Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001302689.2

Sequence Length

1144 nt

GC Content

0.6897

AGAGACGACCCGACCCGCUAGAAGACUGGCCAAUCACAGGCAGGAAGAUGAAGGUUCUGUGGGCUGCGUUGCUGGUCACAUUCCUGGCAGGAUGCCAGGCCAAGGUGGAGCAAGCGGUGGAGACAGAGCCGGAGCCCGAGCUGCGCCAGCAGACCGAGUGGCAGAGCGGCCAGCGCUGGGAACUGGCACUGGGUCGCUUUUGGGAUUACCUGCGCUGGGUGCAGACACUGUCUGAGCAGGUGCAGGAGGAGCUGCUCAGCUCCCAGGUCACCCAGGAACUGAGGGCGCUGAUGGACGAGACCAUGAAGGAGUUGAAGGCCUACAAAUCGGAACUGGAGGAACAACUGACCCCGGUGGCGGAGGAGACGCGGGCACGGCUGUCCAAGGAGCUGCAGGCGGCGCAGGCCCGGCUGGGCGCGGACAUGGAGGACGUGUGCGGCCGCCUGGUGCAGUACCGCGGCGAGGUGCAGGCCAUGCUCGGCCAGAGCACCGAGGAGCUGCGGGUGCGCCUCGCCUCCCACCUGCGCAAGCUGCGUAAGCGGCUCCUCCGCGAUGCCGAUGACCUGCAGAAGCGCCUGGCAGUGUACCAGGCCGGGGCCCGCGAGGGCGCCGAGCGCGGCCUCAGCGCCAUCCGCGAGCGCCUGGGGCCCCUGGUGGAACAGGGCCGCGUGCGGGCCGCCACUGUGGGCUCCCUGGCCGGCCAGCCGCUACAGGAGCGGGCCCAGGCCUGGGGCGAGCGGCUGCGCGCGCGGAUGGAGGAGAUGGGCAGCCGGACCCGCGACCGCCUGGACGAGGUGAAGGAGCAGGUGGCGGAGGUGCGCGCCAAGCUGGAGGAGCAGGCCCAGCAGAUACGCCUGCAGGCCGAGGCCUUCCAGGCCCGCCUCAAGAGCUGGUUCGAGCCCCUGGUGGAAGACAUGCAGCGCCAGUGGGCCGGGCUGGUGGAGAAGGUGCAGGCUGCCGUGGGCACCAGCGCCGCCCCUGUGCCCAGCGACAAUCACUGAACGCCGAAGCCUGCAGCCAUGCGACCCCACGCCACCCCGUGCCUCCUGCCUCCGCGCAGCCUGCAGCGGGAGACCCUGUCCCCGCCCCAGCCGUCCUCCUGGGGUGGACCCUAGUUUAAUAAAGAUUCACCAAGUUUCACGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-570.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -587.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 214.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((.....((..(..((..(((((((((.......)))...........((((((((..(((((.(((((..((((...(((((((...))))))).....))))))))))))))....))))))))(((((..((((.((.(((((.((((.((((.(((..((((....))))....))).)))).)))))))..........((((((((..((.(((((...))))).)).)))))))).)).)).)))).)))))..((((.(((((((...((.(((.(((((.....((.((.(.((....)).).)).))....))))).(((((.((.........))))))).(((((((...((((((..((((((((((....((((.((((.((((......(((((.(((((..(.....)..))))).)))))((((((((((.(.(((.((((...((((((.((...(((((.(..((...(((((((((((((.(((...)))..)))...((((((...)))))).)))))))))).))..)))))))).))))))....))))))).).))))))))))(((.((((....)))).))).)))).)))))))).(((((((((.(((((.(((((((.((((((....((.(((....))).)).)))))).)))).))).)))..((.(((((((.(.(...(((((....)))))...))))))))))))).)))))))))......))))))))))..))))))..(((((.....))))).((((((((((((((..((..((((....((((.(((.((((((...........))))))((((.(.(((((...)))))))))).....(((((((((.((((((((((............)))))).)))))))))))))((.(..(((((.((.((((...)))))).)))))..))).(((..(((.((...)).)))..))).....))).))))..))))..))..)))))))...)).))))).)))))))(((...))).(((((.(((...))))))))....))).)).)))))))...)))).))))))..))..)..)).....))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((..,{.{{..,(((({....||}||,..,,...|||{{{,.,.,,..((((((((..(((((.(((((..((((...(((((({...})))))).....))))))))))))))....)))))))),..(({{(.,({((.,,.||}|,{|,,{,|}|(((((((({{{.|||{{...)))}),)),)))))))}}||||....((((((((..((.(((((...))))).}).)))))))).{{{(((,||||||}||,,((((.((((({,..,|,||{({{{{((((......))))...||,,}||....{|,.......},.(((((.((.........))))))).(((((((...((((((..((((((((((....((((.((((.((((......(((((.(((((..(.....)..))))).)))))((((((((((.(.(((.((((...((((((.((...(((({,(..((...(((((((((((((.(((...)))..)))...((((({...}))))).)))))))))).))..)))))))).))))))....))))))).).))))))))))(((.((((....)))).))).)))).)))))))).(((((((((.(((((.(((((((.((((((..,.((.(((....))).)),)))))}.)))),))}.)))..({((((((((.,.{...(((((....)))))...},))))))))})).)))))))))......))))))))))..))))))..(((((.....))))).((((((((((((((,.(({,(((({...,((({(((.((.((({..((((......)))).}}}}..,|||}}}}))})}}}}||{....(((((((((.((((((((((............)))))).))))))))))))),|.,..((((((((((,,({(((((({{((.,......))))))))}{|{.,,..,.,}}..})),,.}}))))))})}.,))),})},.)))))))...))}})))).)))))))|||}},}}}.(((((.(((...)))))))),,))),}))))))))))}|||||}}.,|,,,,..,,..}.,)},,,..))))).....