Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001331031.2

Sequence Length

2736 nt

GC Content

0.4616

ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGAUAACGGGAGGAAGGCCGGCCGGGGCCGCCAAGGCAGUCCCAGGCUCGCGUAGGAGGCGCGCAGACCUUGCACCUUGCACCUUCGCAGCGCCCUGCACCCCGCCACCAUGUGCGAGCUGUACAGUAAGCGGGACACUCUGGGGCUGAGGAAGAAGCACAUCGGGUAAGGGCACCCUGGCCCGGAAGUAAGUGCAGAGAGGGGGCAAUAACGAGUGCAGAAGGUGGAGAGAGAAAGCCGGCUAGGGAACAAACGAUGCGCUGCAGCCGCACUCCGUGCCCGCCGCGCCUGUGCACGCGCCCCGCGCGCCUCCACCUGCAGGGGCCGCGCGGACUCCCAGAAACGCUCCUGGAACCCGGAACGCUGGGCUUCCUGCCCGCUCGAAAGUCCCCGGCUCGCUCUGCAGCCGGCGGACUAGCGGGGGCUGCCGGCCGGCUAGAGGGGUUGGUGGAUGACGGCCAAUAGCCCUAGCAGACACCAUUCCAGGGAUGGGAGAUGGGUGGAAGAAGGAUAGCGCUCCGCCACCCCCACACAACUCGAAAGUUUUUGGAAACUGUGAACUGAGAAAUAUUUUUUCAUGAUGGCUCCGCAAACAAACCAAUUCUGACAAUUUUUACUUAAAGUGAGCUUUUUCUUCUUGCAUGCUUGGUUAAGUGAUGAAGGGUUUAUCUAGCCAAUAGAAAAACUUGAAACCACCUUCUGUUAGAAAAGCAGAGACUUUAUUUAGAUCCCUCUUACCCAACUUGCUCUCCCAAGCUGUGUUCUUCCCAGCCUGCUUGUCUUGCCCCCGUCACAAACGACUUAGUAAUAUAAAGGCCCUCAUGCAAAGUUUUCUUUGCAUCGGAUCCCAUCAAAAUAGUGAGAGCCCAGAGGCAGUACAUGUUUGAUGAGAACGGUGAACAGUACUUGGACUGCAUCAACAAUGUUGCCCAUGUGGGACACUGUCACCCAGGAGUGGUCAAAGCUGCCCUGAAACAGAUGGAACUGCUAAAUACAAAUUCUCGAUUCCUCCACGACAACAUUGUUGAGUAUGCCAAACGCCUUUCAGCAACUCUGCCGGAGAAACUCUCUGUUUGUUAUUUUACAAAUUCAGGAUCCGAAGCCAACGACUUAGCCUUACGCCUGGCUCGGCAGUUCAGAGGCCACCAGGAUGUGAUCACUCUUGACCAUGCUUACCAUGGUCACCUAUCAUCCUUAAUUGAGAUUAGCCCAUAUAAGUUUCAGAAAGGAAAAGAUGUCAAAAAAGAAUUUGUACAUGUGGCACCAACUCCAGAUACUUACAGAGGAAAAUAUAGAGAAGACCAUGCAGACUCAGCCAGUGCUUAUGCAGAUGAAGUGAAGAAAAUCAUUGAAGAUGCUCAUAACAGUGGAAGGAAGAUUGCUGCCUUUAUUGCUGAAUCCAUGCAGAGUUGUGGCGGACAAAUAAUUCCUCCAGCAGGCUACUUCCAGAAAGUGGCAGAAUAUGUACACGGUGCAGGGGGUGUGUUUAUAGCUGAUGAAGUUCAAGUGGGCUUUGGCAGAGUUGGGAAACAUUUCUGGAGCUUCCAGAUGUAUGGUGAAGACUUUGUUCCAGACAUCGUCACAAUGGGAAAACCGAUGGGCAACGGCCACCCGGUGGCAUGUGUGGUAACAACCAAAGAAAUUGCAGAAGCCUUCAGCAGCUCUGGGAUGGAAUAUUUUAAUACGUAUGGAGGAAAUCCAGUAUCUUGUGCUGUUGGUUUGGCUGUCCUGGAUAUAAUUGAAAAUGAAGACCUUCAAGGAAAUGCCAAGAGAGUAGGGAAUUAUCUCACUGAGUUACUGAAAAAACAGAAGGCUAAACACACUUUGAUAGGAGAUAUUAGGGGCAUUGGCCUUUUUAUUGGAAUUGAUUUAGUGAAGGACCAUCUGAAAAGGACCCCUGCCACAGCUGAAGCUCAGCACAUCAUCUACAAGAUGAAAGAAAAACGAGUGCUUCUCAGUGCCGAUGGACCUCAUAGAAAUGUACUUAAAAUAAAACCACCUAUGUGCUUCACUGAAGAAGAUGCAAAGUUCAUGGUGGACCAACUUGAUAGGAUUCUAACAGUUUUAGAAGAAGCUAUGGGAACCAAAACCGAAAGUGUGACCUCUGAGAAUACUCCAUGCAAAACAAAGAUGCUGAAAGAAGCCCACAUAGAACUGCUUAGGGACAGCACCACUGACUCCAAAGAAAAUCCCAGCAGAAAGAGAAAUGGAAUGUGCACGGAUACACAUUCACUGCUCAGUAAGAGGCUCAAGACAUGACUGAUUUGCAUUUUAAAGCAAGAUGCGAUGUCCAGAGUUACAGAGAAUGAGUAGAUGUGUCUCAUCGGUUAAUAGCUCUAUUAUACCUCUAAAGGUGGAAUUGUCAGUUUAGAUUCAUAAAUGAAAAGGUAAAUGAGUAAUCAGAAUAAACCAAGUGAUAAUCAAACCAUGUCAAGAUUAUUAGUUCAGACUCUAGCCUGUUAAUUUUCUUAGUUGAUUUCUGAAGCUACCUGAUUUAUUCUAUUAAAUUGUAAGCUUGCAAACUCAAAAUAAAUUGGCAGAUUUACCUCUCAUGUUUUAAUGUGUCAAAUUAGAGAGCAAAGUAUAACAGGUGCCUUCACUUUUGAGACUUAGUGCCUUAAAAUAUGUAUUCUAUAAUGAUUUCAUAUAUAAAAGUAUAUUUAUUGACUGUAAUAAAAUAAAAUAUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-825.