Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001362531.2
Sequence Length
1492 nt
GC Content
0.6501
GUUCGCCUGCGUCGCUCCGGGAGCUGCCGACGGACGGAGCGCCCCCGCCCCCGCCCGGCCGCCCGCCCGCCGCCGCCAUGCCCUUCUCCAACAGCCACAACGCACUGAAGCUGCGCUUCCCGGCCGAGGACGAGUUCCCCGACCUGAGCGCCCACAACAACCACAUGGCCAAGGUGCUGACCCCCGAGCUGUACGCGGAGCUGCGCGCCAAGAGCACGCCGAGCGGCUUCACGCUGGACGACGUCAUCCAGACAGGCGUGGACAACCCGGGCCACCCGUACAUCAUGACCGUGGGCUGCGUGGCGGGCGACGAGGAGUCCUACGAAGUGUUCAAGGAUCUCUUCGACCCCAUCAUCGAGGACCGGCACGGCGGCUACAAGCCCAGCGAUGAGCACAAGACCGACCUCAACCCCGACAACCUGCAGGUGCGGGGCUGCGGGCGGGCCGGGCGGGCGGGGCCGGGGUCUUCGGGCGCUCACUCCCGUCUCGCCUCCCAGGGCGGCGACGACCUGGACCCCAACUACGUGCUGAGCUCGCGGGUGCGCACGGGCCGCAGCAUCCGUGGCUUCUGCCUCCCCCCGCACUGCAGCCGCGGGGAGCGCCGCGCCAUCGAGAAGCUCGCGGUGGAAGCCCUGUCCAGCCUGGACGGCGACCUGGCGGGCCGAUACUACGCGCUCAAGAGCAUGACGGAGGCGGAGCAGCAGCAGCUCAUCGACGACCACUUCCUCUUCGACAAGCCCGUGUCGCCCCUGCUGCUGGCCUCGGGCAUGGCCCGCGACUGGCCCGACGCCCGCGGUAUCUGGCACAAUGACAAUAAGACCUUCCUGGUGUGGGUCAACGAGGAGGACCACCUGCGGGUCAUCUCCAUGCAGAAGGGGGGCAACAUGAAGGAGGUGUUCACCCGCUUCUGCACCGGCCUCACCCAGAUUGAAACUCUCUUCAAGUCUAAGGACUAUGAGUUCAUGUGGAACCCUCACCUGGGCUACAUCCUCACCUGCCCAUCCAACCUGGGCACCGGGCUGCGGGCAGGUGUGCAUAUCAAGCUGCCCAACCUGGGCAAGCAUGAGAAGUUCUCGGAGGUGCUUAAGCGGCUGCGACUUCAGAAGCGAGGCACAGGCGGUGUGGACACGGCUGCGGUGGGCGGGGUCUUCGACGUCUCCAACGCUGACCGCCUGGGCUUCUCAGAGGUGGAGCUGGUGCAGAUGGUGGUGGACGGAGUGAAGCUGCUCAUCGAGAUGGAGCAGCGGCUGGAGCAGGGCCAGGCCAUCGACGACCUCAUGCCUGCCCAGAAAUGAAGCCCGGCCCACACCCGACACCAGCCCUGCUGCUUCCUAACUUAUUGCCUGGGCAGUGCCCACCAUGCACCCCUGAUGUUCGCCGUCUGGCGAGCCCUUAGCCUUGCUGUAGAGACUUCCGUCACCCUUGGUAGAGUUUAUUUUUUUGAUGGCUAAGAUACUGCUGAUGCUGAAAUAAACUAGGGUUUUGGCCUGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-658.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -685.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 381.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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