Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001291471.2
Sequence Length
831 nt
GC Content
0.4922
AGCACAGGACACAGCUAGGUUCUGAAGCUUCUGAGUUCUGCAGCCUCACCUCUGAGAAAACCUCUUUGCCACCAAUACCAUGAAGCUCUGCGUGACUGUCCUGUCUCUCCUCGUGCUAGUAGCUGCCUUCUGCUCUCUAGCACUCUCAGCACCAAUGGGCUCAGACCCUCCCACCGCCUGCUGCUUUUCUUACACCGCGAGGAAGCUUCCUCGCAACUUUGUGGUAGAUUACUAUGAGACCAGCAGCCUCUGCUCCCAGCCAGCUGUGGUUUACAGGGAGUCUGCUUCCAGUGCUGCUCCGGGAAGGAUCCCAUCCACCAGAGCUGCCCCACAUGGACCAUGGUCAGGCAGAGGAAGAUGCCUACCACAGGCAAGGGAUAAAGCCAGAUGACCUCAAAGGUCCCAUGGGAUUCUAAUCUGUCUGCUCCUUGUUCUACGGAUUCCAAACCAAAAGAGGCAAGCAAGUCUGCGCUGACCCCAGUGAGUCCUGGGUCCAGGAGUACGUGUAUGACCUGGAACUGAACUGAGCUGCUCAGAGACAGGAAGUCUUCAGGGAAGGUCACCUGAGCCUGGAUGCUUCUCCAUGAGCCGCAUCUCCUCCAUACUCAGGACUCCUCUCCGCAGUUCCUGUCUCUUCUCUUAAUGUAAUCUCUUUUAUGUGCUGUAUUAUUGUAUUAGGUGUUAUUUCCAUUAUUUAUAUUAGUUUAGCCAAAGGAUAAGUGUCCCCUAUGGGGAUGGUCCACUCUCACUCUUUCUCUGCUGUUGCAAAUACAUGGAUAACACCGUUAAUUCCAUGUGUUUUCAUAAUAAAACUUUAAAAUAAAAUGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-264.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -277.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 175.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((........)))))).(((..((.((((((((.(((((...((((.(......((((((((.......(((((.(((((((.(((..((((((.((((.....(((((((.(((........)))..)))))))...((((((...((((..(((((..(((((((((..((((((...........(((((((....)))))))...(((((((((...)))))))))...(((((...)))))...)).)))).))))).....)))))))))..))))))))))....))))))))...))..))))))))))......)))))....((((.(((((........)))))))))..))))))))......))))).(((((...)))))...(((......(((((((..((.....))...))))))).....)))...)))))..))).(((......)))(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...))))).))..))).(((((((((((.(.....(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))).....))))..))))))...))).)))..).))))))))))).......((((((......))))))((((.((((.((((...((((.......))))...)))).)))).))))....((((...(((((((...)))))))))))................(((....)))((((((((((((((...))))..)))))))))).........................)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({((((((.{{{..,{|||,,,.|||}.||},||||||{.{{(((,....}}}|......,{,{{(({{{{{...(((((.(((((((.(((..{(((((.((({.....(((((((.(((........)))..)))))))...((((((...((((..(((({.{(((((((((..((((((...........(((((((....)))))))...{((((((((...))))))))}...(((((...)))))...)),}))).))))).....)))))))))..))))))))))....))))))))}..}}..))))))))))......}))))....))))..||||||||{{{,(((((.....))))),((({....,{((,,.(((((...)))))...|||,.,,..,{{{{({..((.....)}...}})))}}.....,,...,||||}..||}.{{{,,.,,,}}}(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...}},}},||..})),(((((((((((.,,,.,.(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))),....})))..))))))...))),))),.),)))))))))))........,{,,{..,,,,}},||.((((.((((.((((...((((.......)))}...)))).)))).))))},..((({...(((((((...))))))}))))........}}}}))}}}}}},.{|,{((((((((((((((...))))..))))))))))}.,,.....................}))...
Back