Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001349237.2
Sequence Length
4819 nt
GC Content
0.5067
AGAGAGAGCUGUGGUUGCCGGAAGUUGAGCGGCGGCAAGAAAUAAUGGCGGCAGCUACGGGGGAUCCUGGACUCUCUAAACUGCAGUUUGCCCCUUUUAGUAGUGCCUUGGAUGUUGGGUUUUGGCAUGAGUUGACCCAGAAGAAGCUGAACGAGUAUCGGCUGGAUGAAGCUCCCAAGGACAUUAAGGGUUAUUACUACAAUGGUGACUCUGCUGGGCUGCCAGCUCGCUUAACAUUGGAGUUCAGUGCUUUUGACAUGAGUGCUCCCACCCCAGCCCGUUGCUGCCCAGCUAUUGGAACACUGUAUAACACCAACACACUCGAGUCUUUCAAGACUGCAGAUAAGAAGCUCCUUUUGGAACAAGCAGCAAAUGAGAUAUGGGAAUCCAUAAAAUCAGGCACUGCUCUUGAAAACCCUGUACUCCUCAACAAGUUCCUCCUCUUGACAUUUGCAGAUCUAAAGAAGUACCACUUCUACUAUUGGUUUUGCUAUCCUGCCCUCUGUCUUCCAGAGAGUUUACCUCUCAUUCAGGGGCCAGUGGGUUUGGAUCAAAGGUUUUCACUAAAACAGAUUGAAGCACUAGAGUGUGCAUAUGAUAAUCUUUGUCAAACAGAAGGAGUCACAGCUCUUCCUUACUUCUUAAUCAAGUAUGAUGAGAACAUGGUGCUGGUUUCCUUGCUUAAACACUACAGUGAUUUCUUCCAAGGUCAAAGGACGAAGAUAACAAUUGGUGUAUAUGAUCCCUGUAACUUAGCCCAGUACCCUGGAUGGCCUUUGAGGAAUUUUUUGGUCCUAGCAGCCCACAGAUGGAGUAGCAGUUUCCAGUCUGUUGAAGUUGUUUGCUUCCGUGACCGUACCAUGCAGGGGGCGAGAGACGUUGCCCACAGCAUCAUCUUCGAAGUGAAGCUUCCAGAAAUGGCAUUUAGCCCAGAUUGUCCUAAAGCAGUUGGAUGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCAUGGGACCAAGGAUGGUGAACCUCAGUGAAUGUAUGGACCCUAAAAGGUUAGCUGAGUCAUCAGUGGAUCUAAAUCUCAAACUGAUGUGUUGGAGAUUGGUUCCUACUUUAGACUUGGACAAGGUUGUGUCUGUCAAAUGUCUGCUGCUUGGAGCCGGCACCUUGGGUUGCAAUGUAGCUAGGACGUUGAUGAAUGCCAGAGGAUUCAACAUGAGCAUACCUAUGCCUGGGCAUCCAGUGAACUUCUCCAGUGUCACUCUGGAGCAAGCCCGCAGAGAUGUGGAGCAACUGGAGCAGCUCAUCGAAAGCCAUGAUGUCGUCUUCCUAUUGAUGGACACCAGGGAGAGCCGGUGGCUUCCUGCCGUCAUUGCUGCAAGCAAGAGAAAGCUGGUCAUCAAUGCUGCUUUGGGAUUUGACACAUUUGUUGUCAUGAGACAUGGUCUGAAGAAACCAAAGCAGCAAGGAGCUGGGGACUUGUGUCCAAACCACCCUGUGGCAUCUGCUGACCUCCUGGGCUCAUCGCUUUUUGCCAACAUCCCUGGUUACAAGCUUGGCUGCUACUUCUGCAAUGAUGUGGUGGCCCCAGGAGAUUCAACCAGAGACCGGACCUUGGACCAGCAGUGCACUGUGAGUCGUCCAGGACUGGCCGUGAUUGCAGGAGCCCUGGCCGUGGAAUUGAUGGUAUCUGUUUUGCAGCAUCCAGAAGGGGGCUAUGCCAUUGCCAGCAGCAGUGACGAUCGGAUGAAUGAGCCUCCAACCUCUCUUGGGCUUGUGCCUCACCAGAUCCGGGGAUUUCUUUCACGGUUUGAUAAUGUCCUUCCCGUCAGCCUGGCAUUUGACAAAUGUACAGCUUGUUCUUCCAAAGUUCUUGAUCAAUAUGAACGAGAAGGAUUUAACUUCCUAGCCAAGGUGUUUAAUUCUUCACAUUCCUUCUUAGAAGACUUGACUGGUCUUACAUUGCUGCAUCAAGAAACCCAAGCUGCUGAGAUCUGGGACAUGAGCGAUGAUGAGACCAUCUGAGAUGGCCCCGCUGUGGGGCUGACUUCUCCCCGGCCGCCUGCUGAGGAGCUCUCCAUCGCCAGAGCAGGACUGCUGACCCCAGGCCUGGUGAUUCUGGGCCCCUCCUCCAUACCCCGAGGUCUGGGAUUCCCCCCUCUGCUGCCCAGGAGUGGCCAGUGUUCGGCGUUGCUCGGGAUUCAAGAUACCACCAGUUCAGAGCUAAAUAAUAACCUUGGCCUUGGCCUUGCUAUUGACCUGGGACUUGGUCCUCCAUGCAGUUUUUAUUUCUUGUCACAGUGACUGAUAGCCAUCCCCCAGGAUCCUUUCCCCUUGGCCCUGAGGGGGUGACCCAACACAGACCAAAUGGGGAAAUGAGCAACCAGCUCCUGCCCAGAGCCACUGCGGGAGGUGGCACCCUCAUCCCCGGAAUGUGCUGCCCACCGCACCGCAGGCUCCUCCUGUGGGGGCCCUGGGCAUGGGUGAGGGUGGGACCCCGUGAGCGCACUGCACCCUGGCCCUGGUGGAGCGGGAGGAGGAGGAGAGCCGAGCUGGGUACGAGACUAAAGGGCCCACAUGACCCAGUGACGCCAGAUUUCCACCAAGGACUGAGUGAGCUGCUCAGACAUGGCUUUCUGCCUCCCAGCCUGUCCUCCACUGUGGGCAUAGCAUCUGUGCCUGCCUGCCUGCUUGAGGGAGAGGAGUUUCUGCUGCUGCCUUGAGCUGGGGGGAAGAGCCCAGGGGCAGAUCCUGGCAGCUGCCUGGAUGGGGCUCCUCCCUGCCCUUAUGAGCAGGCCAGGCCCAGAAAGGCCGAGCCUGGGCUGCCUUCCUGCCCCAGCCGAGGGAGGGGUCAGACGGCUCUACCAUGGGUAACUCAGGCAAGAGCUGGUUUUCCUCUUUAUUCUGGGUGUGUGCAGCUGUGAGGCCCCAACCCAGGAGAGGCCAUGGCCUAGGUACCUGUGACCACCCUGCCCCCGUGUAGAGGGCAUCGUCUUUCCUGCUAUUUUAUUCUUUCAGCUUUUGUCUUAGGCCCAGAAUCAAAGUGAAAAUUGAGUCGAGCUGACCCUUACAACAGUAGGAUUUAGUAGGGUAGAUUUCAAAUGAGGCUUCGCUUCUCCCAAAGUAGCCAGUCCAAGUUCCAGUGGCUGUCGUUCAGCUCAUGGGAGCUUCAUGGGGACACAGCCGGCACAGGUGCAGGGCCCGAGUCCGCCCACCCAGCCUGGCGCUGAAACUGCACACGUACACUAUGUGGUUUAAGAGCACUUUAUUAUUGUUCUUAAGGCUACUUUUAAGUACAAAAAAAGAUGGCCUGCCAAACCUUUUUUUUUCUUCUUCCAGGAAAAACAGGCCACAGAGAAUGGUAUAUUACAGAUUUACACACAUGAAGAGAAGGUCAGAGCGCACUGCAGGCAGCGCGGCUCUGGGAAGAACUUCACGGAGCCCCUUCUUAGAGCAGGGAGGGGGCUUUCUCAGUGAAAUGUUUGGUUUUCUGCUGCCUCCUCUGCCCCAGGCCCCCCUCCAGGGUACUGCCUAUCCCAGAUAGGUCAGUGCACCAGGGACCCGGCCGCCAGCACCGCCGACCCCUCCCAGAGUGACGCCCUUGUUCACUGACAAAGAGACCUGUCCCAGGAGUGUCCUCCACCGAGCCGGUCAGCUGUGGGUGGUUUUCCUGUUACGACGCUCAGUAGCCUGUAGCAAUAACAAACUCGUGGCUAUGAAUGCAGAUGCAGUGUUCUCAUAGAAUAACUGUUCCUGCACUUUUACAGACAAAUCUACGACAAAAAAAAAGAUCAACUUUUUUUUUCCGAACAACAAAAAAAAUGAAUGAUUACAAUAGGAAAGGGAAAAAUUAAAUAGCUACAUAUCAUUAACAAAUUAAUGUUCUUCAAAAAAUACCUACAAAUUUCUCUGUACAUUCUUUACGCACAGCGUAACGAUGGUCUCAAAAUCACCCAUAUAGAAAAGUGUUCUCAACGAUUUUUCCUACAGAAAAUAUAGGGGCCUGAAUGCCAAAGCUUGGAAGCCCAGUACAGUGGGAGUGAAAUGUGUGCGGGGCAAGGAGAAGGGCUUUUCUUUCCUCCACUUUUCAAAGGCCUGCAGCCACUCUGUGACUACAAGAGCCAGUCCUCCGACCUUUUCACCCAGUGCCAAUUUCCAAAAUUCAACAGCUAAAAACUGUAAAACCGGGGGUCAUACGGUGUGCAGAGUCCACAAAGCCUUGCAGGUGAGGUGACCACGCCCACGUCACCUGGUCAGGUGCCAUCGUCGUGAGCCUCUGGUGGGCCAGGUGGGACACAGCACACCCCAGGGGGAGGGGAUAGAAACGCUCAUUGACCAAAAAGGAGCAGCUGUGACCUCCACAGCUGUGUCUGUCAUGCUUGCUUCAUCUAAUUUCUAGUUAGUAGCUAUUAAUAUAGCAAAUAAUAAAUGCAGUAAUAACAGUAUAAAGUCAGAGGAAUGUAUACUGCCUUGGCCCCAGCGUACGAGGAAGCGUAUAAAACACCAUAUCACAGAUUGUCUGUCAGUAAUCUGCUGUUCAGCCAAGAGAGUUCAAAGGGAGCAGUUUCUGCAUGUAGGGAAGUUGGAAGACACAAACCCCACCUCCCCUGGGAGCUUGUAACAAAGCAGACAGGGAUGCAAAAAUAAAUGAUGUCAGCCUGCAGCCAAACUCCAGCAUCCCACACCGCAGCUGACCCACUGCUCAUCGCGAGGGCCUGCCAGGAGCUGGCCUCCCGCACUACUUGUGAGUAAAGUGAAUAUCAAAUACCAAUCUUAGAGUACAACUGUACCAGCAGUAAGUAUAUCUAGGACUGUAACUGACAAAAAUAAACUAAUUCUGAAAAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1700.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1787.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 993.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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