Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001317387.3
Sequence Length
5077 nt
GC Content
0.3746
ACUCUGGCUGGGGAAGGCAUGAGUGACAGACCCACAGCAAGGCGGUGGGGUAAGUGUGGACCUUUGUGUACCAGAGAGAACAUCAUGGUGGCUUUCAAAGGGGUCUGGACUCAAGCUUUCUGGAAAGCAGUCACAGCGGAAUUUCUGGCCAUGCUUAUUUUUGUUCUCCUCAGCCUGGGAUCCACCAUCAACUGGGGUGGAACAGAAAAGCCUUUACCGGUCGACAUGGUUCUCAUCUCCCUUUGCUUUGGACUCAGCAUUGCAACCAUGGUGCAGUGCUUUGGCCAUAUCAGCGGUGGCCACAUCAACCCUGCAGUGACUGUGGCCAUGGUGUGCACCAGGAAGAUCAGCAUCGCCAAGUCUGUCUUCUACAUCGCAGCCCAGUGCCUGGGGGCCAUCAUUGGAGCAGGAAUCCUCUAUCUGGUCACACCUCCCAGUGUGGUGGGAGGCCUGGGAGUCACCAUGGUUCAUGGAAAUCUUACCGCUGGUCAUGGUCUCCUGGUUGAGUUGAUAAUCACAUUUCAAUUGGUGUUUACUAUCUUUGCCAGCUGUGAUUCCAAACGGACUGAUGUCACUGGCUCAAUAGCUUUAGCAAUUGGAUUUUCUGUUGCAAUUGGACAUUUAUUUGCAAUAUAUUGGGUUGGGCCCAUCAUAGGAGCUGUCCUCGCUGGUGGCCUUUAUGAGUAUGUCUUCUGUCCAGAUGUUGAAUUCAAACGUCGUUUUAAAGAAGCCUUCAGCAAAGCUGCCCAGCAAACAAAAGGAAGCUACAUGGAGGUGGAGGACAACAGGAGUCAGGUAGAGACGGAUGACCUGAUUCUAAAACCUGGAGUGGUGCAUGUGAUUGACGUUGACCGGGGAGAGGAGAAGAAGGGGAAAGACCAAUCUGGAGAGGUAUUGUCUUCAGUAUGACUAGAAGAUCGCACUGAAAGCAGACAAGACUCCUUAGAACUGUCCUCAGAUUUCCUUCCACCCAUUAAGGAAACAGAUUUGUUAUAAAUUAGAAAUGUGCAGGUUUGUUGUUUCAUGUCAUAUUACUCAGUCUAAACAAUAAAUAUUUCAUAAUUUACAAAGGAGGAACGGAAGAAACCUAUUGUGAAUUCCAAAUCUAAAAAAAGAAAUAUUUUUAAAAUGUUCUUAAGCAAAUAUAUACCUAUUUUAUCUAGUUACCUUUCAUUAACAACCAAUUUUAACCGUGUGUCAAGAUUUGGUUAAGUCUUGCCUGACAGAACUCAAAGACACGUCUAUCAGCUUAUUCCUUCUCUACUGGAAUAUUGGUAUAGUCAAUUCUUAUUUGAAUAUUUAUUCUAUUAAACUGAGUUUAACAAUGGCAAAAUACAGUAUGUCACAGUCAUGCACAUUCAAGAGAGAAAAUAUAACAAGUUCUUUUAUGAGCAAUCCCUUAUGCAUAGACUACCUUGGCAAAAGAGCAUUAGCAAGUGUCACUGCUCAUCAGUUACUUCCUUCCAUUUAUAUCACAAAUACCCAAGUUUCAAUUCUAACUUCAUUUCAUGGUAUUUCUUCCUCCUCAAUGCCCAAGGUAAUGUGGGACUAAAGCCCAGAAAUUUGAAAAGAAUAUUCAGAAAUCCUUCCCAAAUCAUAAGGGCACCUAUUGAGAUUCAAGACAAGCAGACUCGUAAAAUCUUGUAGAGGCAGAGGCAAAGUUAUCAUCAUACAAAAAUCACAAACAAAAAGGAGAUCUGUAUUCGGGUAUCAAACGGUUGAUCUGUUUUCAGUGCACACCCUCAAAUGCACCACACCAGUUUUACGAUCUAAGCUUUUAACCCCUUUACCACUUUGCUUAUUUUUAAAAAAUUUAUUGGCAAAACUGGGGAUUUUGUUUGUAACUUUGGUUAUCUAUAUUUAAACAUUAGCUGAGACAUAUUUUUGAUAACAAGAACUUAGCUAGUUGAGUCCUGGCUUUUUGUUGAUUAUUAAGCUGUGUUCACUCUAGAAGGUGUAAAGGCCCUGUCCCAAUCUCUGCUCUCUCACUUCUCGUGACAUUUGUUGAUAAUCUUUACUGCAAGUGUAAUGAUAUUUGAGUGAAUUAAAAUGCAUGACAGACAAGGUACAACAUGGUUGCAGAAUAAAAGGGUGAGGACAUCAGAUCACUCUGUAUUCAAAGCUUACUAGACGAACAAUCUUUCAUUUCUGGAUAUAUUGUAGCUAACCCAACACAUUUUUAAACUAUUUUUGUUACUGACUCACUUACUUGUCAAAAUAAUUGGUUUUUCUGUCCUGCUUUGCCUUUUGUCACUAGAAUGUUCUCCAGAAACCCCAGUUUCUGUCAUCUUAACUGUCUAGUCUAGCCGUUAACUUAGACAAAGAAGUGCAAAUGUCAAUUUCACUAAACAAAAGCUAUUAGAAGUAAAGCAGAAACCUAUCACUGCAAGGAGUGACUUGUAAAUAACUGAUGAUCAAGGGCUGUCUUCUCUCAAGCAUGGUUCCAACUCUGUGUCACUUUUUAGCGUUAAUGGCAGUUGUGUGUCUGUGGCAGUGAGAUAAUGGACCACUAUUAAACCUGAUUCUCUUCGGUGCUAGGAAAGAGUGAUGUGUGAGAUUCCCAGAGAGUCGUCACACCAGUGUUAUGCCUGGGAGUGCCACUGGCAUACCGCAGGUGCCUAAAUCCCAGGCCCCUUUCUCAGGGGGCGUGGCCACACCACACACUGCGCCAGUGACACAUAGUUACUUCCUGGCUGGGACGGCACCUAUAGAAACUAGGGUACAAAUCUCCCAAAGAUGGUUUGCACCGUCAUUUCAAAUGUUUGCACAAUAUACCACUUAGAGGCUUAAAAUCAGGGUGGUUCAGUUCAAAAGGUAAUAUCAACCGUCAGCAAACAUGUCAGUUUAAAAAUAAGUUCGGUUAACAAGGAAGUGUUAAGCAGAUUUUUUGAAUACACUUACAAUAUACUGGCUUAUAAUCAUUUUUAUUCUGCCAUAUGGUUUAUUUCAUAUACACUCACUUUUACACUCACUUCCAAUUAUAGCAUUCAAUAAGUUACGGUUAAAGAAAAGUGAAUGGUGUUUUUGUAAUUUGUUUUCUAGUAGCUAGCAGAGAGCCUGGCACAUAGUAUGUAUUCAAAACAAGUGUGUUAAUUAAUAAAAAUAUAUAAAUCUCAUUUGAGAUUUAAGAAUAUAAAUAAUUUUCUUUUAAUCUUUAUUUUGCUCAAUAUUUAAUAGGAAGUAUGAUUUCAAGGACUACUAAAGGAAGGCAAUAUACAUGUGAAAACCAUAAAAUACAUUUUUUGCAUUCUACUAUUUUUAGGGGCAUGAAAUGAAUGAAAGCUUUAGCACUUUUUUGCCCCUACAUAUGAGACAACAUAUUUUGUAUUUCACUCAAGGCUCUGCCAGUAAAAAGUAAUGAAAUUGUACCUUUCUAAUGACAUCUAUGCAGCAGGGGUCUAUCGCCUUGUGGAUGGCACCAAAUUAUCCAAGUGUAUUAGGAGACUGGGGCUUUUUUCUUUAAUCCCUUCUUAUUAAUGAAGUGCAUAGUGCUGCUCCCAGGAGACCACUGCUGACAGAUACACAGAGAAGAGAUCAGAGAGGAAAAACUGGGAAGACAUAAAUGAAUUAUACCCAGCCAUGAAACAAUGCCAACUGUCUCUUCCCUAAGGAAGAGUACAAGUACCCUAAAAUUGAAAGGUGGUCCCUACACUGAAAACGCACAUAGUUUGUCAAAAGUGUACAAAAGGGAAAGAGUCUUAUUUUAAGCUUUCAGGCUUUCUUAAAAACUUGGGGACCAGAAUUUCAAUGUAUGUUUCCAUUGUUGAAGAUAACAUUUUCUUCAAAGAGCCUUAACCUUUUGUACUGGAAGGAAAUAUUUUCUGGACUUAAGUAGUUGCCUAAAUUUAAGAUUCCUACACUUUAUUUCUGCCAUUGAUGCUUUUCCUAAACCCUUAUACUAUCUUUUUAUUAUCUGAGCCUUUUCCUAAUGCAGCUCAUAGGUGCUAGCUAGAGCUGCUGCUCAGUAUUGAAGACUUUACAAGGAGAUUAGAAAUCUUUGGAAAACAUAUGUGAUGAAAUUGAGCUAUAUGAUUUAUCAGAGAUCUGAUUCCAAAGAGCACAGAAUACUGUUCUCAGACCAUGAAACCAGACAACACAUGUAUUGGUUUAAACUCGAUAAUGACAGGAAAAUUCCAAACUAGAGCAGUAAAUUCAAAUGGUAAGAUGAAUCCUAGAAGGCCUCUGAUUGCAGCAUGUUGACACCAACCUCACGUUACGAACAAUUCACAGAGAAUUUGCCUUUGUGGCAACUGAAGAUGGAAGUCUGGGGGGCACAGACAACCUUAUCAAACAAUAUAAAAGCCAAUAUAAAUUCUCAUAAGCACUAUAGAAUUUGCAAAUUCAGAACAUUUUAUACCUAAAAGUAAUUCUGUCUUUCCUAAAGUGUUUUUAACAUGAAAAUUAGUAGGAAGAUGUGGUUACUAUUUGGAAAGUGUAAUGUAACAAAACUCUCUUUUGUUACCACAAAUUUUGUGAGUUUAGUACUCUACAGAUUGCCCCAUAAGAGCAGUAGCUUUUGAAACUCAUAAUUCUCUGAAAUAAAUGAAAGACAUUUAAUUCAAGGAUCAAAAAUUGUGGCCAUCUUUGCAAAUGACUACCUAUAGCCUGUGAAAAUACAUUUCAAAAAAUGUUAUGUGCAAUGAACACUAAAUUUAAGAGCAGUUACAGUGUGACUCACUCAUGUUUAAAAAAAAUCGAAGAGCUAAAAAAUACGUCUAAUUUAUGUAACCCAUUGGAAUGUAUUUCUAGGUUCUCUUCAGGAUUAAUUAAAUAAACAUGCAAUUUAUGAAAACAUAUAAACAAUUAUUUAUCACUUUUAUGACCCAAAUCACAAUAAAAUUGUCAUUUAGGAUAAACUGGGGAGAAUAGACUGAACAUAUGGUUAUAUUCACAGUUAUUUAUUAACUUAAAUGUUAUUCCAACAUUAGAGCUAAUGUUAAAAAGAUUUAAACUGUAACGUCUAAUAUUUGGAAUAAUAUAUUAAAGUAUUAGCACUGUGGUUGAUUUUCUUGAAUUAUGUUGCAUCUUGUACUACUAAGCUUGUGAAAAUAAACAUUUGGAUGUUUUAAAAGGUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1301.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1406.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 1311.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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