Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001313905.1

Sequence Length

645 nt

GC Content

0.5922

CUAUCCAUUUCCUCCAGAAGAUGUCCAACAGUCACCAGUCUGGCAGCAGGGUGGGGCUUCCACUGCAGCCAUGUCACUCCUCUUGCUGGUGGUCUCAGCCCUUCACAUCCUCAUUCUUAUACUGCUUUUCGUGGCCACUUUGGACAAGUCCUGGUGGACUCUCCCUGGGAAAGAGUCCCUGAAUCUCUGGUACGACUGCACGUGGAACAACGACACCAAAACAUGGGCCUGCAGUAAUGUCAGCGAGAAUGGCUGGCUGAAGGCGGUGCAGGUCCUCAUGGUGCUCUCCCUCAUUCUCUGCUGUCUCUCCUUCAUCCUGUUCAUGUUCCAGCUCUACACCAUGCGACGAGGAGGUCUCUUCUAUGCCACCGGCCUCUGCCAGCUUUGCACCAGCGUGGCGGUGUUUACUGGCGCCUUGAUCUAUGCCAUUCACGCCGAGGAGAUCCUGGAGAAGCACCCGCGAGGGGGCAGCUUCGGAUACUGCUUCGCCCUGGCCUGGGUGGCCUUCCCCCUCGCCCUGGUCAGCGGCAUCAUCUACAUCCACCUACGGAAGCGGGAGUGAGCGCCCCGCCUCGCUCGGCUGCCCCCGCCCCUUCCCGGCCCCCCUCGCCGCGCGUCCUCCAAAAAAUAAAACCUUAACCGCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-222.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -234.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 164.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........(((.((((.(..(((((((.(((..(((....(((((.(((((((((((.(((((((((..............)))).)))))....)))))....))))))..........))))).....)))..))))))))))..).)))).)))......(((((((..((((((.((...)).))...))))...(((((......(((((((......(((((((((.(....(((((.((.....)).)))))....).)))))))))...))))).))............((((...(((((....(((((((((((..............)))).))).))))(((((((((...(((((.(((....))).(((.......))))))))(((((....(((((..........)))))...))))))))))))))..))))))))).))))).((((((((((.......((((((((((((((((.((((((.........)))))).)))))).)))....................)))))))(((((((.((...))))))))))))))))))).....))))))).........(((((.((.....................)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.........{{(,((((.{,,(((((((.(((..(((,...(((((.(((((((((((.(((({{(((,...{........,,}))})))))....}))))....}))))}..........))))).....)))..)))))))))),,|,|}}|.|||||.,{{,,{|||.,|||}}}}.|...,,},||...|{|,{{{.{|{{{,....(((((((......(((((((((.{....(((((.((.....)).)))))....}.)))))))))...))))).}}..,....,,},,))),))).,,||....{{{((((((((..............)))).)))}))))(((((((((...((({{.|{|....|||,{{{..|,...,)))))))(((((....(((({..........}))))...)))))))))))))),|||||,.|{.,,,((({(((((({(((..,,...((((((((((((((((.((((((.........,))))).)))))).)))............,......))))))))(((((((,({...)))))))))||}}}}}}}}|||...,,},))},,,,}}})),}.}},,.,,,,,................,))}))