Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001311.5
Sequence Length
672 nt
GC Content
0.6354
CUUUUGCCUCGGAACUGGACCCGGGAGACAUCACAGCGCUGGGCUAGGGGCGCGGCUUGAACUCGCCUAAAGAGCUGCGCCCUCUCAUCUCGCGCCUGCAGCCCGUGCCGCCCCAGCCGCUGCCGCCUGCACCGGACCCGGAGCCGUCAUGCCCAAGUGUCCCAAGUGCAACAAGGAGGUGUACUUCGCCGAGAGGGUGACCUCUCUGGGCAAGGACUGGCAUCGGCCCUGCCUGAAGUGCGAGAAAUGUGGGAAGACGCUGACCUCUGGGGGCCACGCUGAGCACGAAGGCAAACCCUACUGCAACCACCCCUGCUACGCAGCCAUGUUUGGGCCUAAAGGCUUUGGGCGGGGCGGAGCCGAGAGCCACACUUUCAAGUAAACCAGGUGGUGGAGACCCCAUCCUUGGCUGCUUGCAGGGCCACUGUCCAGGCAAAUGCCAGGCCUUGUCCCCAGAUGCCCAGGGCUCCCUUGUUGCCCCUAAUGCUCUCAGUAAACCUGAACACUUGGAAAACCUGUGUGUGUACAUGCGCGUGUGUGCUGGGGAGUGCCAAGGGAGCUGCAGUGGGGUCCUGGCAGCAGGCUCUGCCACCGGCGCCUGCUCUUCUGCUGCCCAUUGCCCUCCCCAGGGGGCCGUUCCAGGGUCUCAUAGGCGAGGGCUCCCUGUGCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-288.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -299.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((..(((...((((((.(((....))...((((.(((..(((((((((((((.............))))))))))).))..))).))))(((((((((.((((.((((((((((.(((((.(((((.(((((.((.((......))))..).)))).....(((((((((.((((.....))))((((((....)))))).((((((((.(((((((..(((.(((((...((((..(...(((((.....(.(........).)..))))).)..))))..))))).........(((.....((((((...(((((((.(..((((......((((((.(((........))).)))))).((((.((..........)).)))).....))))..).)))))))..))))))....)))...)))..))))))).))))))))...((.(((...))))))))))))))...........((((.....))))((((..((....)).)))))))))...))).))))).))))))).).))..).)).)))))))).)))))).((((((((((..((((...))))...))....))))))))....((((((((...((((((.......))))))...)).)))))))))..).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{((((..(({...((((((,{{{....,,.,.((((.(((..{((((((((((((.............))))))))))),}}..})),))))(((((((((.{(((.(((((((((({({{((.(((((.((((,,((.((......))||,.|.|}}}...{.(((((((((.((((.....))))((((((....)))))).((((((((.(((((((..(((.(((((...((((.,{...(((((...,.{.{.....,},},}..))))),}..))))..))))).........{{,.....((((((.,.(((((((.{..((((,{....((((((.(((........))).)))))).{{{{.,,..,,...{{,||.)}}},....))))..).))))))),,))))))....,}}...)))..))))))).)))))))),..{{.(((...)))}}))))))))),,,,.......((((.....))))((((..({....)}.)))))))}}...)))}).))).))))))).).))..}.)).))))))),.)))))).((((((((((.,((({...)))),,,))....})))))))....(((((({(...((((((.......))))))...)).))))))}))..).)))),
Back