Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001289417.1
Sequence Length
1010 nt
GC Content
0.5901
GGGGAGGCGCGUGCGCACUGGCGUGCGAGACUCGGCGGGCGCUGUUGAGGGAGUCGGGCCGCGACUGUGGUCGUUUUUAUACCUUCCCGCGCGGACGCCGGCGCUGCCAACGGAAGGGCGGGUAGGGCGGUCCAAGUGAUUCCUGUGGCUCAGCUUCCCGAAUAGAGCUGGGAGCUGGCGUGAUCUCAGCUCGCUGCAACCUCCGCCUCCCAGAGACGGAGUUUCGUCAUGUUGGCCAGGCCCAUUUGAGAUCUUUGAAGAUAUCCUCAACGUGAGGCUCUGCUGCCAUGAAGGUGAAGAUUAAGUGCUGGAACGGCGUGGCCACUUGGCUCUGGGUGGCCAACGAUGAGAACUGUGGCAUCUGCAGGAUGGCAUUUAACGGAUGCUGCCCUGACUGCAAGGUGCCCGGCGACGACUGCCCGCUGGUGUGGGGCCAGUGCUCCCACUGCUUCCACAUGCAUUGCAUCCUCAAGUGGCUGCACGCACAGCAGGUGCAGCAGCACUGCCCCAUGUGCCGCCAGGAAUGGAAGUUCAAGGAGUGAGGCCCGACCUGGCUCUCGCUGGAGGGGCAUCCUGAGACUCCUUCCUCAUGCUGGCGCCGAUGGCUGCUGGGGACAGCGCCCCUGAGCUGCAACAAGGUGGAAACAAGGGCUGGAGCUGCGUUUGUUUUGCCAUCACUAUGUUGACACUUUUAUCCAAUAAGUGAAAACUCAUUAAACUACUCAAAUCUUGCUGGAGGCCUCUGGGUGCCUGUGUUCUCGGCAUAUAGAUGUGGUCUCGGUGUGUUUUGAUAUGAAAACUCUCAUGAAUAAACAUCUCCGUGAAACGCCAAGGCCCUCGUCAAACCCUGAGUCAUGACUGGGAGGAGAAGGAGCAGGAUCAGACGGUAGAGCCUGGGGCAUGCUCUUCAGGCAUGCUCUUGCCUGCUGGAUUGCCGGCGGCGGCCCUGGGACCCUCCCUCAGGCUGGCUCUGAGGGACCCUGGCUGUGCAAAGCUGGCGGCCACUGCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-423.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -437.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.(((.(((((((....)))))))((.(((((.((((((((((((((......((((((....)))))).........))))((((.((((.((.(((((((((....((((((((((..(((((((((((((((..((((((((.(((((((........)))))))(((((((.(....))))))))((((((..(((.(((.(((((((.(.((((...(((((((((.(((((((((((((((((((....))))...))))).))).)))(((..((((.....)))).))).......))))..))))))))).)))).)))))))).))).......)))...))))))..))))))))...)))))...))..))))))))..)))).((((((((((((.....)))).(((((.((.(((((..((((((....(((((((..(((...)))((((.....(((.(((((....((((.(((....)))))))....))))).))))))).)))))))....)))))).))))).))))))).(((....)))))))).)))......))))))....)).))))))).)).))))))))))))))))))))))))).(((((.((((((((((((.((.......)).)))))))).....)))).))))).(((((.........))))).................((..((((((((.....(((((.(((...((((..(((((......((((.(((((.((((((((((......)))))..(((((............))))).))))).)))))..)))).....))))).))))))).)))))......))))))))..))((((((.((..((((((((((.....)))))))))).))))))))...(((((((.((((((..(((....(((((((((.....)))))))))))).)))))).....)))))))))).)).)..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(({((({{((((((,,..||}}}}},,.{,((({(((((,(((((,((((((({(((((({{{.,,}))).........(((,(((((,(,,.((..(((,,.)}}..}),,,),||||}.||||||||||,,,,|}}||||(((({{((((((........)))))))(((((((.,....})))))))|||||{..{{{,(((.(((((((.(.((((...(((((((((.(((((((((((((((((((....}}}}..,|||}}.})),))}|||..,(((.....)))},))),,..,,,))))..))))))))).)))).)))))))).))),,..,..)})..{||,|||{{|||||||,.{{|||||...})},))))})}}..)))).||||||||||||,},..})))}||||||((,(((|(||{(|,,,}}}}|||||||,|{{{...))}}||,,.,{(((({((,{({{{{((((({((,{..}},)))){{{{.|,||{||||{|{{,||||||{..,|||||,.}||||.,||,|||.{{{}}}}),,))))}})))..}}}}))))))}...(({(({{{{..,||||||||||||||||||||},|||||.(({((,((((((((((((.((.......)).))))))),.,,.|}|||.|||||.{{,,,.....,,,,})))),................,,..{{{|||{|,.,,.{{||{,|||}|..{||,,|||||,,....((((.({(({,(({((((((,..,{{{|,,,,..|||||...,,}},,..,)),)).))))).})))),.}}}}....,|}}}}.}}}}))).))})).....,))))))))..},((((((.((..((((((((((.....)))))))))).))))))))...,||||||}||||||.}|||....(((((((((.....}))))))))})),))))))})...,,}}))))))})).,..
Back