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -877.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 672.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((..((((((.((((.((((((((((((((((((((..((.(((((...(((((.(((((((.(((((((((.((....)).))))).)))).))(((((..((((((.((...((((...))))...)))).)))))))))..(((((.....(((((.....)))))....)))))..((....((((((.(((((((.((((..((((.(((....))).))))((((((((((...((((((((........(((((((((((((((.((((((((((.((((..((..((.....))..))..))))((((...))))((((((.((((.(((((((((...)))))........)))).)))))).)))).((((((.......(((((((((((((....))))).......((((((....(((((((((((.((...)))))))).)))))))))))((((...)))).(((((.((.((((((.(....).))))))..)))))))........)))))))).))))))..((((((..((..(....)..))..))))))...............((((.((((..((((.(..(((((((...)))))))).)))).)))).))))...................(((((...)))))))))))))))(((.(((((((....)))).))))))(((((.((((.....)))).))))).....))))))))))).............))))........)))))))).....))))))).))).....)))))))))))))))))....))))).))))))).....((......))..........))))).))....)))))))).((.(((((((((((((((...((((..(((....)))..).))).))))))).(((.((((........((((..(((.((((((((((((....((((((...((((....((((.(((((....)))))))))..))))..((((.((...............)).)))))))))).)))))))))))))))..)))).)))).))).(((....)))((((((...))))))(((((......)))))....)))))))).)).................))))))...))).)))..)))).)))).))..)))((((....((((((((.....))))))))....(((........)))............((((((((((((..(((.(.((((((((......)))).)))).)((((((........((((((..(((((.....((((((..(((((((.((((.((.(((.((.(((((((..(..(((((......)))))..)..)))..)))))).))).(((((..((((((((...(((.(((........))))))...))))).)))....))))).(((((((((((((((.(...((((((.....))).)))....).))))))).))))...))))....(((((..(((((((((((((...(((.........((((((...))))))(((((((.(.......(((((((((....((((((.(((....(((.((((((.((((((((...))))).))).((((....))))......(((((.....((((((.(((.(((((.(((..(((((((((((((...((((...((((......(((((((..(.(((((((((..(((......(((((..........))))).......))).....((((((.......(((((((((((..........((((((((((.....((((((((.....))))))))...)))))))))).........))))))))))).......(((.....))).)))))).))))))))).).)))))))((((((...))))))........((.(((((....))))))).))))))))......))))).))))))))...))))))).).)))...))))))....))))).)))))))))...)))........((.((((...((((((....))))))...))))))...........)))))).)))).)))))).)))))))...)))...))))....)))))))))...)))))(((..(((((((.....))).............))))))).............(((((((........))))))).(((((((......(((((..((((........(((((((((.....)))))))))))))..)))))........))))))).)).))))))).)))).....))))))....)))))..(((((((.(((((((((((..((((....)))).((((....((((.....((((........((((((((............))))))))))))..))))..))))(((((((.....)))))))...(((((((((..((((((......)))))))).))))).)).........))))))))))).)))))))....((((((...((.....))...))))))))))))....)))))))))..))))))))))))