Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001293085.2

Sequence Length

1836 nt

GC Content

0.4346

GAUGAGUCCUAGGAGGCGCUGGCUCUUUGGCGGCUCGGAGGAGCGGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGGUGGCCCCUUUGCAGAAUGAGCCUCGCAGGCAGUCACCGUUCUGUCAACUGAGAGGAGGAGCCCGCUUUGGUAGUGCUGUCCUUAUGGCAAGAAUAUAUAGAAGUUGGAGGGAAGAUAAACUCUCUUCUGGAUGUCUGAGAUGUAUUGCUGUCCUUGAAUAUUAGCCCAUUUGAAAACGCCUGGGAAGUUCAGCCAUCAGUAUGUCCAAGUACAAACUUAUUAUGUUAAGACAUGGAGAGGGUGCUUGGAAUAAGGAGAACCGUUUUUGUAGCUGGGUGGAUCAGAAACUCAACAGCGAAGGAAUGGAGGAAGCUCGGAACUGUGGGAAGCAACUCAAAGCGUUAAACUUUGAGUUUGAUCUUGUAUUCACAUCUGUCCUUAAUCGGUCCAUUCACACAGCCUGGCUGAUCCUGGAAGAGCUAGGCCAGGAAUGGGUGCCUGUGGAAAGCUCCUGGCGUCUAAAUGAGCGUCACUAUGGGGCCUUGAUCGGUCUCAACAGGGAGCAGAUGGCUUUGAAUCAUGGUGAAGAACAAGUGAGGCUCUGGAGAAGAAGCUACAAUGUAACCCCGCCUCCCAUUGAGGAGUCUCAUCCUUACUACCAAGAAAUCUACAACGACCGGAGGUAUAAAGUAUGCGAUGUGCCCUUGGAUCAACUGCCACGGUCGGAAAGCUUAAAGGAUGUUCUGGAGAGACUCCUUCCCUAUUGGAAUGAAAGGAUUGCUCCCGAAGUAUUACGUGGCAAAACCAUUCUGAUAUCUGCUCAUGGAAAUAGCAGUAGGGCACUCCUAAAACACCUGGAAGGUAUCUCAGAUGAAGACAUCAUCAACAUUACUCUUCCUACUGGAGUCCCCAUUCUUCUGGAAUUGGAUGAAAACCUGCGUGCUGUUGGGCCUCAUCAGUUCCUGGGUGACCAAGAGGCGAUCCAAGCAGCCAUUAAGAAAGUAGAAGAUCAAGGAAAAGUGAAACAAGCUAAAAAAUAGUCUUUCUCAACUGUUGGCUAAGAAGAAAUGCAAAAGAAGUGGCAUAGGAGUGUGUUAUGGGUGCUGAACUCUCUCUCUUUUUCCCCGAUUUUCCAGAGCUAGGCUGUGGAGUAGAGUUUGUAUAGGUAACUAGGUAACUUAUUGUGGCCCAGAUAAGGCUUUAGGAUGCCUCAGUGCUUAUGUCAUAGCCUUAUGAGUUAGCUUUCUUGCUAGCCCCCUAGUCGGUCACCAAACUAGUAACUAGUGGGGCUUAAUGAAGGUCAUAAGUUUCUGAGAUGGGAGAGCAACAAGUAGAGAUGAAGUUAAAGGUAUUUAUCAUUCAAGAAAUCAUUAUUGAGUCACCAUUGACAGGCACUAUUCUAAUCAGUAGUUCACUUUAAUAUUUAAUAAGAUUUUCUGGGAUAACAGUAAGGGAUAUUAGAUAAUAUACCGUAUGUAUUUAUUACUAGUCUUUUCCUCUAGGAAAAGGGAUACUUUGAUAAUUAAGGCCAGAGGCCCAUUAGUUGAGAAAGUCACAGAUAUAUUUCUCCAAGAAAGCCAACAACCACCACCACAAUGACAGAAAUGACAACAAGGCCCUUUAACUUGUCUUCUAGUUUAGAGACAUCCUUCAUUUGACAUUUAGUAGAAUUCCUCUUUGGCCACAAGAAUAAGCAGCAAAUAAACAACUAUGGCUGUUGAGGUUCUCAUUUUGGUUUGUUUUAAUUUUUUGAACUUUGGGUACCUGUAAUUAGUUUAAAAAUAAAGUUCCUGAUAAUAAAGUGACUGAAAAUGGCAUCCCCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-522.14 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -559.44

Frequency: 0.0000

Diversity: 637.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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