).)))))))))))..........)).)..)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({((((,{{...((((((((((({...,)))){((((..(((((((.{.(((,{((.(((((.(((((((,{,.{{,|{|||||,,.|||,|......(((((((....)))))))({{(((((((((.((((((((.,..(((((((...(({{{{.,..{{,||,||{{,,{{{{||||,|,..)}))}}})}}))))}}.)))))))..,)))))))).{(((.((((..(,(((((((...(((((.(,(((.((((((....)))))).))},),)))))...))))))).)}.)))).)))}(((....,}}..,....))))))))}.|}}}.....,||,........,,.,,((((((..(((((....)))))..))))))..,,,,,|,,{||||}|||||,,..||,|||||,.,((((,....}}})}}}},.,||{......|}|||))))))).))))).))}}}}.|.})))))}})))}|||{{{{{..((((.....)))}..}})))...}))))}),,,.}.)))),,,.,,||||}},{(({((({{....,||(({{,||,,,,},.)),)|||{|||,,,..{((((((..((((((...((.((......)).))....))))))..))))))},|,,|}}.}}||,{{{,,.{{{|,||,,|}}}|},,)))))))))})}}}|||{|||{(||.||...,{{{|||||,||{|,,.......,,||({((,,,...{((((((((........)))))))))...}}}},.))),)))})}..},||({{((((((({....{({,{{((((,.......(((((((,,(((....))).}}.)))))))....,)))))),}}}.)))))))))))},|,.,,.,,))},..}}.
Back