Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001267058.2

Sequence Length

2236 nt

GC Content

0.4191

ACUUCCUGUCGUCGCAGAGCACAGCCUAGUUCUGAUGCAGAGGGGACUGUUUUCAGAUGGAGACACUAGUAAGAAGAAGAAAAAUGUCACCAUGCGAUCCAUCAAGACCACCCGGGACCGAGUGCCUACAUAUCAGUACAACAUGAAUUUUGAAAAGCUGGGCAAAUGCAUCAUAAUAAACAACAAGAACUUUGAUAAAGUGACAGGUAUGGGCGUUCGAAACGGAACAGACAAAGAUGCCGAGGCGCUCUUCAAGUGCUUCCGAAGCCUGGGUUUUGACGUGAUUGUCUAUAAUGACUGCUCUUGUGCCAAGAUGCAAGAUCUGCUUAAAAAAGCUUCUGAAGAGGACCAUACAAAUGCCGCCUGCUUCGCCUGCAUCCUCUUAAGCCAUGGAGAAGAAAAUGUAAUUUAUGGGAAAGAUGGUGUCACACCAAUAAAGGAUUUGACAGCCCACUUUAGGGGGGAUAGAUGCAAAACCCUUUUAGAGAAACCCAAACUCUUCUUCAUUCAGGCUUGCCGAGGGACCGAGCUUGAUGAUGGCAUCCAGGCCGACUCGGGGCCCAUCAAUGACACAGAUGCUAAUCCUCGAUACAAGAUCCCAGUGGAAGCUGACUUCCUCUUCGCCUAUUCCACGGUUCCAGGCUAUUACUCGUGGAGGAGCCCAGGAAGAGGCUCCUGGUUUGUGCAAGCCCUCUGCUCCAUCCUGGAGGAGCACGGAAAAGACCUGGAAAUCAUGCAGAUCCUCACCAGGGUGAAUGACAGAGUUGCCAGGCACUUUGAGUCUCAGUCUGAUGACCCACACUUCCAUGAGAAGAAGCAGAUCCCCUGUGUGGUCUCCAUGCUCACCAAGGAACUCUACUUCAGUCAAUAGCCAUAUCAGGGGUACAUUCUAGCUGAGAAGCAAUGGGUCACUCAUUAAUGAAUCACAUUUUUUUAUGCUCUUGAAAUAUUCAGAAAUUCUCCAGGAUUUUAAUUUCAGGAAAAUGUAUUGAUUCAACAGGGAAGAAACUUUCUGGUGCUGUCUUUUGUUCUCUGAAUUUUCAGAGACUUUUUUUAUAAUGUUAUUCAUUUGGUGACUGUGUAACUUUCUCUUAAGAUUAAUUUUCUCUUUGUAUGUCUGUUACCUUGUUAAUAGACUUAAUACAUGCAACAGAAGUGACUUCUGGAGAAAGCUCAUGGCUGUGUCCACUGCAAUUGGUGGUAACAGUGGUAGAGUCAUGUUUGCACUUGGCAAAAAGAAUCCCAAUGUUUGACAAAACACAGCCAAGGGGAUAUUUACUGCUCUUUAUUGCAGAAUGUGGGUAUUGAGUGUGAUUUGAAUGAUUUUUCAUUGGCUUAGGGCAGAUUUUCAUGCAAAAGUUCUCAUAUGAGUUAGAGGAGAAAAAGCUUAAUGAUUCUGAUAUGUAUCCAUCAGGAUCCAGUCUGGAAAACAGAAACCAUUCUAGGUGUUUCAACAGAGGGAGUUUAAUACAGGAAAUUGACUUACAUAGAUGAUAAAAGAGAAGCCAAACAGCAAGAAGCUGUUACCACACCCAGGGCUAUGAGGAUAAUGGGAAGAGGUUUGGUUUCCUGUGUCCAGUAGUGGGAUCAUCCAGAGGAGCUGGAACCAUGGUGGGGGCUGCCUAGUGGGAGUUAGGACCACCAAUGGAUUGUGGAAAAUGGAGCCAUGACAAGAACAAAGCCACUGACUGAGAUGGAGUGAGCUGAGACAGAUAAGAGAAUACCUUGGUCUCACCUAUCCUGCCCUCACAUCUUCCACCAGCACCUUACUGCCCAGGCCUAUCUGGAAGCCACCUCACCAAGGACCUUGGAAGAGCAAGGGACAGUGAGGCAGGAGAAGAACAAGAAAUGGAUGUAAGCCUGGCCCAUAAUGUGAACAUAAGUAAUCACUAAUGCUCAACAAUUUAUCCAUUCAAUCAUUUAUUCAUUGGGUUGUCAGAUAGUCUAUGUAUGUGUAAAACAAUCUGUUUUGGCUUUAUGUGCAAAAUCUGUUAUAGCUUUAAAAUAUAUCUGGAACUUUUUAGAUUAUUCCAAGCCUUAUUUUGAGUAAAUAUUUGUUACUUUUAGUUCUAUAAGUGAGGAAGAGUUUAUGGCAAAGAUUUUUGGCACUUUGUUUUCAAGAUGGUGUUAUCUUUUGAAUUCUUGAUAAAUGACUGUUUUUUUCUGCCUAAUAGUAACUGGUUAAAAAACAAAUGUUCAUAUUUAUUGAUUAAAAAUGUGGUUGCUUAAUUCCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-621.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -667.21

