Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001320155.3
Sequence Length
3126 nt
GC Content
0.5537
AGAAGCCGAAGGGGAGUCGGCGGCACAAAAUGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCUGGUGCUGCAGGGUCGGCAGCUCCCGCGGCAGCGGCCGGCGCCCCGGGAUCUGGGGGCGCACCCUCAGGGUCGCAGGGGGUGCUGAUCGGGGACAGGCUGUACUCCGGGGUGCUCAUCACCUUGGAGAACUGCCUCCUGCCUGACGACAAGCUCCGUUUCACGCCGUCCAUGUCGAGCGGCCUCGACACCGACACAGAGACCGACCUCCGCGUGGUGGGCUGCGAGCUCAUCCAGGCGGCCGGUAUCCUGCUCCGCCUGCCGCAGGUGGCCAUGGCUACCGGGCAGGUGUUGUUCCAGCGGUUCUUUUAUACCAAGUCCUUCGUGAAGCACUCCAUGGAGCAUGUGUCAAUGGCCUGUGUCCACCUGGCUUCCAAGAUAGAAGAGGCCCCAAGACGCAUACGGGACGUCAUCAAUGUGUUUCACCGCCUUCGACAGCUGAGAGACAAAAAGAAGCCCGUGCCUCUACUACUGGAUCAAGAUUAUGUUAAUUUAAAGAACCAAAUUAUAAAGGCGGAAAGACGAGUUCUCAAAGAGUUGGGUUUCUGCGUCCAUGUGAAGCAUCCUCAUAAGAUAAUCGUUAUGUACCUUCAGGUGUUAGAGUGUGAGCGUAACCAACACCUGGUCCAGACCUCAUGGGUAGCCUCUGAGGGAAUUACAUGAACGACAGCCUUCGCACCGACGUCUUCGUGCGGUUCCAGCCAGAGAGCAUCGCCUGUGCCUGCAUUUAUCUUGCUGCCCGGACGCUGGAGAUCCCUUUGCCCAAUCGUCCCCAUUGGUUUCUUUUGUUUGGAGCAACUGAAGAAGAAAUUCAGGAAAUCUGCUUAAAGAUCUUGCAGCUUUAUGCUCGGAAAAAGGUUGAUCUCACACACCUGGAGGGUGAAGUGGAAAAAAGAAAGCACGCUAUCGAAGAGGCAAAGGCCCAAGCCCGGGGCCUGUUGCCUGGGGGCACACAGGUGCUGGAUGGUACCUCGGGGUUCUCUCCUGCCCCCAAGCUGGUGGAAUCCCCCAAAGAAGGUAAAGGGAGCAAGCCUUCCCCACUGUCUGUGAAGAACACCAAGAGGAGGCUGGAGGGCGCCAAGAAAGCCAAGGCGGACAGCCCCGUGAACGGCUUGCCAAAGGGGCGAGAGAGUCGGAGUCGGAGCCGGAGCCGUGAGCAGAGCUACUCGAGGUCCCCAUCCCGAUCAGCGUCUCCUAAGAGGAGGAAAAGUGACAGCGGCUCCACAUCUGGUGGGUCCAAGUCGCAGAGCCGCUCCCGGAGCAGGAGUGACUCCCCACCGAGACAGGCCCCCCGCAGCGCUCCCUACAAAGGCUCUGAGAUUCGGGGCUCCCGGAAGUCCAAGGACUGCAAGUACCCCCAGAAGCCACACAAGUCUCGGAGCCGGAGUUCUUCCCGUUCUCGAAGCAGGUCACGGGAGCGGGCGGAUAAUCCGGGAAAAUACAAGAAGAAAAGUCAUUACUACAGAGAUCAGCGACGAGAGCGCUCGAGGUCGUAUGAACGCACAGGCCGUCGCUAUGAGCGGGACCACCCUGGGCACAGCAGGCAUCGGAGGUGAGGCGGGGUUGCAGUGACUGGUGGCCGCAAGCCCUUCCCUGGGGAGUACCUGAUGGCUGCCCUUUGACCCCCGGUGGCUGCCCUUUGACCCCCGGGUGUGCUCUCAGCGCAAGUGGUCCUAGAACAGGAUUCUUUUUGGAAAUGUCUGUCGACUGGACCUUGGUGGAUUUGGAAAUGGAACUGAGGGACCGGUGACACGUGCUUCAGACCGGUCUGGGGUGCGGCGCACACCUGGGCCCGUGCAGGGCUCAGCUCGGCAGCAGCUCUGAGGGCAGCUCAAUGAAAAAGUGAAUGCACACGCCCUUGUUGGCGUGGCCUGGCAUGGCCUGGUGCUAUCGGCAGCCGCUCUCCACUCCCCGACUGAUACUCAAUUACGUGAAGCCAAGAAAGAUGAUUUUUAGAACCUUUGCCUAUAUUAGGUUGUACUUAUGUACAUAUUUUGCAGUGUUUCACAGGAGAAAGUGGCCUUAACUGCCCCUUAUUCUCUCUCCACGUUGUAAAUAAACAUGUGUUUAAUACAAGUUAAAGCUAUGUAUGAAAACUCAGAACUUGAAUCCCGUCAGCUUAAAACUUGUGUAGGGAAUCCUGACUUUUAAAAUGUGAGGGUAUUUGGAUCUGUGUUGAAAGUCGUAUAUUUUUAUCUGUGCGGUGCUGAGUGCAGGCCACCAGCUCCUAAAUAGAGGUUCCCUAUAUGCGCGUAUGACAUGGUGAAUAAACACAACUCUCUCCACUCAGGACAUCCGGAGCGUUAUGGACGUGGUAGGUGGUCGUUCUGUGUGCUUGUGAAAGUGUCCAGGCGUGUGCACAGCCAGUGCGCCCACUUCCGGGCUCCUUGCUCCCUGCUGUACUGAAGUUUUGGAUUUUGCAUCCAAUCCUGUGUGCCUGCCCUUCUGCCGAAGGCUUGUGAGGGGCCUGAGUCCUCUGCCCAUCAGGAUGACAGGCUCCUUCCUGCAGGGCCAUAGGAGGGAAGUUUUGGAAACACAGAAUGAUUCCAAGGUGCUCUCGUUCCUGAGGGGGACUGGUUUGUAACCCAUGACAUCUGUGGGCGAGAGAGGCAGCUGGGAGCAGGACACUUGGAGGGUCACCCCACGGGGGUGGCACCUGCACUCUGAGUGCCCCCCACUGUCAUCAGCUGCCUCUUACCGUGGACACAGUUUUGGUUUUGGGGACUAGGGGGCCCCACUCCUGGUGGUACCGUUUGGACUUACUAGGGCAGUGGGACAUAUAGGCCGGGGCUAGUGGGAUAACGGGGAGUUACGCCUGAUGACUUUUUUGAUGGAAUCCUGCAUUAGAUAGCUGGUGGGACCCCCCCUCAGAAUUGGGGAACUGAGGAGACUCCAGGGAGGGUGUCCUUCCAGGGAGAGCAGCUAUGAGGGGCCCCCUAGCUUCCUGUGCCUGGAAGUAAGAGAACCAGUAAAGGGCCAUACACACCUGUACCCAAGAGACCGCUCUCCAUUUGCUUUCUUUUUUUACUAAAUAAUUGUAAAAUAUUAUUAUGACAUAAAGAACCAUUUAAGGCCA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1212.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1266.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 800.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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