Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001305017.2

Sequence Length

662 nt

GC Content

0.4109

GUGGUUAUCACAUUAAUUCGUGCCUCAAUGAAUGAAUGAAUGGACAAACACAGGCCGGGAGCCUGACCCACUUCCCUCUUCCCUCCCGGGACCCACUGCUCCAGGAUUGGGCGAACCUCAGGCAGAGGUGGAGGAAACCUUAAAGAGGAUCCAGAGUCAUAAAGGGGUUAUUGGAACUAUGGUUGUAAAUGCAGAAGGUAUUCCCAUCCGAACAACCUUGGACAACUCAACAACUGUUCAAUAUGCAGGCCUUCUUCAUCACCUGACAAUGAAAGCCAAAAGCACAGUUCGUGAUAUUGAUCCUCAGAACGACCUGACUUUUCUUAGGAUCAGAUCAAAGAAACAUGAAAUCAUGGUAGCUCCAGAUAAGGAAUAUCUUCUGAUCGUCAUUCAGAAUCCAUGUGAAUAGACCUGCGAUGGCCAAGGCUGUUUAAGCGACACUGGGUUGGAAACACUUGGCUCUCUCAUGAGUAUUAAAAUUCUAUUUCAAUCUAACUGACCCUUCAAACAUUCUUUUCUAUUUCUAUAUCUAAACUGUUCUGCAUGUCUCAUUUAGUCCCUUUUGAUUAUAUUGUGAAGUUGUACUUUAGUGAUACAAUAAGUGAAUUCUGGUAUAUACGUCUCUAUUGUCUUAUAAUACACAAAACCAAGGAUUCUACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-154.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -168.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 158.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((((....((((((......))))))((.((((((((((....((((.(((..((((((((((..(((....((((....))))............))).))))......))))))((((((((((((..((((...)))).)))(((((.....(((((((((((((................(((((((((((((....(((((....(((((((..........)))))))..(((.(((.(((....((....))....))).)))....)))..)))))((((.((((((((.((((...........)))).))))))))))))............(((.(((.....))))))..)))))))))))))...((((((((.(.....).))))).))).((.((.(((((((..(((((...((((.....)))).)))))))))))).)).)).((((......))))........))))).)))))))).....)))))..))))))))).........))).))))..)))).)))))).))................((((((...)))))))))))).....(((((((((((((......((...((((((...)))))).))...))).))))))).)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,.,(((((,...((((((......)))))),|,{(((((((((....((((,{{{..|||||{.,,,.,{{{{,..((((....))}}....,{{,.,,,)},.}))).,.,..}})))}{||||||{{(((..((((...)))).)))(((((.....(((((((((((((...,,,{,{,,.,{{,(((((((((((((.,{{{(({{....{((({{{..........)))))},..,{{.(((.(((.,..((....))....))).)))....}}}..}|||,((((.((((((((.((((.,.........)))).))))))))))))..},..|,||..,{|,||{.....}}})))..)))))))))))))...((((((((.{.....).))))).))).{(.((.(((((((..{{(((,{.(,,,....,}))},)}}}}))))))).)).}}.|{|{......,}}),},,,,,.))))).)))))))).....)))))..}}}}}}}}}.........}}).,,})..)))).)))))|,||......}}},......{(((((...}))))}))))))}.,,.(((((((((((((......(,...{{{{|,...)))}}}.,,...))),,)))))).)))..