Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001350481.2
Sequence Length
2674 nt
GC Content
0.4693
GCAGCGCUGCCCAUCAGCUUCAGCGGAGGCCUGAUUCCUGAGGUGCUCUGACUGGAAGGAACCUCCGAGAUCGGAGAGUCUUCCCUGUCUCCUGUUGAUGCUCCCAUUGCACUGAUAGCAGGUGGUCCAUUAUGGCUGACAUGCAAAAUCUGGUAGAAAGAUUGGAGAGGGCAGUGGGCCGCCUGGAGGCAGUAUCUCAUACCUCUGACAUGCACCGUGGGUAUGCAGACAGUCCUUCAAAAGCAGGAGCAGCUCCAUAUGUGCAGGCAUUUGACUCGCUGCUUGCUGGUCCUGUGGCAGAGUACUUGAAGAUCAGUAAAGAGAUUGGGGGAGACGUGCAGAAACAUGCGGAGAUGGUCCACACAGGUUUGAAGUUGGAGCGAGCUCUGUUGGUUACAGCUUCUCAGUGUCAACAGCCAGCAGAAAAUAAGCUUUCCGAUUUGUUGGCACCCAUCUCAGAGCAGAUCAAAGAAGUGAUAACCUUUCGGGAGAAGAACCGAGGCAGCAAGUUGUUUAAUCACCUGUCAGCUGUCAGCGAAAGUAUCCAGGCCCUGGGCUGGGUGGCUAUGGCUCCCAAGCCUGGCCCUUAUGUGAAAGAAAUGAAUGAUGCCGCCAUGUUUUAUACAAACCGAGUCCUCAAAGAGUACAAAGAUGUGGAUAAGAAGCAUGUAGACUGGGUCAAAGCUUAUUUAAGUAUAUGGACAGAGCUGCAGGCUUACAUUAAGGAGUUCCAUACCACCGGACUGGCCUGGAGCAAAACGGGGCCUGUGGCAAAAGAACUGAGCGGACUGCCAUCUGGACCCUCUGCCGGAUCAUGUCCUCCUCCCCCUCCACCAUGCCCCCCUCCUCCCCCAGUCUCUACCAUUUCAUGCUCAUAUGAGUCUGCUUCCCGCUCAUCACUGUUCGCGCAGAUUAAUCAGGGGGAGAGCAUUACACAUGCCCUGAAACAUGUAUCUGAUGACAUGAAGACUCACAAGAACCCUGCCCUGAAGGCUCAGAGUGGUCCAGUACGCAGUGGCCCCAAACCAUUCUCUGCACCUAAACCCCAAACCAGCCCAUCCCCCAAACGAGCCACAAAGAAGGAGCCAGCUGUACUUGAACUGGAGGGCAAGAAGUGGAGAGUGGAAAAUCAGGAAAAUGUUUCCAACCUGGUGAUUGAGGACACAGAGCUGAAACAGGUGGCUUACAUAUACAAGUGUGUCAACACGACAUUGCAAAUCAAGGGCAAAAUUAACUCCAUUACAGUAGAUAACUGUAAGAAACUUGGCCUGGUAUUCGAUGACGUGGUGGGCAUUGUGGAGAUAAUCAACAGUAAGGAUGUCAAAGUUCAGGUAAUGGGUAAAGUGCCAACCAUAUCCAUCAACAAAACAGAUGGCUGCCAUGCUUACCUGAGCAAGAAUUCCCUGGAUUGUGAAAUAGUCAGUGCCAAAUCUUCCGAGAUGAAUGUCCUCAUUCCUACAGAAGGCGGUGACUUUAAUGAAUUCCCAGUUCCUGAGCAGUUCAAGACCCUAUGGAACGGGCAGAAGUUGGUCACCACAGUGACAGAAAUUGCUGGAUAAGCGAAGUGCCACUGGGUUCUUUGCCCUCCCUUCACACCAUGGGAUAAAUCUGUAUCAAGACGGUUCUUUUCUAGAUUUCCUCUACCUUUUUGCUCUUAAAACUGCUUCUCUGCUCUGAGAAGCACAGCUACCUGCCUUCACUGAAAUAUACCUCAGGCUGAAAUUUGGGGUGGGAUAGCAGGUCAGUUGAUCUUCUGCAGGAAGGUGCAGCUUUUCCAUAUCAGCUCAACCACGCCGCCAGUCCAUUCUUAAGGAACUGCCGACUAGGACUGAUGAUGCAUUUUAGCUUUGAGCUUUUGGGGGUUAUUCUACCAACAAACAGUCCAUUGGAAAGAAAACAGUCCCUGGAAUUAACAGAUCAGAAUGUUCACACUGGUUAAUCUUUUUUUAACAAUGAGCAUGAAGGUAGCAGAAGCUGGUGUGUUUCCAGAUGGUUCUUCUAACCAAACUAAUUUUUCACUGUUGACAAGCGAGGCAAGGGUUGCACUGGACCAAAGGCUGAGGCUUGGCCAUCUAGCAUUCCAUACAAAAUUGUUUCCUAUAAGCAUUCCUUUUAUUCUCUAUUCUAUCCUGGGUCUGCCUCAACCGUGAGAUAGGAGAGUCUCUGGUACUAGCUGCUGUAGCAGUGCCCUUCAUCCAGGGCAGUUAAUGGAGUCUUGGACCCUUUCUUUCUCUGGGAUCCCUGCCCAGCACCUUCCUAUAGAGAUGACUUUAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCACAUGAUUUCAAGGAGUCUGGCAUUCCUGAAUCCUUCUUCCCUGCCAGGUGCCUGUCACCUGUCUUCACUGCCUCCUUUUCCCUGUCAUGCUCAUCAGCUUAUGGCUUCUGUCUAAGCACCUGAACAGAGGACUGAAACCUCCACUGCAGGCUGGUUUUAGGUCUUGAAUUAUGUAAGAAUCUUGCACAGCACUGCUAAUGUAAAUUUCAGUUGUUUUUCCCUCUAGGACAAACACUUACCAAAAUAUGCAACUUUUUUUUGGUGGGAAGAGAGAUUGUCCUGUGAUUUCUACCCAUUUCCUGAGGCCUGUGGAAAUAAACCUUUAUGUACUUAAAGUUAUACAGAAAAUAGAAUAAAGUUAAUACCAAACUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-817.