Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001291469.2

Sequence Length

851 nt

GC Content

0.4912

AGCACAGGACACAGCUAGGUUCUGAAGCUUCUGAGUUCUGCAGCCUCACCUCUGAGAAAACCUCUUUGCCACCAAUACCAUGAAGCUCUGCGUGACUGUCCUGUCUCUCCUCGUGCUAGUAGCUGCCUUCUGCUCUCUAGCACUCUCAGCACCAAUGGGCUCAGACCCUCCCACCGCCUGCUGCUUUUCUUACACCGCGAGGAAGCUUCCUCGCAACUUUGUGGUAGAUUACUAUGAGACCAGCAGCCUCUGCUCCCAGCCAGCUGUGGUCUAAAUCCAGUGAGUGGAAGUUACAGGGAGUCUGCUUCCAGUGCUGCUCCGGGAAGGAUCCCAUCCACCAGAGCUGCCCCACAUGGACCAUGGUCAGGCAGAGGAAGAUGCCUACCACAGGCAAGGGAUAAAGCCAGAUGACCUCAAAGGUCCCAUGGGAUUCUAAUCUGUCUGCUCCUUGUUCUACGGAUUCCAAACCAAAAGAGGCAAGCAAGUCUGCGCUGACCCCAGUGAGUCCUGGGUCCAGGAGUACGUGUAUGACCUGGAACUGAACUGAGCUGCUCAGAGACAGGAAGUCUUCAGGGAAGGUCACCUGAGCCUGGAUGCUUCUCCAUGAGCCGCAUCUCCUCCAUACUCAGGACUCCUCUCCGCAGUUCCUGUCUCUUCUCUUAAUGUAAUCUCUUUUAUGUGCUGUAUUAUUGUAUUAGGUGUUAUUUCCAUUAUUUAUAUUAGUUUAGCCAAAGGAUAAGUGUCCCCUAUGGGGAUGGUCCACUCUCACUCUUUCUCUGCUGUUGCAAAUACAUGGAUAACACCGUUAAUUCCAUGUGUUUUCAUAAUAAAACUUUAAAAUAAAAUGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-269.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -283.75

Frequency: 0.0000

Diversity: 189.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((........)))))).(((..((.((((((((.(((((...((((.(......((((((((.......(((((.(((((((.(((..((((((.((((.....(((((((.(((........)))..)))))))...((((((...((((..(((((..((((......((..(((((((((((...(((((((....)))))))......((((((...)))))).((((((.((((..(((....)))...)))))))))).......))))).))))))..)))))))))))..))))))))))....))))))))...))..))))))))))......)))))....((((.(((((........)))))))))..))))))))......))))).(((((...)))))...(((......(((((((..((.....))...))))))).....)))...)))))..))).(((......)))(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...))))).))..))).(((((((((((.(.....(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))).....))))..))))))...))).)))..).))))))))))).......((((((......))))))((((.((((.((((...((((.......))))...)))).)))).))))....((((...(((((((...)))))))))))................(((....)))((((((((((((((...))))..)))))))))).........................)))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(({((((((.{{{..,{|||,,,.|||}.||},||||||{.{{(((,....}}}|......,{,{{(({{{{{...(((((.(((((((.(((..{(((((.((({.....(((((((.(((........)))..)))))))...((((((...((((..(((({.,((({.,,,{,((,,({{(({(({{{...(((((((....))))))).....,((((((...}))))),((((({,((((..{{(,,..})),..)))))))))).....,,)))}),))}}}}..}})))))))))..))))))))))....))))))))}..}}..))))))))))......}))))....))))..||||||||{{{,(((((.....))))),((({....,{((,,.(((((...)))))...|||,.,,..,{{{{({..((.....)}...}})))}}.....,,...,||||}..||}.{{{,,.,,,}}}(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...}},}},||..})),(((((((((((.,,,.,.(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))),....})))..))))))...))),))),.),)))))))))))........,{,,{..,,,,}},||.((((.((((.((((...((((.......)))}...)))).)))).))))},..((({...(((((((...))))))}))))........}}}}))}}}}}},.{|,{((((((((((((((...))))..))))))))))}.,,.....................}))...