Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001350483.2
Sequence Length
2608 nt
GC Content
0.4682
GAGAUUGCUGGGCGGUUCUUGCCGGAAGCGGAGAGCGGCUGAUCGCAGUCCGGAGCAGGUGGUCCAUUAUGGCUGACAUGCAAAAUCUGGUAGAAAGAUUGGAGAGGGCAGUGGGCCGCCUGGAGGCAGUAUCUCAUACCUCUGACAUGCACCGUGGGUAUGCAGACAGUCCUUCAAAAGGAGCAGCUCCAUAUGUGCAGGCAUUUGACUCGCUGCUUGCUGGUCCUGUGGCAGAGUACUUGAAGAUCAGUAAAGAGAUUGGGGGAGACGUGCAGAAACAUGCGGAGAUGGUCCACACAGGUUUGAAGUUGGAGCGAGCUCUGUUGGUUACAGCUUCUCAGUGUCAACAGCCAGCAGAAAAUAAGCUUUCCGAUUUGUUGGCACCCAUCUCAGAGCAGAUCAAAGAAGUGAUAACCUUUCGGGAGAAGAACCGAGGCAGCAAGUUGUUUAAUCACCUGUCAGCUGUCAGCGAAAGUAUCCAGGCCCUGGGCUGGGUGGCUAUGGCUCCCAAGCCUGGCCCUUAUGUGAAAGAAAUGAAUGAUGCCGCCAUGUUUUAUACAAACCGAGUCCUCAAAGAGUACAAAGAUGUGGAUAAGAAGCAUGUAGACUGGGUCAAAGCUUAUUUAAGUAUAUGGACAGAGCUGCAGGCUUACAUUAAGGAGUUCCAUACCACCGGACUGGCCUGGAGCAAAACGGGGCCUGUGGCAAAAGAACUGAGCGGACUGCCAUCUGGACCCUCUGCCGGAUCAUGUCCUCCUCCCCCUCCACCAUGCCCCCCUCCUCCCCCAGUCUCUACCAUUUCAUGCUCAUAUGAGUCUGCUUCCCGCUCAUCACUGUUCGCGCAGAUUAAUCAGGGGGAGAGCAUUACACAUGCCCUGAAACAUGUAUCUGAUGACAUGAAGACUCACAAGAACCCUGCCCUGAAGGCUCAGAGUGGUCCAGUACGCAGUGGCCCCAAACCAUUCUCUGCACCUAAACCCCAAACCAGCCCAUCCCCCAAACGAGCCACAAAGAAGGAGCCAGCUGUACUUGAACUGGAGGGCAAGAAGUGGAGAGUGGAAAAUCAGGAAAAUGUUUCCAACCUGGUGAUUGAGGACACAGAGCUGAAACAGGUGGCUUACAUAUACAAGUGUGUCAACACGACAUUGCAAAUCAAGGGCAAAAUUAACUCCAUUACAGUAGAUAACUGUAAGAAACUUGGCCUGGUAUUCGAUGACGUGGUGGGCAUUGUGGAGAUAAUCAACAGUAAGGAUGUCAAAGUUCAGGUAAUGGGUAAAGUGCCAACCAUAUCCAUCAACAAAACAGAUGGCUGCCAUGCUUACCUGAGCAAGAAUUCCCUGGAUUGUGAAAUAGUCAGUGCCAAAUCUUCCGAGAUGAAUGUCCUCAUUCCUACAGAAGGCGGUGACUUUAAUGAAUUCCCAGUUCCUGAGCAGUUCAAGACCCUAUGGAACGGGCAGAAGUUGGUCACCACAGUGACAGAAAUUGCUGGAUAAGCGAAGUGCCACUGGGUUCUUUGCCCUCCCUUCACACCAUGGGAUAAAUCUGUAUCAAGACGGUUCUUUUCUAGAUUUCCUCUACCUUUUUGCUCUUAAAACUGCUUCUCUGCUCUGAGAAGCACAGCUACCUGCCUUCACUGAAAUAUACCUCAGGCUGAAAUUUGGGGUGGGAUAGCAGGUCAGUUGAUCUUCUGCAGGAAGGUGCAGCUUUUCCAUAUCAGCUCAACCACGCCGCCAGUCCAUUCUUAAGGAACUGCCGACUAGGACUGAUGAUGCAUUUUAGCUUUGAGCUUUUGGGGGUUAUUCUACCAACAAACAGUCCAUUGGAAAGAAAACAGUCCCUGGAAUUAACAGAUCAGAAUGUUCACACUGGUUAAUCUUUUUUUAACAAUGAGCAUGAAGGUAGCAGAAGCUGGUGUGUUUCCAGAUGGUUCUUCUAACCAAACUAAUUUUUCACUGUUGACAAGCGAGGCAAGGGUUGCACUGGACCAAAGGCUGAGGCUUGGCCAUCUAGCAUUCCAUACAAAAUUGUUUCCUAUAAGCAUUCCUUUUAUUCUCUAUUCUAUCCUGGGUCUGCCUCAACCGUGAGAUAGGAGAGUCUCUGGUACUAGCUGCUGUAGCAGUGCCCUUCAUCCAGGGCAGUUAAUGGAGUCUUGGACCCUUUCUUUCUCUGGGAUCCCUGCCCAGCACCUUCCUAUAGAGAUGACUUUAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCACAUGAUUUCAAGGAGUCUGGCAUUCCUGAAUCCUUCUUCCCUGCCAGGUGCCUGUCACCUGUCUUCACUGCCUCCUUUUCCCUGUCAUGCUCAUCAGCUUAUGGCUUCUGUCUAAGCACCUGAACAGAGGACUGAAACCUCCACUGCAGGCUGGUUUUAGGUCUUGAAUUAUGUAAGAAUCUUGCACAGCACUGCUAAUGUAAAUUUCAGUUGUUUUUCCCUCUAGGACAAACACUUACCAAAAUAUGCAACUUUUUUUUGGUGGGAAGAGAGAUUGUCCUGUGAUUUCUACCCAUUUCCUGAGGCCUGUGGAAAUAAACCUUUAUGUACUUAAAGUUAUACAGAAAAUAGAAUAAAGUUAAUACCAAACUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-792.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -839.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 756.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((.(((.(((((..(((....)))))))).))).)..)))))))((((((((((((.....(((.....)))((((((...((((((..((..((.((((((((.((((((((((((((.(.(.((((((((((.((........)).))))))).))).).))))))....((((...))))..((((....)))).....(((((((.((((((.((...(((((.((.((((.((.((.....((((((((((((((...((((......))))(((((((.((.....))...(((((((..((.(((...))).))..)))))))...((((((((((....(.((((......)))).)..))))))))))))))))).(((...((((......))))...)))((((........))))((((((.((.((......)).))....)))))).((....)).((((((((...((.(.(((((.(((((((((......((((..((((.............)))).))))(((((((((.(((.....((....)).....)))..))))))))).....((((.(((((.((..(((...((((....)))).....)))..))))))).)))).......))))..)))))))))).).)))))))))).......(((((..((((....((....(((.((((....((((((........))))))...))))..)))...))))))...)))))....)))))))))))))).....((((((.((((..((...((((((((.((.....((((....)))).......)).)))).))))....(((((........))))).))..))))))))))))))..)))).)).)))))((((....))))...)).)))))).))))))).......(((((((((((..((....(((...((((..((..........(..((........))..)..........))..)))).)))..))..))))))))))).......(((((...)))))...(((..((.((((((((..((((((.......))))))((((((....))))))((.((((.(((((...((((.((.(((...........(((((((.....))))))).....))).))))))...))))).)))).))(((((((.....((((((..(((...(((..((...((((((((((((((((..((....))..))))))).............(((......))))))))))))..))..))))))))))))........)))))))..((((....))))...)))))))).))...))).))))(((((((..(((.....(((.(((((..((..(((...))).))..)))))))).....)))))))))).(((((.((....(((((.....)))))..)).)))))))))).)))))))))).))........(((..((((((....((((....))))...))))))))))))))).)))))).........((((((((......))))))))..)))))))).))))...........((.(((((((((((...((((((((..(((((.(((((..((((((..((((((((((((((..........)))).........((.((((((........)).)))).))....((((((............((((...))))((((..(((......)))..))))))))))...(((((((((...((((..(((((((((........(((((((.....(((((.......)))))..)))))))....((.((((.((((((((.....(((((.((((((((((............((((((.(((((..((.((((((((((.(((..(((.(((..(((....)))))))))....))).)))........)))))))))....(((..(((....................)))..))).))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))).))..((((((......))))))))))))....))).))))..))))))))).((((.......))))))))))))))...((((((((...(((((((...............................(((((.((.((....)).)).))))).........((((((.....))))))...........)))))))....))))).)))....(((((.(((....)))))))).(((......)))(((((((........((((((((((...((((((((.......)))).)))).)).)))).)))).........)))))))(((((.(((.....))).)))))..((((((((............))))))))))))))..))))).)))))...)))))))))))))