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -864.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 577.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((.....))))(((((.((((((((........))).((((((...(((((..(((((((....))))).)))))))(((((((((((((.(((.......))).))))))(((((((((((((...(((....(.((..((((.......)))))).)...)))))))))))))))))))))))..((((((((((.((........)).))))))).)))..(((((.(((.(.((((.((.((.........))..)).((((..(((((((.((((((.((...(((((.((.((((.((.((.....((((((((((((((...((((......))))(((((((.((.....))...(((((((..((.(((...))).))..)))))))...((((((((((....(.((((......)))).)..))))))))))))))))).(((...((((......))))...)))((((........))))((((((.((.((......)).))....)))))).((....)).((((((((...((.(.(((((.(((((((((......((((..((((.............)))).))))(((((((((.(((.....((....)).....)))..))))))))).....((((.(((((.((..(((...((((....)))).....)))..))))))).)))).......))))..)))))))))).).)))))))))).......(((((..((((....((....(((.((((....((((((........))))))...))))..)))...))))))...)))))....)))))))))))))).....((((((.((((..((...((((((((.((.....((((....)))).......)).)))).))))....(((((........))))).))..))))))))))))))..)))).)).)))))((((....))))...)).)))))).)))))))...))))(((((((((((..((....(((...((((..((..........(..((........))..)..........))..)))).)))..))..))))))))))).......(((((...)))))..)))).)..)))))))).)))))).....(((((((((.((((((....))))))...((((.(((((...((((.((.(((...........(((((((.....))))))).....))).))))))...))))).))))..(((((..((((((..((((...((.(((((((((...((((((((((((((((..((....))..))))))).............(((......)))))))))))).(((..(((((((..((((((..(((((.((((...(((...(.(((((......))))).)...))).)))).))))).((((.....(((.(((((..((..(((...))).))..)))))))).....))))(((((....)))))..........(((...((((((.(((....))).))))))..))).))))))))).))))....))).......))).))))))..)).))))..)))))).....))))).......((((((((......)))))))).)))))))))))))).))))).....((.(((((((((((...((((((((..(((((.(((((..((((((..((((((((((((((..........)))).........((.((((((........)).)))).))....((((((............((((...))))((((..(((......)))..))))))))))...(((((((((...((((..(((((((((........(((((((.....(((((.......)))))..)))))))....((.((((.((((((((.....(((((.((((((((((............((((((.(((((..((.((((((((((.(((..(((.(((..(((....)))))))))....))).)))........)))))))))....(((..(((....................)))..))).))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))).))..((((((......))))))))))))....))).))))..))))))))).((((.......))))))))))))))...((((((((...(((((((...............................(((((.((.((....)).)).))))).........((((((.....))))))...........)))))))....))))).)))....(((((.(((....)))))))).(((......)))(((((((........((((((((((...((((((((.......)))).)))).)).)))).)))).........)))))))(((((.(((.....))).)))))..((((((((............))))))))))))))..))))).)))))...)))))))))))))