Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001317.6
Sequence Length
821 nt
GC Content
0.5652
UAGGAUCCCAAGGCCCAACUCCCCGAACCACUCAGGGUCCUGUGGACAGCUCACCUAGUGGCAAUGGCUCCAGGCUCCCGGACGUCCCUGCUCCUGGCUUUUGCCCUGCUCUGCCUGCCCUGGCUUCAAGAGGCUGGUGCCGUCCAAACCGUUCCCUUAUCCAGGCUUUUUGACCACGCUAUGCUCCAAGCCCAUCGCGCGCACCAGCUGGCCAUUGACACCUACCAGGAGUUUGAAGAAACCUAUAUCCCAAAGGACCAGAAGUAUUCAUUCCUGCAUGACUCCCAGACCUCCUUCUGCUUCUCAGACUCUAUUCCGACACCCUCCAACAUGGAGGAAACGCAACAGAAAUCCAAUCUAGAGCUGCUCCGCAUCUCCCUGCUGCUCAUCGAGUCGUGGCUGGAGCCCGUGCGGUUCCUCAGGAGUAUGUUCGCCAACAACCUGGUGUAUGACACCUCGGACAGCGAUGACUAUCACCUCCUAAAGGACCUAGAGGAAGGCAUCCAAACGCUGAUGGGGAGGCUGGAAGACGGCAGCCGCCGGACUGGGCAGAUCCUCAAGCAGACCUACAGCAAGUUUGACACAAACUCGCACAACCAUGACGCACUGCUCAAGAACUACGGGCUGCUCUACUGCUUCAGGAAGGACAUGGACAAGGUCGAGACAUUCCUGCGCAUGGUGCAGUGCCGCUCUGUGGAGGGCAGCUGUGGCUUCUAGGUGCCCGAGUAGCAUCCUGUGACCCCUCCCCAGUGCCUCUCCUGGCCCUGAAGGUGCCACUCCAGUGCCCACCAGCCUUGUCCUAAUAAAAUUAAGUUGUAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-257.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -274.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((((((.((((((........(((((...((((((((((((.....(((.((((((((.((((..(......)..)))).....(((....)))...(((((((......)))....))))(((((((((((....................(((((...((.((.....)).)).)))))....))).)))))))).)))))))).)))......(((((((((.(((.......(((....))).((((((...((((......))))............)))))).))))))))))))..........((((((...)))))).......................)))))).))))))...)))))..((((...)))).(((..(((((((.......((((((((((((....((((......((.(((((...)))))..))...))))..)))......(((....)))))).))))))))).))))..)))....))))))..)))....((((....))))...(((((((..(.(((............((.((((((...)))))).)).......))).)..))))))).......((((((((.(((.(((..((((((.....(.(((...))).)....)))))).)))))).))))).))).....(((.(((((...(((((.((((((.(((.(((..(((..(((.(........)))))))..)))..))))))..))).))))).....))))).))))))))))))))...................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...(((((((((.(((((({.......(((((...((((((((((((....,(((.((((((((,((((..,..((..,..},.)..))}}|{....)}}.,,{{{{(((......)))....)))|(((((((((((....................||{{{...|{.,..,,..,|.},.})))}....))).)))))))),)))))))).))}......(((((((({,(((.......{{{...,))}.{{({({...{{,,..,,,.,,},....{{{{....,,)))).))))))))))))..........((((({...}))))).........,{,.......,,,.)))))).))))))...)))))..{({{...)}}|,(({,.(((((((,.,..||||({(.(((((,,,({((((,.....{,.(((({...)))))..))...))}),,)},,,..,||||}..}))}}),..}})..))).)))}..))).,.}))))))..)))..,.((((....}))}..,(((((((..{.({{,{,,,.......((.((((((...)))))).)).......})}.}..))))))},|.....{({(((((.(((.(((..((((((.....(.(((...))).)....)))))).)))))).))))).))).}},.(((.(((((.,,(((((.((((((.(((.(((..(((..(((.(........,))))))..)))..)))))),.))}.)))))...,,))))).))))))))))))))...................
Back