Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001318788.2
Sequence Length
675 nt
GC Content
0.5422
CUCUUCCGGUCGCGGGACACCGGGUGUAGAGGGCGGUCGCGGCGGGCAGUGGCGGCAGAAUGUUGGCUACCAGGGUAUUUAGCCUAGUUGGCAAGCGAGCAAUUUCCACCUCUGUGUGUGUACGAGCUCAUGAAAGUGUUGUGAAGAGCGAAGACUUUUCGCUCCCAGCUUAUAUGGAUCGGCGUGACCACCCCUUGCCGGAGGUGGCCCAUGUCAAGCACCUGUCUGCCAGCCAGAAGGCAUUGAAGGAGAAGGAGAAGGCCUCCUGGAGCAGCCUCUCCAUGGAUGAGAAAGUCGAGUUGUAUCGCAUUAAGUUCAAGGAGAGCUUUGCUGAGAUGAACAGGGGCUCGAACGAGUGGAAGACGGUUGUGGGCGGUGCCAUGUUCUUCAUCGGUUUCACCGCGCUCGUUAUCAUGUGGCAGAAGCACUAUGCUUUGACAAAGAGUGGGUGGCCAAGCAGACCAAGAGGAUGCUGGACAUGAAGGUGAACCCCAUCCAGGGCUUAGCCUCCAAGUGGGACUACGAAAAGAACGAGUGGAAGAAGUGAGAGAUGCUGGCCUGCGCCUGCACCUGCGCCUGGCUCUGUCACCGCCAUGCAACUCCAUGCCUAUUUACUGGAAACCUGUUAUGCCAAACAGUUGUACCACUGCUAAUAAAUGACCAGUUUACCUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-234.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -245.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.(((.((((((((((((((((((.(((.((((((((((.((((.((.((.(((.((((.(((.(((((((.....))))...)))..))).)))).))))).)).)))).)))...(((..(((((.((((...((((((((......)))))))).....)))).))))).))).))))))).)))(((((.((((((((((((((((.(((((((((((((..(((....)))...........(((((.....)))))..(((((.((((((.(((((...((.(.(((......)))).))..))))).))))))..)))))((((.(((((((.((((..((((.((.....)).))))..).))).)).))))).)).))(((..((((.(((((....(((...((((.........)))).)))....))))))))))))..))))))....))).)))).)))))...((((.....))))..)))))..))))))..))))).((((...........)))).............(((.(((....))).))).))))))))))...)))).))))((((......))))((........))((((..(((((......((((......)))).......)))))..))))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((((,((((((....)))((({.((.(((.((((((({((.((((.((.((.(((.((((.(((.(((((((.....))))...)))..))).)))).))))).)).)))).))}...(((.,{((((.{{{{.,|{|{,.(((((((,...})))))))|||))}}.))))).))).))))))).)))))})))((((((((((((((((.(((((((((((((..{((,,.,|||..,........,{{,{...,,))})),,(((((.((((((.(((((...{..(.(((......)))}.))..))))).)))))),.,))))((((.(((((((.((((,.((((.((.....)).))))...,))).)).))))).)).))(((..((((.(((((.,,.{((...({({...,,....)))).))).,..))))))))))))..))))))....))).)))).))))),..((((.....)}})..)))))..))))))..|||,..,|,|........))),)))}}}}.((({.(({.(((((,..((({..,,....)))))))))})).)))).|}{{{(,.....))))}.......,,{|{{({.,(((((......((({......)))).......)))))..)))}.)).,...
Back