Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001326.3

Sequence Length

2812 nt

GC Content

0.4058

AAUUCAUAUUUGAGUGGGCGGUGGCGAUUGGUGUUGGCGGUCUGGCUCAGCUGGGCAGGGGGUAACUUUACUGAUUUGGGGGUGGUUUUUAGUUUAAUUUUUCUUUUCUAGCUUCCCAUCGACGGUCAGUGCGCACGUUGUAAUCAGCUGAGGCCAUGUCAGGAGACGGAGCCACGGAGCAGGCAGCUGAGUAUGUCCCAGAGAAGGUGAAGAAAGCGGAAAAGAAAUUAGAAGAGAAUCCAUAUGACCUUGAUGCUUGGAGCAUUCUCAUUCGAGAGGCACAGAAUCAACCUAUAGACAAAGCACGGAAGACUUAUGAACGCCUUGUUGCCCAGUUCCCCAGUUCUGGCAGAUUCUGGAAACUGUACAUUGAAGCAGAGAUUAAAGCUAAAAAUUAUGACAAGGUUGAAAAGCUAUUUCAGAGAUGCCUUAUGAAGGUUUUGCACAUUGAUUUAUGGAAGUGUUAUCUUUCAUAUGUCCGAGAAACCAAGGGUAAACUACCAAGUUACAAAGAAAAAAUGGCUCAAGCAUAUGACUUUGCACUGGAUAAAAUUGGAAUGGAAAUUAUGUCCUAUCAGAUUUGGGUGGAUUACAUCAAUUUCCUAAAAGGCGUGGAAGCUGUAGGAUCUUAUGCAGAAAAUCAAAGAAUAACAGCUGUCCGAAGAGUUUAUCAACGAGGUUGUGUUAAUCCGAUGAUCAACAUUGAACAGCUCUGGAGAGACUAUAACAAGUAUGAAGAGGGUAUCAAUAUUCAUUUAGCUAAAAAAAUGAUUGAAGAUCGGAGUAGAGAUUAUAUGAAUGCUAGACGUGUAGCAAAGGAAUAUGAGACAGUAAUGAAAGGCUUGGACCGUAAUGCUCCCUCGGUGCCUCCUCAGAAUACUCCUCAAGAAGCUCAACAAGUAGAUAUGUGGAAGAAAUAUAUACAGUGGGAAAAGAGCAACCCUCUUCGUACAGAGGAUCAGACCCUUAUAACAAAAAGAGUUAUGUUUGCUUAUGAACAGUGCCUGCUUGUGCUGGGCCAUCACCCUGAUAUUUGGUAUGAAGCUGCCCAGUAUCUUGAGCAGUCAAGUAAACUGCUCGCAGAAAAGGGAGAUAUGAAUAAUGCCAAAUUAUUUAGUGAUGAAGCUGCUAAUAUAUAUGAAAGAGCCAUAAGCACUUUAUUGAAGAAGAAUAUGCUUCUUUAUUUUGCAUAUGCAGAUUAUGAAGAGAGUCGCAUGAAGUAUGAAAAGGUUCACAGUAUAUAUAACAGACUUCUGGCAAUUGAGGAUAUUGACCCUACCUUGGUAUAUAUCCAAUAUAUGAAAUUUGCACGGAGAGCAGAAGGCAUCAAAUCUGGAAGAAUGAUAUUUAAAAAAGCAAGAGAAGAUACCAGAACCCGCCACCAUGUCUAUGUUACUGCAGCACUCAUGGAAUAUUACUGUAGUAAGGACAAAUCUGUUGCCUUUAAGAUUUUUGAGCUGGGGCUAAAAAAAUAUGGAGACAUUCCAGAGUAUGUCCUGGCCUAUAUUGACUAUCUUUCUCACCUCAAUGAGGACAAUAAUACCCGAGUUUUGUUUGAACGAGUUUUAACAUCUGGAAGCCUUCCUCCUGAGAAGUCUGGAGAAAUCUGGGCCCGAUUUCUAGCAUUUGAAAGUAAUAUUGGUGAUCUAGCUAGUAUACUCAAAGUGGAGAAAAGACGGUUUACAGCAUUCAAAGAAGAGUAUGAAGGGAAAGAAACGGCUUUACUAGUAGAUAGAUACAAGUUCAUGGAUUUAUAUCCUUGCUCUGCAAGUGAAUUAAAAGCACUUGGUUAUAAGGAUGUCUCCCGUGCUAAGCUAGCAGCUAUAAUUCCGGACCCAGUUGUAGCUCCUUCUAUAGUGCCUGUUCUGAAAGAUGAAGUGGAUAGAAAACCAGAAUACCCUAAACCAGACACUCAGCAGAUGAUUCCAUUUCAGCCACGACAUUUAGCACCUCCAGGUUUACACCCUGUACCUGGUGGAGUGUUCCCAGUCCCUCCUGCAGCUGUUGUUUUAAUGAAACUUCUCCCUCCUCCUAUCUGUUUCCAGGGUCCUUUUGUACAAGUGGAUGAACUGAUGGAAAUUUUCCGAAGAUGCAAGAUACCAAAUACUGUUGAGGAAGCUGUGAGGAUCAUUACUGGUGGGGCCCCAGAGCUAGCUGUAGAAGGCAACGGCCCCGUGGAAAGUAAUGCAGUACUCACCAAGGCCGUCAAAAGGCCCAACGAGGAUUCAGAUGAAGAUGAAGAAAAGGGAGCCGUUGUCCCCCCUGUUCAUGACAUUUACAGAGCACGGCAGCAGAAGCGGAUUCGGUAGGGUUUUAAACGCCUCUGCAGAAAACUCCUGUCCAGGAUUCCUUUUGCCUCAAGUGGUAUGUUUAAAAGAGACAACGCUUUGUUACAAGGUUCUUGGAAACAAAGUUGUAUUGUCAUUGGUGCCUCUAUCACAUGGUUCUUGAGAAAAAACAAACCAACCUGUGUGAAUUUUAGAAUACGGAACAGACCUAUGCUCUAAGCAAAAUUAGGUUUUCAAAAAUGUGAGAACAGUACAAAGUGGCAGAACCACAUUUUGUUCCCUCUUCAAGGGUGUCUUGUAUGUGCCGCUUGAAGAUUUGUGAGUUUUUCAACAGUUUUAUUUUAAAAACUGGAUGGCUUAUGAUUGUAAAGCAUUUUAUCACAUUUUCUGAAAACAAUUGUUCUUGGUUUGCUUAUGUAGAGUCCUGCCUUAUUGUUUGUUUUUAUUUAUGGCAGAAUGUAUGAAAUCCGUUUUGUAGUUUCAAAUUUUAAAAGUCCUUUAAAAAAUAAAAGGAUUCAGAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-744.