Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001329050.2
Sequence Length
937 nt
GC Content
0.6083
AGUUACACGUUUUCCUCCAAGGAGCCUCGGACGUUGUCACGGGUUUGGGGUCGGGGACAGAGCGGUGACCAUGGCCAGGCUGGCGUUGUCUCCUGUGCCCAGCCACUGGAUGGUGGCGUUGCUGCUGCUGCUCUCAGCAGCUGAGCCAGUACCAGCAGCCAGAUCGGAGGACCGGUACCGGAAUCCCAAAGGAUUCAGCACCUUGGCACAGCUGAAGCAGAGGAACACGCUGAAGGAUGGUAUCAUCAUGAUCCAGACGCUGCUGAUCAUCCUCUUCAUCAUCGUGCCUAUCUUCCUGCUGCUGGACAAGGAUGACAGCAAGGCUGGCAUGGAGGAAGAUCACACCUACGAGGGCCUGGACAUUGACCAGACAGCCACCUAUGAGGACAUAGUGACGCUGCGGACAGGGGAAGUGAAGUGGUCUGUAGGUGAGCACCCAGGCCAGGAGUGAGAGCCAGGUCGCCCCAUGACCUGGGUGCAGGCUCCCUGGCCUCAGUGACUGCUUCGGAGCUGCCUGGCUCAUGGCCCAACCCCUUUCCUGGACCCCCCAGCUGGCCUCUGAAGCUGGCCCACCAGAGCUGCCAUUUGUCUCCAGCCCCUGGUCCCCAGCUCUUGCCAAAGGGCCUGGAGUAGAAGGACAACAGGGCAGCAACUUGGAGGGAGUUCUCUGGGGAUGGACGGGACCCAGCCUUCUGGGGGUGCUAUGAGGUGAUCCGUCCCCACACAUGGGAUGGGGGAGGCAGAGACUGGUCCAGAGCCCGCAAAUGGACUCGGAGCCGAGGGCCUCCCAGCAGAGCUUGGGAAGGGCCAUGGACCCAACUGGGCCCCAGAAGAGCCACAGGAACAUCAUUCCUCUCCCGCAACCACUCCCACCCCAGGGAGGCCCUGGCCUCCAGUGCCUUCCCCCGUGGAAUAAACGGUGUGUCCUGAGAAACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-399.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -416.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((((((((((((.(((((...))).)))))))((((((.((((.((.(.(((..((((((((((((.(((........(((((((..((((((....))))))(((((((.(((((..(((((...))))).))))).)))))))...(((((....)))))....((((((....))))))........)))))))((((((((((((..((((.(((((((((((((((...)))).(((......))))))))))).....))).)))))))((((((((.(((((((....(........)....)))))).).))))))))..(((((((..(((((....((((..((...(((((((.((((....)))))))..)))).......))..))))....))))))))))))..(((..(((((((((((..((.((((((((.....)))))))).).)..))).))))))))..))).))))))))).)))))))))).)))))....)))))).)))).))))))((((((.........)))))).........((((((..((((((...((.((.(((((...((....))....))))).)).))....))))))...))))))..)))))))))))(((((.((((((((((((.((((..((....)))))).)).......).)))))))))((((((.(.(((((((((((....((((((((.(((.((......)).))))))(((.(((((((((((((...)))(((((.(((((..(.......)..))))).....(((....(((((.....))))))))..........))))).....)))))))))))))..)))))))).))))))))........).))))))...)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,,,..{(((((((((((((((.(((((...))).)))))))((((((.((((.{(,(.(((,.((((((((((((.(((........(((((((..((((((....))))))(((((((.(((((,,(((((...))))).))))).)))))))...(((((....))))).,..((((((....))))))........)))))))(((((((((,{{..{{{({{{,,({{(((.{(({...}})}}||,.}...})|||||,||||{,...,,,.||||||,,((({(((,((((({,.,..,...,.}}}),,}},}))))})})))),)))},(((((((..{((((....((((..((...(((({{{{((((....)))))})..)))).......))..))))....))))))))))))..(((..(((((((((((..,(.((((((({.....}))))))).).,..)))}}}))))))..))).))))))))).)))))))))).)))))....))),)),)))).))))))((((((.........)))))).........((((((..((((((,{,((,({,((({{...((....))....))))),)).)}....))))))...))))))..))))))))))|{(((({((((((((((((.((((.,((,,.,}|}}}}.}}....,,},.)))))))))|,,{,{||,|{((((((((({....{{(((((,({(.((.....})).)))||}(((,{((((((((((((...))}{||||.|{{||.,{|.,,,..}.}))))).....|,|}...(((((.....)))))})),,,.......))))}.,,,.)))))))}))))}..))))))))))))))|||.......,),)))))}...}}}},....
Back