Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001323369.2
Sequence Length
1032 nt
GC Content
0.6221
CAAAGCUGGCUCUGCAGGGGACAUGAGAGGCACACCGAAGACCCACCUCCUGGCCUUCUCCCUCCUCUGCCUCCUCUCAAAGGUGCGUACCCAGCUGUGCCCGACACCAUGUACCUGCCCCUGGCCACCUCCCCGAUGCCCGCUGGGAGUACCCCUGGUGCUGGAUGGCUGUGGCUGCUGCCGGGUAUGUGCACGGCGGCUGGGGGAGCCCUGCGACCAACUCCACGUCUGCGACGCCAGCCAGGGCCUGGUCUGCCAGCCCGGGGCAGGACCCGGUGGCCGGGGGGCCCUGUGCCUCUGUAAGCAGGACCCCAGUUUUCUGGCCUUGUCUCUUCCCUGCCCCCUGGUGUCCCCUGCCCAGAAUGGAGCACGGCCUGGGGACCCUGCUCGACCACCUGUGGGCUGGGCAUGGCCACCCGGGUGUCCAACCAGAACCGCUUCUGCCGACUGGAGACCCAGCGCCGCCUGUGCCUGUCCAGGCCCUGCCCACCCUCCAGGGGUCGCAGUCCACAAAACAGUGCCUUCUAGAGCCGGGCUGGGAAUGGGGACACGGUGUCCACCAUCCCCAGCUGGUGGCCCUGUGCCUGGGCCCUGGGCUGAUGGAAGAUGGUCCGUGCCCAGGCCCUUGGCUGCAGGCAACACUUUAGCUUGGGUCCACCAUGCAGAACACCAAUAUUAACACGCUGCCUGGUCUGUCUGGAUCCCGAGGUAUGGCAGAGGUGCAAGACCUAGUCCCCUUUCCUCUAACUCACUGCCUAGGAGGCUGGCCAAGGUGUCCAGGGUCCUCUAGCCCACUCCCUGCCUACACACACAGCCUAUAUCAAACAUGCACACGGGCGAGCUUUCUCUCCGACUUCCCCUGGGCAAGAGAUGGGACAAGCAGUCCCUUAAUAUUGAGGCUGCAGCAGGUGCUGGGCUGGACUGGCCAUUUUUCUGGGGGUAGGAUGAAGAGAAGGCACACAGAGAUUCUGGAUCUCCUGCUGCCUUUUCUGGAGUUUGUAAAAUUGUUCCUGAAUACAAGCCUAUGCGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-452.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -466.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((.((((.....(((((((..(((((((((..((((.((........)).))))......................((((((((.....(.(((.....))).))))))))).(((((((((((((((....((((((((((.((.(((...(((.((((.((((.((.((.(((((((.((....)).))))))).(((....)))...(((.........))).)).)))))).)))).))).))))).)))))...))))))))...))))))))))))....)))))))))...(((((((..((((.((((((((((..((((((((((((((((.((.((((((((((((...))).)))......))))))))....(((((.((((.(((.((((((.((((....((((.((((..(((((....))))).....)))).)))).((((.....)))).......)))).)))))))))..)))))))))(((((((.....((((((((.((..((((.(((((((.(((((((((...))))).)))).)))))))((((..((((((((.(((((.(((((..(((((......)))))))))))))))..))).)))))...)))).((.(((((((((((((.((((..................)))).))))......))).)))))).))....(((((.....(((...)))......)))))..(((..((((((((((((((......((((.(((((..............)))))...))))...))))))................((((.(((....)))))))......)))))))).)))..(((((.....)))))..........))))..)).))))))))...)))))))...........)))))))))..)))))))))))...))))))..))))...))))))).((......))............))))))).......))))...))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,..((.((((..((((((((...(((((((.((..({{(......,},.)))))}})))..)))))))){{{{....,,((((({(({{...,..||},...|}|.,,.||||..{(((((((((((({{{....((((((((((.((.(((...(((.((((.((((.((.((.(((((((.({....}).))))))).((({...})).,.{{{.........}}}.)).)))))).)))).))).))))).)))))...)))))))}...))))))))))))}}...)))),..}}}.(((((((..((((.((((((((((..((((((((((((((((.((.((((((,((({,....}}.}},.}}}..))))))))....(((((.((((.(((.((((((.((((....((((.((((..(((({....})))).....)))).)))).((((.....)))).......)))).)))))))))..)))))))))(((((((.....((((((((.((..,(((.(((((((.(((((((({...})))).)))).)))))))((((..((((((((.((({(((((((..(((((......)))))))))))))))..))).)))))...)))}.{(.(((((((((((((.((((..................)))).)))}.....}))).)))))).)}.||,,,((({....,||}}.|||,|....}}|||..,,,..((((((((((((((......((((.(((((..............)))))...))))...))))))................((((.(((....)))))))......)))))))).))),.|||||..,,,))}}}.,......},))))}.)).))))))))...))))))),,.........)))))))))..)))))))))))...))))))..))))...)))))))}}}},}...))}|..,.......,||,,,.....}}}))))...)).,,.
Back