((((......(((((...((......))...)))))......)))).(((((((....)))))))........)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((..((((((.((((.(((((({{(((({{((,{{.{,,,{({(((,..{((((,({{{((({(((((((((,((....)),|||||.||||{|,(((((,(((((((.{,..,((((...|||}.,,||,|,||}|||}}}..(((((.....(((((,...,)))))....))))).......}||||||.{||||,,{{{{,.(((((.(((....))).))))|{,{{{{{|||,,|{{{((((,{.....,(,(((((({{(((((.,{{{({,,(({((((.,((..({.....}}..))..})}}||{{,,.})}}|||||{|{{||,|||{|||||,}|)))))}}}|,...))),.)))))},)})),||,|{{,.......,||((({(((((....))))).}}}}..((((((....(((((((((((.((...)))))))).))))))))))))))},)})))))))|{({(({(((((({,.{{.,{||,,,,.})),,,,)}..}}}},,,{|{{|.{||,||{,.((((((..({.{{....}..))..)))))).{,{,....{{,,,.{{{|,|||{..,|||},..(((((({...})))))).,|,||,||}}.,,,,...................{{{{,...}))))))),},}},)}}}.|||,|||}}..,,|||,},,,|(((((.((((.....)))).)))))}....})))}}|||||,.....,},,,,.,}}}......,,)))))))}.....})))})),))),....})))))))))))}}))),,,},)))),)))}}||{......},}.,...........{,|}}}}.(((((((....)))))))|((((((((((((((.,.(({{..(((....)))..),),},))))))).((,.(,(({{..{{..((((..(((.((((((((((((....,(((({...((((....((((.(((((....)))))))))..))))..((((.{{...,.......,,..}}.))))}))))).)))))))))))))))..)))).,)),.))),{|,....)}}((((((...))))))(((((......)))))....)))))))}.}},........,{{|....,,,,))},.))).)})}.)))).)))).))..))){{{,....((((((((.....))))))))...,{{{{,,,....,}||,,,,,..,,..((((((((((((,,(({.{.((((((((......)))).)))).)((((((........{(((((..(((((.....((((((..(((((((.((((.((.(({.((.{(({(((..(..(((((......)))))..)..)))..}}}}}}.|||.(((((..((((((((...,(({(((....,,.}))),},...))))).)))....))))),||,,..(((((((.....))))))).,.,,.{||{|.|{||{{{{{|({((({{{{..,|({{,.,.(((((..(((((((((((((...(((.....,...((((((...))))))(((((((.{.......(((((((((..,.((((({.{{({....((,...||,.,|||{{{{.,.))))),})).|(((..,.{(((..{{,.(((((.....((((((.(((.(((((.(((..(((((((((((((.{,((((...((((......(((((((..(.(((((((((,.(((.,.,..(((((..........)))))....,,.))).}.{.((((((......,(((((((((((.,....,...((((((((((.....((((((((.....))))))))...))))))))))..}}.....))))))))))).},....,{{.....))..)))))),))))))))).).)))))))((((((...))))))........((.(((((....))))))).)))))))).},...))))).))))))))...))))))).).)))...))))))....)))))..))}.)))),.}))},,.,....((.((((,..((((((....)))))).},))),))....}}....,)))))}.)))).)))))).)))))))...}}}...)))),...))))))))).}.))))),|}}}|||}|||}}}}.}}}.,,}}........,|||,,},..........,,{{{{{||,..,..,,))})))).(((((((......(((((..(((((..,...,((((,,,,,...}})))}})},)))))..))))).,......))))))).)).))))))).)))).....))))))....)))))..{((((((.(((((((((((..{(({....|}},.,(((...{(({{..{{{{,,......,,.((((((((............)))))))},}}|,{},,,..,,}}|{||||,..,..,,||||.,|.||((((({{..((((((......)))))))},})))).,,.,.}}},..))))))))))).)))))))....{{((((,,{,,.....}},,,}}})}}}))))}....))))))))).,))))))))))))||||.||...(((((...((......))...))))).,....}}}}.{((((({....})))}}},,,.....)))).