....)))))).))........(((((......)))))...................(((((.......))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,..((((.....}}}}(((((.((((((((.,....,.||}|((((((...((((({.,{(((((....))))).}))))))(((((((((((({.(((.......))).})))))(((((((((((({.,,,((..,.(.({..{(((.......)))))).),.,)})))))))))))))))))))))..((((((((((.((........)).))))))).)))..(((({{{{,.{,((((,{{{{{,.,....{{|}.,}},|,||..{((((((.((((((.((...(((((.((.((((..{.{{.,...((((((((((((((...{(((......)))}(((((((,(((.((({{,,.,{{{{(((({,.{({((((((((((,|,{(|....,}})}....)))))))))}......))))))})))))))))).},))))))).(((...((((......))))...)))((((........))))((((((.,{.{(......}}.}}....)))))).{{....||.((((((((,,((((({(({(({{{,{|||||,,|}}}|||,{{(((((({......,,,.,,,,.{,.,{||{{{{||,|{{...,{.,{{{{,{.....},,....,,}}})},,...,{{{.{((((.{{..{{(...((({....}))).....)))..))))))).)))),},.,,,))||,,||,,,,,,,,))})))))))))),,.....(((((.,((((....{(....(((.((((,{..((((((........)))))),,.))))..)))...}))))),}.)))))....)))))))))))))).....((((((.((((..((,,.((((((((.((.,,..((((....))))....,,.)).))))}})))....(((((........))))).))..)))))))))))},},.)))).)).)))))((((....))))...)).)))))).)))))))...,,,.(((((((((((..((....(((...((((..({..........{..({........)).,)..,.,,....))..)))).)))..})..))))))))))).....,,((({,...}))))..}))),}..}})))))).)))})),,,..(((((((((.((((((....))))))...((((.(((((.,.(((,{((.(((.......,...(((((((.....))))))),,...))).)))))).,.))))).))))..(((((..((((((..((((...((.(((((((((...((((((((((((((((..({....}}..}}}}|||,.........}||||,.,}},,,})))))))))).{({..(((((((..((((((..(((((.((((...(((...,,({{((,,,...}))))},...))).)))).)))))....,.....{((.(((((..((..(({...})).))..)))))}||{{{..,||,({{((,.,,})))},....|||||{{,...((((((.{((....))).))))))..}}}.))))))))).))))....))}.......)))},}))))..}).))))..)))))).....))))).......((((((((......)))))))).)))))))))})))).}}}}}.....(({((((,,,,{,,...((((((((..(((((.(((((..((((((..((((((((((((((.......,..||}|.......,.((.((((((........)),,))).)).,..{|{{||,,,..,......||||..,}}}|((((..(((......)))..))))})))})...(((((((((...((((,,(({{{{{{{...,,...(((((((.....(((((.......)))))..)))))))...|{{.((((.((((((((.....(((((.((((((((((............((((((.(((((...({{((((,{(((.{({..(((,{{{,,(({.,.,||||}))),...,))|.}}}........,}))}|,....,}|||..|||,..............,.,,}}})}}))).))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))).}}..((((((......)))))))))}}}....}}}.))))..))))))))).((((.......))))))))))))))...((((((((...(((((((.........................{,,,,,,((({,({.{{.|,,}},|||}},,,.......|,{(((((.....))))))...........)))))))....))))).)))....(((((.(((....)))))))).(((......)))(((((((....{,..(((((((({{...((((((((.......))))},))).)}.)))).))))...,}....)))))))(((((.(((.....))).))))).,((((((((.,........,.))))))))))))))..))))).)))))...))))))))}}}})}}}}))}}})|))...,....(((((......))))),},},,,,...........{((((.......))))}.
Back