Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001330508.2
Sequence Length
3496 nt
GC Content
0.5498
AGCGUCGCCUAGCAACGGGAAAUGGCGGAACCGGGCGGCGCGGCGGGCCGGUCCCAUCCGGAAGAUGGAUCGGCUUCUGAGGGAGAGAAGGAAGGGAAUAAUGAAAGCCACAUGGUGUCACCACCAGAGAAGGAUGAUGGCCAGAAAGGUGAAGAAGCUGUCGGUAGCACAGAGCAUCCUGAGGAAGUCACAACCCAAGCGGAAGCUGCAAUUGAAGAGGGGGAGGUGGAGACAGAAGGGGAAGCAGCAGUGGAAGGGGAAGAGGAGGCUGUGUCCUAUGGAGAUGCUGAAAGCGAAGAGGAAUAUUACUAUACAGAAACUUCAUCCCCGGAAGGGCAAAUCAGUGCUGCAGAUACGACUUACCCGUAUUUCAGUCCUCCUCAGGAACUGCCUGGAGAGGAGGCAUACGAUAGUGUUAGCGGGGAGGCUGGUCUCCAAGGCUUCCAGCAAGAGGCCACCGGUCCACCAGAAUCCAGAGAAAGGAGGGUCACCUCCCCAGAGCCAUCCCACGGAGUCUUAGGCCCGUCGGAGCAAAUGGGCCAGGUCACCUCUGGGCCAGCAGUGGGCAGAUUGACAGGAUCCACAGAGGAGCCCCAGGGGCAGGUGCUCCCAAUGGGCGUCCAGCACCGCUUCCGGCUGAGCCACGGGAGCGACAUCGAGUCCUCAGACCUGGAGGAGUUCGUCUCGCAGGAGCCAGUGAUCCCCCCAGGGGUGCCCGAUGCCCACCCCAGGGAAGGAGACCUGCCAGUGUUCCAGGACCAGAUCCAGCAGCCCAGCACCGAGGAGGGGGCCAUGGCAGAGAGAGUGGAGUCCGAGGGGAGUGACGAGGAAGCAGAAGACGAAGGGUCCCAGCUGGUGGUUUUGGACCCAGACCACCCCCUGAUGGUAAGAUUCCAGGCUGCCCUGAAGAACUACCUGAACCGACAGAUCGAAAAGUUGAAGCUGGACCUCCAAGAGCUGGUUGUGGCUACCAAGCAGAGCCGAGCCCAGCGGCAGGAGCUGGGGGUGAAUCUCUAUGAGGUGCAGCAGCACCUGGUACACCUGCAGAAGCUGCUGGAGAAGAGUCACGACCGCCACGCAAUGGCCUCGAGCGAGCGCAGGCAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCCGCCCGCGCUCUCUACACCAAGACCUGCGCAGCCGCCAACGAGGAGCGCAAAAAGUUGGCGGCUCUGCAGACUGAGAUGGAGAACUUGGCCCUGCAUCUCUUCUACAUGCAGAACAUCGACCAGGACAUGCGUGACGACAUCCGCGUGAUGACACAAGUGGUAAAGAAGGCCGAGACGGAGAGGAUCCGGGCAGAAAUCGAGAAGAAAAAGCAGGACCUGUAUGUGGACCAGCUCACCACUCGAGCCCAGCAACUGGAAGAAGACAUUGCCCUGUUUGAGGCUCAGUACUUGGCCCAAGCUGAGGACACCCGGAUUUUAAGGAAAGCAGUGAGUGAGGCCUGCACCGAGAUCGACGCCAUCAGCGUGGAGAAGAGGCGCAUCAUGCAGCAAUGGGCCAGCAGCCUGGUGGGCAUGAAGCACCGCGACGAGGCGCACAGGGCGGUGCUGGAGGCGCUCAGCGUGUCCCUAGAGCGCUUCCCAAGUCAAAAUAUAAACACCGCUCGUUCCCGCCUUUCUACCACAUGGCAUUCCGCUGGGAUACUUCUACGGGGAAGCUUCCUGCCCGGGGCAUCGAGGGCGUUCGCGUCCGUCUGUUAUGGCGGUGCUGCUGUAGAUAACCGGAUCCGCGAAUGCUAACGCUCACCAGGAUGCUAUAUAGCCUUUUUUAUAUUGCCUAUCAAGCCCGGAAUGUCUGGGUCUAGCGGGUAUUGCUAAGUAGGAUUGUGACAGUCACGCCCCCGGCAGCGGUGUUUCAAAGUCCCCUGACAGCUCAGCAUGUUGUCACACUUCAGGACUGUGCCAAUCCGAUUGAUGAAGAAAAUAGAUAAUCUUGUUUUAUAAAACGUGCAUGCGCAGAAUGUUGAGUGAAUAUUUUAGUGGACUAUGUACACGCACAAACACUUCACAACGAGUGAGAGAGCCUCUGACUUCACCUGCAGCUUGCCACACCAAGGCCCCGGGGAGGAGUGAGGCCCAACUUUUAUUUAUUAUAUUUUUGUGGUUCUUGCAAUGGAGUCUCGCUCUGUCCCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACCAUCUCUGCUCACUGCGACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCGUGCACCACCACGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUGGGCCAGGCUGAUCUUGAACCCCUACCUCAGGUGAUCCACCCGUCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGGGAGCCACUGCGCCCGGCCAGUCUUUUAAAAGUGCAGGCCGUGUAGAACAUUGUGAGAAGUAUAAACUGUAAUUACAGAGAUUUGCUGUUUGCACCCAGAUAGAUUUGAAGAAGCAACUUGGAGACAGGUUUAAUAGAUCAGGGCCAUUAUUACAGAAAUAAAUUAUUGCAUAGCUUAGGACUUCCAAGCUAGGAGUGCAGUGACUGAACUAUACCUCAAAUAUUGACCUUGAGAUGUUCAGAUUUGUAGAGCAUCUUAGAAAAUGGUGACAUUCCUGGCUGAUGGUCAGGAUGGUGCAUACCAGGCCGGUACCCUGGUGGCUGUCUGGGCAUUUCUGGAGCCUUCACCCUGCGAGAUCCCCAUGGGGCAGGACCCCCUGGCCCAGAAGCUUGGUUUUGCCAUCACACCGAGAAGGCACACUUGUCCUGGAGUUAGUUUACAUGAAUCGAGCUCACCAGAGCCUGACGUGUAACUGAGUAUAAUAGCCCAUUUAUGUGCAUGAUGAAAUAUAAACACCAAAGAACCGAAUGCUCCACGCUCGGACUAGCAGAUUCUUAUCUGUGGGGGAGGACACAGGAGCGGAUGACACAGACCCCUGCUCAGGGACCGGCUAGAGGGCGGAAUGCCUGGGCCCCGGCCCUGUCUGCUUCCUGCUUCUUCCCCGAAGUUCAUGGCCUGUCCGUCCACAUGGGCGGGAGGUGUCCCGCGAGCAGCCCUCACCCUGACCUUGGCUGCUUUCUCCAUUCCAUUCCCCACCCCUCCUCCCUCCUGACACCCAUGGCAUUUUUUCAGAUAAGUUAAUACCUUUGAUUAGGUUCCAGCCAAACCUCACCCUUUCUCUUUCCCCAUGCCUUUGUGUCUCUCUUCGUCUGAUGUCGAGUCUACAACCUAAUGCUUUGAAGACAGACUGACUUCCCCGUCCUUGGUCAGGGGGUUGCUGCUGCGUGGGGGGGGCGGUAACCAUAAUCUUGCCCCCGUGUCUCAUACACAAGCUGCAAGCUUAGCUCAGAAGCUGUGCCUGUCUUGGCUGCUUUUUCUUGCUGUCUUCCCUAUUUUUGCAGGAGUUUUGCACACGGUCAUAAAAGUUCAGGAGAAACAUGAAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1319.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1381.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 797.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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