Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001282516.2
Sequence Length
791 nt
GC Content
0.5689
CCUUUCUACGCUGGGCCGGUUAUCGACCCGGCCCAGUGCGCAGGCGCGGGAAAGUUGAACUAAUAAAGUUUGUACGAGUUCAGUGGAGGAGACCGCAAGUUGAGUGGAGGAGGCGGCGGUGGGGCCCCGGACCAGGUGCCUCCAUGGCAGGCUCUGAAGAGCUGGGGCUCCGGGAAGACACGCUGAGGGUCCUAGCUGCCUUCCUUAGGCGUGGUGAGGCUGCCGGGUCUCCUGUUCCAACUCCACCUAGAAGCCCUGCCCAAGAAGAGCCAACAGACUUCCUGAGCCGCCUUCGAAGAUGUCUUCCCUGCUCCCUGGGGCGAGGAGCAGCCCCCUCUGAGUCCCCUCGGCCUUGCUCUCUGCCCAUCCGCCCCUGCUAUGGUUUAGAGCCUGGCCCAGCUACUCCAGACUUCUAUGCUUUGGUGGCCCAGCGGCUGGAACAGCUGGUCCAAGAGCAGCUGAAAUCUCCGCCCAGCCCAGAAUUACAGGGUCCCCCAUCGACAGAGAAGGAAGCCAUACUGCGGAGGCUGGUGGCCCUGCUGGAGGAGGAGGCAGAAGUCAUUAACCAGAAGGAGGGCAUCCUGGCUGUUUCACCCGUGGACUUGAACUUGCCAUUGGACUGAGCUCUUUCUCAGAAGCUGCUACAAGAUGACACCUCAUGUCCCUGCCCUCUUCGUGUGCUUUUCCAAGUCUUCCUAUUCCACUCAGGGCUGUGGGGUGGUGGUUGCCCUACCUGUUUUUGCCAAAAAUAAAUUGUUUAAAACUUUUCUUAUUAAAAACGUUACAAAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-298.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -312.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...(((((((((((........))))))))))).(((((.((((......((((((..((.......))..))))))((((.(((((..((((((((((.((((((((.((((((((((....(((.((((.((((....(((((.(((.....((((((((((((((.........))).)))))))))))((((.....)))).....))).)))))))))..)))).)))..))))))).....(((((((((.((..((((....((((.((.((((.....))))..)).)))).....)))).)).)))).))).)).))).)))))...))).))))).))))))))))..)))))))).)))))...((((...))))(((.((((((..(((((.((.((..(((.....)))..)).)))))))..)))))).)))((.((((((...(((.((.((((((((.((....(((((((((((.(((.(((....((...))...)))))).))..)).))))))).((((((((((((.(((((.((.....((..(((((((((...((((.(((((.((.((((.(........))))).))..((((......))))))))).))))......((((.....))))..)))))))))..)))))))))))...))))))...)))).)).)))))).)))).))))))))).))....(((((...(((.......)))...))))).....................))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((({...(((((((((((........))))))))))).(((((.((((......((((((.,({.....,,},..))))))((((.({(((..((((((((((.((((((((,((((((((((....(((.((((.((({,..,(((((.(((.....((((((((((((((.........))).)))))))))))((((.....)))).....))).)))))))),,.)))).)))..))))))).....(({(({{{(.,{.,({{{....(({{.{{.||{|,,,,})))|,,|}.}})),,...}|||.},,||||.,}}.}}.))).)}}}},,,))).))))),,))))})))).,)))))))).)))))...((({...})))(((.((((((..(((((.((.((..(((.....)))..)).)))))))..)))))).)))((.((((((...{((.((,({((((((.({....(((((((((((.(((.(((....({...))...)))))).))..)).))))))).(((((,(((((({(((((,((,......{{(((((((((,,.((((.(((((,{(.{{{{.{..,,,...)))),.)),,((((......)))))}})}.))},..,},.(({{...,.))))..)))))))))}.}))))))))},..}))))))).,)))).}).)))))).)))).))))))))).))...,((((({,..,,,,,,,...,|,,...}},.,,......,,}}}}},.,..})))..
Back