Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001291475.2
Sequence Length
841 nt
GC Content
0.4923
AGCACAGGACACAGCUAGGUUCUGAAGCUUCUGAGUUCUGCAGCCUCACCUCUGAGAAAACCUCUUUGCCACCAAUACCAUGAAGCUCUGCGUGACUGUCCUGUCUCUCCUCGUGCUAGUAGCUGCCUUCUGCUCUCUAGCACUCUCAGCACCAAUGGGCUCAGACCCUCCCACCGCCUGCUGCUUUUCUUACACCGCGAGGAAGCUUCCUCGCAACUUUGUGGUAGAUUACUAUGAGACCAGCAGCCUCUGCUCCCAGCCAGCUGUGGUUGAGUGGAAGUUACAGGGAGUCUGCUUCCAGUGCUGCUCCGGGAAGGAUCCCAUCCACCAGAGCUGCCCCACAUGGACCAUGGUCAGGCAGAGGAAGAUGCCUACCACAGGCAAGGGAUAAAGCCAGAUGACCUCAAAGGUCCCAUGGGAUUCUAAUCUGUCUGCUCCUUGUUCUACGGAUUCCAAACCAAAAGAGGCAAGCAAGUCUGCGCUGACCCCAGUGAGUCCUGGGUCCAGGAGUACGUGUAUGACCUGGAACUGAACUGAGCUGCUCAGAGACAGGAAGUCUUCAGGGAAGGUCACCUGAGCCUGGAUGCUUCUCCAUGAGCCGCAUCUCCUCCAUACUCAGGACUCCUCUCCGCAGUUCCUGUCUCUUCUCUUAAUGUAAUCUCUUUUAUGUGCUGUAUUAUUGUAUUAGGUGUUAUUUCCAUUAUUUAUAUUAGUUUAGCCAAAGGAUAAGUGUCCCCUAUGGGGAUGGUCCACUCUCACUCUUUCUCUGCUGUUGCAAAUACAUGGAUAACACCGUUAAUUCCAUGUGUUUUCAUAAUAAAACUUUAAAAUAAAAUGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-269.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -282.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((........)))))).(((..((.((((((((.(((((...((((.(......((((((((.......(((((.(((((((.(((..((((((.((((.....(((((((.(((........)))..)))))))...((((((...((((..(((((..((((.......((((((..((((.....(((((((....)))))))......((((((...))))))))))..)))))).(((((((..(((((....)))))))))))).......)))))))))..))))))))))....))))))))...))..))))))))))......)))))....((((.(((((........)))))))))..))))))))......))))).(((((...)))))...(((......(((((((..((.....))...))))))).....)))...)))))..))).(((......)))(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...))))).))..))).(((((((((((.(.....(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))).....))))..))))))...))).)))..).))))))))))).......((((((......))))))((((.((((.((((...((((.......))))...)))).)))).))))....((((...(((((((...)))))))))))................(((....)))((((((((((((((...))))..)))))))))).........................)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({((((((.{{{..,{|||,,,.|||}.||},||||||{.{{(((,....}}}|......,{,{{(({{{{{...(((((.(((((((.(((..{(((((.((({.....(((((((.(((........)))..)))))))...((((((...((((..(((({.,((((.......((((((..((((.....(((((((....)))))))......{(((({...})))))))))..)))))).(((((((..(((((....)))))))))))).,.....)))))))))..))))))))))....))))))))}..}}..))))))))))......}))))....))))..||||||||{{{,(((((.....))))),((({....,{((,,.(((((...)))))...|||,.,,..,{{{{({..((.....)}...}})))}}.....,,...,||||}..||}.{{{,,.,,,}}}(((((......)))))((((((.(((....)))..))))))...}},}},||..})),(((((((((((.,,,.,.(((.(((...((((((..(((((((..(((...)))..))),....})))..))))))...))),))),.),)))))))))))........,{,,{..,,,,}},||.((((.((((.((((...((((.......)))}...)))).)))).))))},..((({...(((((((...))))))}))))........}}}}))}}}}}},.{|,{((((((((((((((...))))..))))))))))}.,,.....................}))...
Back