....)))))).))........(((((......)))))...................(((((.......))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.(((((((((({,(((.,.,||||||||{|||,...})}}))}|{,,((((((((((((,.,{,((..,.{.((,,((((.......)))))}.},.|)|)))))))))))))|((((((((.,{{{{{(({{.((.,,.,,,,||,||||}||.|||.,,{{{{{...,}|||{{{{|},}|,,,(({{{{||||,|{..,((((((.((((((.((...(((((.((.((((..,.||.,,..((((((((((((((...{(((......)))}(((((((,(((.((({{,,.,{{{{(((({,.{({((((((((((,|,{(|....,}})}....)))))))))}......))))))})))))))))).},))))))).(((...((((......))))...)))((((........))))((((((.,{.{(......}}.}}....)))))).{{....||.((((((((,,((((({(({(({{{,{|||||,,|}}}|||,{{(((((({......,,,.,,,,.{,.,{||{{{|||,|{{...,{.,{{{{,{.....},,....,,}}})},,...,{{{.{{({(.{{..|{{...((({....}})).....)))..))))))).)))),},.,,,))||,,||,,,,,,,,))})))))))))),,.....(((((.,((((....{(....(((.((((,{..((((((........)))))),,.))))..)))...}))))),}.)))))....)))))))))))))).....((((((.((((..(({{.((((((((.((.,,..((((....))))....,}.)).))))}}))}....(((((........))))).}}..)))))))))))}}}}.}))).}).)))))((((....|))},..)).)))))}.))))))}.......{{{{{{{((((.{((...{(((,,,,((({,{{..........,.,{,.....{{{|{{{..{{{{{,...,,..,,,|{|||{{||{{||||||}||||,,,..{,{{{,...,}))))..|(({{,({.{(((({({..{((((|...,,,,|))))}((((((....)))))){,.((((.(((((.,.(((,,((.(((.......,...(((((((.....))))))),,...))).)))))).,.))))).)))).}}((((((({,...((((((..(((...(((..((...((((((((((((((((..({....}}..}}}}|||,.........}||||,.,}},,,}))))))))))..))..)))})}}))))),....,,.)))))))..,(((....}}}},,.}}}}}))),))...}}),,}},(((((({..{{(.....(((.(((((..((..(((...))).))..)))))))).,...}}}))))))).{((((,{,....|||||,....,||||,{,|{|,,,,))).)}})))},||||.,,.,,,,,.)))}..,{{(({....,{||,...)))).,,)}))))},))))))}}))))))}}}}.....,(((((((......))))))))}}))),,)),))))).,{{{......,,}||||}},...})))))))))),..|||||,,{{{{,{(({{(({.{(((((((({|{{{.......,,,||||.......|.((.((((((........))}}))).)).,..||||||,,,..,......||||.,|}))}{(((..(((......)))..)))},})}}}...((((((({{...({{{,{({{,,,{{{....,...{((((((...,.(((((.......)))))..))))))),,,|||.((((.((((((((.....(((((.((((((((((............((((((.(((((...({{((((,{(((.{({..((({{{{,,(({.,.,||}}}))),...,))|.,}}........,})}}|,....,}|||..|||,..............,.,,,}})}}))).))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))).}}..{(((((......))))))})},,},,.,}}}.||}},,}}}}}}}}}.{|||.,....,)))))))))))))}.|||||||,|}},,},.||||,.................,}},,..{,,{{,,{(({|{|,{{,|,,}},|||,,.}},.....}}}))))}})}))}))}}))}....})))))))}||||||,.|||,||}|}....||{{{,|||.,,,||}}}}}}..,|}.,}}}))|(((((((....{,..(((((((({{...((((((((.......))))},))).)}.)))).))))...,}....)))))))|((((.(((.....))).))))},{((((((((.,........,.))))))))))}}))},}))))))).))))))))..,,,{{{{{{...,,.,,|,))}}}}....(((((......))))),},},,,,...........(((((.......))))).
Back