Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001352328.2
Sequence Length
923 nt
GC Content
0.5504
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUCGGAAUAACUUCCUGCAGCGACCAACAGGCUAAAGAGGGGGAAGGUCUGGAGGGAUCCAGCACCGGCUCCUCCUCCGGCAACCACGGUGGGAGCGGCGGAGGAAAUGGACAUAAACCCGGGAACUCUGAGACGUCUCCUGGGAUGUUUAACUUUGACACUUUCUGGAAGAAUUUUAAAUCCAAGCUGGGUUUCAUCAACUGGGAUGCCAUAAACAAGAACCAGGUCCCGCCCCCCAGCACCCGAGCCCUCCUCUACUUCAGCCGACUCUGGGAGGAUUUCAAACAGAACACUCCUUUCCUCAACUGGAAAGCAAUUAUUGAGGGUGCGGACGCGUCAUCACUGCAGAAACGUGCAGGCAGAGACGAUCAGCCGGGUGCAGGAUGGCAGGAGGUGGCAGCUGUAACUUCCAAGAACUACAAUUACAACCAGCAUGCGUAUCCCACUGCCUAUGGUGGGAAGUACUCAGUCAAGACCCCUGCAAAGGGGGGAGUCUCACCUUCUUCCUCGGCUUCCCGGGUGCAACCUGGCCUGCUGCAGUGGGUGAAGUUUUGGUAGGCAAUUUCUUGCAACCACCACCGAGGCCCCGAAAAGCACUGGUCGUCAGGGAGCUCCUCCCCUUGGCCCCCAGCCUGUGCCAGCCCUGGCCCGGCUGCCACACCUCUGUUUCCUAGGCUGGGGACCCAGCUUGUCUCUCCUUGUUUCUUCCCACUGCACUGUGGUGCUUCAGUGGCCACCAGCCUCGUCACAUACACCAGCAUCUUUCUGUACCUCCUCCCUUUGGUGACCUGAAGUCACUGUGACAGUUCUCCAGGAAGGAGGAGCUUCCUACUUUUGAGUUUCUCUGUGGAAAUAAAACAUGAAUCUUGUUUCCCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-324.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -341.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 259.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((((........(((((....)))))..........)))))).......)))).))))...(((((((.(((((.((((.((((((((....))))).)))((((((((((((((.((((((((((((((.(((...((...(((((((...(((((((((........)).))))))))))))))..............((((...........)))).((((((.........((((.................)))).........))))))..))..)))))))...(((((((...(((..(((((((......((((((.....((((((......))))))........((((.((.((.(((.....((((((((......((((((..((.....((.(((((.((..((.((.(((((((((((((((..........................)))).)))((((((((((......)))))))..))).......((((((((.(...).)))).)))))))))))).)))).))..))))).))....)).))))))(((((((((.(((((..((((..((((....)))).))))..))(((((....((.((((...(((((((((((((...)))))..)))).(((((((((((.(((((.......))))).))).............))))))))))))..)))).))...))))).)))..))))))))))))))))).....))).))..)).))))...................))))))...)))))))...)))...))))))))))))))...)))..)).)).)))))))))))))).))))).)))....))))((((((((..........))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,..(((((((.,......(((((....))))).......,..)))))))..((((((((((.(((...((((((((((.(((((,{(((.{((((((((,{{((,{{{|,((((((.(({,(..(({...}))..)))).)))))}..{((((((...(((((((((........)).))))))))))))}}.....,,,.......(((((({.........((((((((((,,,.....{(((((,.,...............|||}}||,.{{(({((,,(({.{{(((({,,....,(,{..,,..,,))|||}..{{{.....}}}..,}}((((((......))))))........)}))))})))..,||...,,.(((((......)))))((((((..{..(((((((((.((((.((((((((((({(({((((,.,.,,,...................}}|}.||}(({(((((((......))))))}..})).,.....,{{(((((.,..|}|)|||,|||||,|||}|}.{{,{{((,,.{(((({,,.}}}}}},,,||}}.}}}}))}}},|,..((((..((({....}))).))))..,,,}}}))}}},...,}}.{{||..{{{{((({{...))))),,))))..}}})}}}.}))))..)))))))))))))...}..)))))).,,,,}}}}}}))))))))))))).........,.))))))),,,,||...}||}}|},...({(((.....,,,..)})}}...,,.,.},))))))))).))))))))))))))).,.))))..))).))),..........)))))))(((((((((.........))))))))),{.((((((((..........)))))))),..
Back