Frequency: 0.0000

Diversity: 677.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((.((((..((((((........))))))..)).)).)))).((((((..(((..((..((((......(((((((((..((((...........(((((((((....))(((.(((((((.....(((.......((((((((((.....(((..((....))................((((((.....((((((((((((((.((((((.....(......).....))))))((((((((.....))))))))....((((((((..(((.(((...(((......)))((((((((...))))).)))(((...((((....)))).)))(((((((..(((....)))...))).))))........((((.((((((((((((((((............((((......(((((((..((......))...))))).))..(((((((((((............)))))))))))...))))...))))))))))...))))))..))))....(..((((.(.(((((.((((((((.......))))((((.........))))....(((.((((....(((((((.((((((((((...(((((((((((.((((..((((((...((((.....)))).))))))..)))).))))(((.(((((.......((...((((((........)))))).))...))))).))).......((.(((((((((.(((((.....((((((.((...))))))))..........((((((((((..((((((.....((((......(((((((((((.((....(((....(((........))).)))....))))))).))))))....))))...)).))))...))))))).)))....((((((((((((........(((((((((.....(((((((....))))))).)))))))))))))))...)))))).((((((......))))))(.(((.(((((((((((((((....)))))))...................((((((((((((((((((((((((((((((.....((((((((((((((((((((..(((.(((((((.(((((((((..(((.((((((...))))))......((((((.(((((..(((((......)))))..))))).)).))))....(((((.....)))))....(((((..((.(((........))).))..))))).....((((........))))..)))..))))))))).))...((((......)))))))))..))))))))....))))))).....(((....)))..)))))))).....))))..(((((((((........)))))))))...((((.....)))).(((......)))........))))))))))..)))))).........)))).))))))))))))))..)))).((((((.....))))))....)))))..))...)))))))..)).))))))).)))))))))..........).))))))).(((((.....))))).(((((((((..(((.((....)).))).....))))).)))))))).)))...))))))))).)))))..).......(((...(((((((((.(.((((((((...((((.......))))))))))........)))))).))))))....)))))).)))..))))))))((((((((.((((.((((((...(..(((((......)))))..).))))))...........(((..((((((((......(((.........(((.(((.(((....))).))).))).........)))......))))))))..))))))).))))))))....(((((((((((((((...)))))))....))))))))............((((...((((.(((((((....)))))))))))..))))((((...))))...)))))))))))))).))))))...))).....)))))))))).....)))....))))))).)))(((((((.(((...)))))))))).)))))))...))))..)))))))))......))))..)).)))..)))))).....((((((((.........))))))))...............

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((((.(({{,.((((((........)))))).,)).)).)))).{((((({.,,,||||}|{,{{.,..,.{((((((({..((({......,.,..{(((((({(....||(((.(((((((.....(((.,,....((((((((((.....((({,((....)).}}.............{({(((.....{{{((((((((((({{((((((,...,,||}|,,,,...{,||||((((((((.....)))))))),|,,({||(((({{(((,(((,..(((......)))((((((((...))))).))){{{...((((....)))).}}}(((((((..{{{....)})...))).))))|{{.(({((,((((.,,(((((((,,{,,........)))))||..,}}}.|||||{({{({.,,,.,||{{{{|||{{{{{{(((((((((((............))))))))))).....,....|{||||||,,{{{||||{{((,,,,}..}}}}|||||,,.{(((.{(({(|||,.|||||({(((((...,((((((({.(((((.((((....((..(((({{(,(((((....}}}}},||,.((((.((((..((((((...(({(.....)))}.))))))..)))}.))))(((((..(((.((...(((((((((((.....,}})})))...{{{{{.((((((({{{(({.((((((,{(((((((.((({{,,(((((,,((...)))))))).}}.))).)))),,,((((({{,(((,,.,,{{(({{{{{{..(((((((((((,,{...,({{....{{(,.......}}}.))}....,)))))).))))))....||},.{||,.,,))},,|}||||||}||..,,((((({(((((,....,,..(((((((((.....(((((((....))))))).))))))))),,}}),...|||}}},({(((({{...,)))))}}},,,}}},.,.{,(((((((....)))))))..........}}}||.}}}}}}}}))))))},|||,,((((((((..(({.....(((((,,((((((((((((((......})))))}|...,,||)}}|},{|||||...}})))))))))}|(((((.(((((..(((((,.....)))))..))))).)).)))},.,.{((((.....))))}.,,.(((((..((.(((........))).))..))))).,,,.||||}}},,...)}})}}))))))),,}}})},.))))}}.|}}}}{{{||,{{(((({{,,|,||{,,,,..,,,.}}}},}|||...}))))))).))))),.....,....(((((((((........)))))))))...((((.....)))).....}))))))).)))}..,)))))).)).)))..)))))...,...,..,..,,..,....,,},,,||{|.((((((.....)))))).,,.......,)}}}.}}.))))..))....)))).))))).),))))))).,...))))).,,...,|(||{.{|{||..(((((((((.,(((.((....)).))),....))))),,)))...((((((.((((((.{,.{..........,,{{{{|..,.,.{{{{{,|||{||((((,,...,,,,.......))))),))))}})})).,}..))).))).))))))})}),)})).,,)))),)))|,.|||))),))),((((((...(..(((((......)))))..).))))))..}}})}}}}....,.((((((((......(((...,,,.,((((.(((.(({....))).))).))}.},...,}})))..,...}}}}}})},..))))))))))))),,}}}.}||.|||||{({{({...}))))))},.}})))),))}}}}))}}|,,.{{{{{,,((((.,{(((((,...,}}))}},})),,}}},..|||}}}}}}},.}}}}}}}))))})},}}))))...))),,.,.)))))))))).....)))....))))))).)))|{{((((,{|,..,})))}}))),.})))))}...})))..))))))))),,|,..,}}|..,,}}},..,,}}}}...|,|{{{{{{|,,,......}})))))),})},..........