Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001358921.2
Sequence Length
1525 nt
GC Content
0.4728
GUCAAUCCGAGCUCGUCCCGGCCUCACCAGCGCCAUGCUGGGCUCGCGAGCCGCGGGGUUCGCGCGGGGCCUGCGGGCUGUGGCACUGGCGUGGCUGCCGGGCUGGCGGGGCCGCUCCUUCGCCCUGGCGCGUGCGGCAGGCGCGCCCCACGGUGGUGACUUGCAGCCCCCCGCCUGUCCCGAGCCGCGCGGGCGCCAGCUCAGUUUGUCCGCGGCGGCGGUGGUGGACUCUGCGCCCCGCCCCCUGCAGCCGUACUUGCGCCUCAUGCGGUUGGACAAGCCCAUUGGAACCUGGCUUCUGUAUUUACCAUGUACCUGGAGCAUUGGUUUGGCAGCUGAACCAGGUUGUUUUCCAGAUUGGUACAUGCUCUCCCUCUUUGGCACUGGAGCUAUUCUGAUGCGUGGAGCAGGCUGUACUAUUAAUGACAUGUGGGACCAGGACUAUGAUAAAAAGGUUACAAGAACAGCCAAUCGUCCAAUAGCCGCUGGAGACAUUUCAACUUUUCAGUCCUUUGUUUUUCUUGGGGGACAGCUAACCCUGGCACUGGGUGUUCUUCUGUGUCUAAAUUACUACAGUAUAGCUCUGGGAGCAGGAUCCUUACUUCUUGUCAUCACCUACCCACUAAUGAAAAGAAUUUCAUACUGGCCUCAACUAGCCUUGGGCUUGACAUUUAAUUGGGGAGCGUUACUUGGAUGGUCUGCUAUCAAGGGUUCCUGUGAUCCAUCUGUUUGCCUGCCUCUUUAUUUUUCUGGAGUUAUGUGGACACUAAUAUAUGAUACUAUUUAUGCCCAUCAGGACAAAAGAGAUGAUGUUUUGAUUGGUCUUAAGUCAACGGCUCUGCGGUUCGGAGAAAAUACCAAGCCGUGGCUCAGCGGCUUCAGUGUUGCAAUGCUGGGGGCACUGAGCCUAGUGGGUGUGAACAGUGGACAGACUGCUCCCUACUACGCUGCCCUGGGUGCUGUAGGAGCCCAUCUGACUCACCAGAUUUACACUCUAGACAUCCACAGACCUGAGGAUUGUUGGAAUAAAUUUAUCUCCAACCGAACACUGGGACUAAUAGUUUUUUUAGGGAUUGUCCUUGGGAAUUUGUGGAAAGAAAAGAAGACAGACAAAACAAAGAAGGGUAUAGAGAAUAAAAUAGAAAAUUAAUGAAUGAAAUUUAUCUAGGAAUUUUUAAAACAUUUUUUACAAAAUAUAAUUAGAUUUGAAUACAAAAUCUGAUACAAUAUGUUAAAGAAUUAAGAACCUGAAGAUGAAGAUUUAGAGCAUAUUUACCUGGAUUUUACUUAUUUGCUAGCAAAAUUCCCCCUUGUCACAGAAACCAGGGACUCUUCAGGAUUUGAGAUGGCCUUGAGUAUUUUAGUUGAUACAUUCUUCUGCCCAUUAUAAUUCUCACCUGAAGUUAUGGGGAUUGCACGGGUUUUGGCACUUUAGAAAAAGCCUGAUGUGGGUCUUACAUAAAUGAAUGUCUGUAUAAGAAAAUGGACUCUUUUUUUUAGGGAAAAAUAAAAGCAACUAUGGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-492.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -523.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 494.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((((...((((((.(((((.....)))))...((((((((....)))))))).)))))).))))))).((((.((.((((((((.(.((((.((((((((.((....(((((.(((.((((((.....)))))).))).)))))......)).)))))..))).)))).))))))))).)).))))(((((((((((((((((.(((((.((((.......))))))))).))..((((((((...........))))))))((((((......(((.((((.((((.........((((((((((((((((((((((((...)))))))))..)))..))))....))))))))......((((...(((.((((.....)))).)))..))))(((((((((((..((((........(((((((((((.(......).))))..(((((((.(((.((.((((........))))))...............((((((((.......)))))))).((((....))))..))).)))))))))).))))..))))....)))))))).))))))))))).)))......)))))).((((..((((((((((((((....))))))...