Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001291470.2

Sequence Length

1253 nt

GC Content

0.5116

AGCACAGGACACAGCUAGGUUCUGAAGCUUCUGAGUUCUGCAGCCUCACCUCUGAGAAAACCUCUUUGCCACCAAUACCAUGAAGCUCUGCGUGACUGUCCUGUCUCUCCUCGUGCUAGUAGCUGCCUUCUGCUCUCUAGCACUCUCAGCACCAAUGGGCUCAGACCCUCCCACCGCCUGCUGCUUUUCUUACACCGCGAGGAAGCUUCCUCGCAACUUUGUGGUAGAUUACUAUGAGACCAGCAGCCUCUGCUCCCAGCCAGCUGUGGUGUGAGUAUCAACCCCUGGCUGCCCUGGGAGGCAAGGGUGAGGGCUGGAUUUUUAAAGGGGGCCUGUUUUGGGGAGGGGGUGAUGAGCGUUGGGGAGGCAGCUCUCAGGGCUGAAGCCUUCCCUGACAGCAGUGAGGUCACAGGUCAUGAACUCACUUUUCAAGUGCUGAAGGCGGCUGAGUGGCAGCCGAGACAGAAGGGGGUUCCUGGGGAGGAAGUUAUUCAGAGGACAGGGAAGCAGGGGAAGGCAGACAGGUCCCGUGAGAUAUGGACCAAUUCCUUAAACCAUGCUAGAAAAACAUGUGGAAAAGUCACUACCAGGCUGGCAGGGAAUGGGGCAAUCUAUUCAUACUGAUUGCAAUGCCCACUGGUUCCUAAUCUGGGCAACCCCUGGGGCCCACAGCUAAAUCCAGUGAGUGGAAGUUACAGGGAGUCUGCUUCCAGUGCUGCUCCGGGAAGGAUCCCAUCCACCAGAGCUGCCCCACAUGGACCAUGGUCAGGCAGAGGAAGAUGCCUACCACAGGCAAGGGAUAAAGCCAGAUGACCUCAAAGGUCCCAUGGGAUUCUAAUCUGUCUGCUCCUUGUUCUACGGAUUCCAAACCAAAAGAGGCAAGCAAGUCUGCGCUGACCCCAGUGAGUCCUGGGUCCAGGAGUACGUGUAUGACCUGGAACUGAACUGAGCUGCUCAGAGACAGGAAGUCUUCAGGGAAGGUCACCUGAGCCUGGAUGCUUCUCCAUGAGCCGCAUCUCCUCCAUACUCAGGACUCCUCUCCGCAGUUCCUGUCUCUUCUCUUAAUGUAAUCUCUUUUAUGUGCUGUAUUAUUGUAUUAGGUGUUAUUUCCAUUAUUUAUAUUAGUUUAGCCAAAGGAUAAGUGUCCCCUAUGGGGAUGGUCCACUCUCACUCUUUCUCUGCUGUUGCAAAUACAUGGAUAACACCGUUAAUUCCAUGUGUUUUCAUAAUAAAACUUUAAAAUAAAAUGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-451.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -472.60

Frequency: 0.0000

Diversity: 248.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((........)))))).(((..((.((((((((.(((((...((((.(......((((((((.......(((((.(((((((.(((.(((((((.(((.(((((...((((.((((.(((((((.((((..((.((.(((((((...((((((((..(((((((...((..(((.(((((........(((((((....)))))))...(((((((((...))))))))).(((((.((((.(((((((((.((((((.((.((........)))).))))))..)))))).))).))))....)))))......))))).)))..))....))))))).....)))))((((((((((((((((...)))))...))).))))))))...((((((.(((.......))).))))))..))).)))))))))))(((((.....)))))))))))))))).)))).)))).)))))))......).)))))))(((((((..(((((.(((((.(((((..........)))))....(((....((.((((((........((((.....)))).......))))))))....)))((((((..........))))))..((((((..((((...))))))))))..(((((..((((((.(((......)))..))))..))..))))).))))))))))..))))..)))((((....))))...))))))))))......)))))....((((.(((((........)))))))))..))))))))......))))).(((((...)))))...(((......(((((((..((.....))...))))))).....)))...)))))..))).(((......)))(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...))))).))..))).(((((((((((.(.....(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))).....))))..))))))...))).)))..).))))))))))).......((((((......))))))((((.((((.((((...((((.......))))...)))).)))).))))....((((...(((((((...)))))))))))................(((....)))((((((((((((((...))))..)))))))))).........................)))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(({((((((.({{..,{|||,,,.|||}.||},||||||{.{{(((,....}}}|.....,{{{{{(({{{{{...(((((.(((((((.(((.(((((((.{,,,(((((...((((.((((.(((((((.((((..((.((.(((((((...{{,(((((..(((((((.,.((..(((.(((({........(((((((....)))))))...{((((((((...))))))))}.(((((.{(((.(((((((((.((((((.((.((,.....,.)))),})))))..))))))}})).))))....)))))......})))).)))..))...,)))))))..,..)))))((((((((((((((((...))))),..))))))))})))...((((((.{((.......))}.))))))..,}}.)))))))))))(((((.....)))))))))))))))).)))).)))).)))))})......,.)))))))(((((((,.(((({{(((((.(((((,(({...,}})))))....(((....((.((((((........((((.....)))).......))))))))....)))((((((..........))))))..((((((..(((,...})))))))))..(((((..((((((.(((......)))..))))..))..))))).))))))))))..)})),,)))((((....))))...))))))))))......}}}))..,,))))..||||||||,,{,(((((.....))))},((({....,{((,,.(((((...)))))...|||,.,,..,{{{{{{..((.....}}...}}}))}}.....,,...,|||}},.||,.{||,,,,,,}}}{{{((.,.,..)))))((((((.(((....)))..))))))...}},}},||..})},(((((((((((.,,,.,.(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))),....})))..))))))...))),))),.),)))))))))))........,{,,{.,,,,,}},||.((((.((((.((((...((((.......)))}...)))).)))).))))}}.,((({...{((((((...))))))}))))........},}}}}}}}}}},.{|,{((((((((((((((...))))..))))))))))}.,,.....................}))...