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -796.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 810.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((((((.((.(.((.((((....)))).)).))).))))))..(((((((.((((....))))...((((((((((.((((..(((((((..((((((((..((((((.((...((...((((.((.(((((......(((.(((..((((....))))..))).))).....))))))).))))...))...)).)).)))).....)))))))))))))))..)))).))))....))))))(((((((((((((((..((((((((((((.........(((((((...(((((((.((((((((((((........((((((..(((((((((((((.(.((((((...((((........)))).......((((...((((.......))))....)))).(((((((((((((((.....((((((.......(((.((((((((......)))))))).)))...))))))..(((((...(((((((.............((((((((.(((((.(.(...((((((..............(((((((((((.(((((.......)))))...)))).)))))))......((......))(((((..((((...((((................(((((.(((...(((.((((.((.(((((...))))))).)))).))).))).)))))))))))))..)))))....(((((((((((((.((((...((((((........)))))))))).((((........)))).......(((((......)))))........((((..((((.(((.((((....((((...........))))))))..)))...)))).))))....((((..((.....((((((.......))))))....))......)))).))))))))))))).((((.......))))(((((.......))))).............))))))..)).)))))))))))))......((((((.((((......)))).)))))).((((((((.......))))))))......((((.(((((...((((((((.(((((...)))))(((((((...((((((((....(((((....(((......((((((((......))))))))...))).(((((.((((........)))))))))...........)))))...))))))))..))).)))))))).))))...)))))..))))..)))))))..)))))............((((.......))))))))))))...)))))))..............................)))))).).))))...(((((...(((((((((................))))))))))))))(((((..........)))))...)))))))))............((((.(.(((((((((.((((((......((((((..............))))))))))))........(..((((.....))))..).....)).)))))))).))))((((.((....)).))))....))))))(((.(((((..(((((...((((.(((((((......)))))))))))..))))).)))))...)))....((..((((......)))).))..((..(((......)))..)).(((......)))..))))))))......(((((((.....((((((.........))))))....))))))))))).))))))).....((.((((((((((........)))))))))).)))))))))(((((((((((..(((((..((((((((............((((..(((((..........((((((.((.((.((((...(((....(((((((((((((..(((...))))))))).)).)))))....)))((((..((((.((((.......((...((((.........(((((.(((((((..((.(....).))...))))..))).))))).........))))...))........)))))))).))))..)))).)))))))))).)))))))))...(((......))).....((((((((((((.(((..((((......))))..))).((((.......)))).........((((........)))).....))).)))))))))....))))))))..))))).))))))).))))(((((((.(((((((((((((((((....((....))..))))).)))).)).)))))))))))))......................((((((((((((((.((((...))))..))))))).)))..))))....)))))))).((((((((((.(((........)))...)))).))))))...........))))..)))...)))))))))))).......((((((((((((((((((((((......((((.....))))...))))))..((((((((((((.(......))))).)))))))).(((((((((......(((((((......)))))))...)))))))))...............))))))))).)))))))..........(.(((((....))))).)))))))).....((((((.........))))))