(((........)))..(((((((((...(((..(((.((.((....(((((((......(((((((...))).)))))))))))...)))).)))..)))......(((.((((((((........)))))))).))).....(((.(((((((((..(....)..))))))))).))).....))))..))))).((((((.((........)).))))))(((((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))))))))))))))))...)))))))))))(((((.(((..((((......))))..))))))))..(((((......))))).....(((((.((.(((((((((((((((((.(((((((((....))).))))))............((((........)))).....)))))))))..)))))))).....................(......).)).)))))......................((((.((((((((((..((((((....((((((((....((((.(((((((((.......)))))))))...))))..)))))))))))))))))..)))))))..)))))))).........))))))...((((((((((.......((((((((((..........)))))...(((((((...(((((.(((...(((((((......)))))..))....))).........))))))))))))((((((((((((((((((((((..(......)..)))))))).))).)))))).)))))......((((((........))))))...........))))).......)))))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((.(((((((...((((((.(((((,...,)))))...((((((((....)))))))).)))))).))))))).((((.((.((((((((.,,((((.((((((({.((,...(((((,(((.((((((.....)))))).))).))})),)}...)).)),))})))).)})),))))))))).)).))))||,{,((((((((((((.(((((.((((.......))))))))).)).}|(((((((...,.....,.))))))))||||||}..,,,(((.{{((((((({(({{.,{.(((({,{((((((({{((((((((...))))))))),,)}}.,||||.,,{||||||}|{,{{,{({{,..,(({.,(((|,..,)))).))),.)))),||||||||||}.....,..||,||||||||||,|||||.|,....|||},,,||||,|}}}|...,||||,},,,,||{{|(({{{{{{{,.......{((((((.({{{{{{..{|||||,.{{{{,,,{||||.,|||{||||||||{|||||{,.,,,..,,|||||||||{||||||{{{(|{,,,.....,))))}}.||{|,.{(((({{{((((({....})))))...(((,.,,....}}}.,|||||{|,,.....,.}|||||||{{|||,{|(((((....}}|||,|||||{|||||}||||}|||{{{{||||{,|{{{{|..,,,,,{{{,((({((({,.,.....}}}}}}}}.,},.{||.(((.(((((((((..,....}..))))))))).))}..}}}))},|||}}}},{(((({.{{........)).))))))(((((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))))}}}}||||||||{,.||||,||||,,{(({{{(((..((((......))))..))))))))..,||||...,,}}})})}}},}}}},,,,..(((((((((((((((((.((((((({{....}}}.)))))),.....,{{|{,({,,.,,},,,.}))).....)))))))))..)))))))).,},,,}}}}}}}}},}},,.}..,}}.)))}}}}},}|,|...........,...,,..,,,..{{((((((((..{(((((,...{(((((((,,..,{,{.(((((((((.......)))))))))...,}})},}))))))))))))}))},.|)))}}||||||||,,},,...,.}))))}}}|,.,|,,,,|,,}}},.,...}))}})..}....}))})).))))})){{{{{||...{((({|{{{,..{|(((({......))))}..))...,)}}||......,||}}}}}})))){{(((|((((((((((((((((..(......)..)))))))).))),}))))}.)))}}..},,}||||||...,,,.,|}}},}.|||||}||}}}})}........}},.....,,))}.
Back