..)))))))............(((((..........((((((((........))))))))..))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{{({,,,.((((({{((({(({(({{..,,|}||{||{|||{||||||{{(((((((((({..,,,{,{{,.,{{(({{((((.((((..((((((,,{((((((((.{((((((.((...((.,.{(((.((.(((((......(((.(((..((((....))))..))).))).....))))))).)))),.})}...)).)).))}}..,},)))))))))))))))..)))).))))....}}||{{({((((,{((,(((({.,,,|||||||,|}}.,}},,.{{{{{{,...{(({{{{.{{{{,,,,,,,,,||||,|}||||||},{{(((((((((({.|.{((({{...((((........)))).......,{({...,,{,.......||||....)))).(((((((((((((({.,,..{{(({(,{,,,,.(({.((((((((......)))))))).})}.,.,,,|||{{(((({,{((,,,.|}}},}.........(((((((,,(((((.(.,...((((((..............(((((((((((|(,{((.....,,)}}))...}))).))))))).....,((..,,.,||{(({{..((((...{{{,........,......|(((((.({{...(((.((((.((.(((((...})))))).)))).))).))).)))))))))))}),.)))}}....(((((((((((((.(({{...((((((........))))))}))}.{{|,{{{{{{,,|,||,,,,...(((((......))))).....,,,||{{..({{{.{{,.{(({....((((...........))))}))).})),...))))})}},....((((..{...,..((((((.......))))))....},......)))).))))))))))))).((((.......)))}{{(((.......))))),,}},,}}.,,..))))))..,).)))))))))))))....,,((((((.((((......)))).)))))).{(((((((.......)))))))}......((((.(((((...{(((((((.{{{{{...}}}}}(((((((.{.((((((((....(((((....,.((((({{((({({{{......))||||||,{{(((....})}||,,,|,,,,,.,}))}}))))})).......)))))...)))))))),.))).))))))))},}}}...)))))..)))).})))))){,{||}}..}}}}}},,,,,,|||,.,....})),))))))))...))))))).........,,............,......)))))}.),)))).,,|{{{{..,|||||||{{,,,,,,..........||||||}||||}}|{{(((..,..,,,,.}}}}||..|||||||||,,.........{(({(.{,{{{||{{,,,||||||}|,,,.|||{{{...,,,{{{{{..,||,.,))))}}|,,,,..,....||{||||,,|{||..|,||{,,,.,||||||{{||||{(((,{{...,||,|||}...,}}))))(((.(((((..(((((,..{((,,(((((((......))))))))))),,))))).)))))...)))....||,,,{||......}}}}.}},,))}},|}}...}})}}},||,|{{,.,,,,}}}.,))}}}||{{,..,,{||{{{{,,,,,((((((.........))))))....)))))))))}).)}))|||....,||,((((((((((........)))))))))).}}}))}))){((((((((((..{((((..((((((((...,,||,....,{{{..,,{{{...{{{{,{{(((({{{((,{{,(({(...(((....(((((({((((((..((,...})})))))).)).)))))....)))((((..((((.{{{{{,,,,..,{,,,{{{{.......,,{,{{(.(({{{{|.,((.{....}.},..,}))},}))}.)))))}.....,..)}})...}),,}.,.,.},,,)))).))))..)))).})))})}))}.)))))}|||,..||{..,...))),,}..((((((((((((.(((..((((......))))..))).((((.......)))).........((((........)))}.....))).))))))))),,}}))))))))..))))}.))))))).)))}(((((((.(((((((((((((((((....((....))..))))).)))).)).))))))))))))){{{,{{.{,{{{{{......,,((((({((((((((.((((...))))..)))))))},)}.,)))).,,,}}}}}}}).{{|||||{|{,|||,,......}}}.,.}}}},})))))........,,,}))}..}||{,,|||||}|||}}},,,,|||((((((((((((((((((((((...{{,((((.....)))).}}))))))..((((((((((({.(......)}))).)))))))).{((((((({..{{..(((((((......)))))))}}.))))))))}.,{{...,},.....))))))))).))))))).......,,,}}}}}}}},,.))))))))|||||,....,,,,,,,..,....,.}||||{,,|,}|,,,.,.}}}}}}}}.|||||..........((((((((........))))))))..)))},.