Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001362750.2

Sequence Length

1774 nt

GC Content

0.5586

CCCUGCUCGGCGCUGCCCGCCCAGUUCCUGUUCCCAGACUGAGGCCCAGCCCCCUUCGCCCGUUUCCAUCACGAGUGCCGCCAGCAUGUCUGACAAACUGCCCUACAAAGUCGCCGACAUCGGCCUGGCUGCCUGGGGACGCAAGGCCCUGGACAUUGCUGAGAACGAGAUGCCGGGCCUGAUGCGUAUGCGGGAGCGGUACUCGGCCUCCAAGCCACUGAAGGGCGCCCGCAUCGCUGGCUGCCUGCACAUGACCGUGGAGACGGCCGUCCUCAUUGAGACCCUCGUCACCCUGGGUGCUGAGGUGCAGUGGUCCAGCUGCAACAUCUUCUCCACCCAGGACCAUGCGGCGGCUGCCAUUGCCAAGGCUGGCAUUCCGGUGUAUGCCUGGAAGGGCGAAACGGACGAGGAGUACCUGUGGUGCAUUGAGCAGACCCUGUACUUCAAGGACGGGCCCCUCAACAUGAUUCUGGACGACGGGGGCGACCUCACCAACCUCAUCCACACCAAGUACCCGCAGCUUCUGCCAGGCAUCCGAGGCAUCUCUGAGGAGACCACGACUGGGGUCCACAACCUCUACAAGAUGAUGGCCAAUGGGAUCCUCAAGGUGCCUGCCAUCAAUGUCAAUGACUCCGUCACCAAGAGCAAGUUUGACAACCUCUAUGGCUGCCGGGAGUCCCUCAUAGAUGGCAUCAAGCGGGCCACAGAUGUGAUGAUUGCCGGCAAGGUAGCGGUGGUAGCAGGCUAUGGUGAUGUGGGCAAGGGCUGUGCCCAGGCCCUGCGGGGUUUCGGAGCCCGCGUCAUCAUCACCGAGAUUGACCCCAUCAACGCACUGCAGGCUGCCAUGGAGGGCUAUGAGGUGACCACCAUGGAUGAGGCCUGUCAGGAGGGCAACAUCUUUGUCACCACCACAGGCUGUAUUGACAUCAUCCUUGGCCGGCACUUUGAGCAGAUGAAGGAUGAUGCCAUUGUGUGUAACAUUGGACACUUUGACGUGGAGAUCGAUGUCAAGUGGCUCAACGAGAACGCCGUGGAGAAGGUGAACAUCAAGCCGCAGGUGGACCGGUAUCGGUUGAAGAAUGGGCGCCGCAUCAUCCUGCUGGCCGAGGGUCGGCUGGUCAACCUGGGUUGUGCCAUGGGCCACCCCAGCUUCGUGAUGAGUAACUCCUUCACCAACCAGGUGAUGGCGCAGAUCGAGCUGUGGACCCAUCCAGACAAGUACCCCGUUGGGGUUCAUUUCCUGCCCAAGAAGCUGGAUGAGGCAGUGGCUGAAGCCCACCUGGGCAAGCUGAAUGUGAAGUUGACCAAGCUAACUGAGAAGCAAGCCCAGUACCUGGGCAUGUCCUGUGAUGGCCCCUUCAAGCCGGAUCACUACCGCUACUGAGAGCCAGGUCCAGUGGUUCUUCAGCCCAUGACAGAUGAGAAGGGGCUAUAUUGAAGGGCAAAGAGGAACUGUUGUUUGAAUUUUCCUGAGAGCCUGGCUUAGUGCUGGGCCUUCUCUUAAACCUCAUUACAAUGAGGUUAGUACUUUUAGUCCCUGUUUUACAGGGGUUAGAAUAGACUGUUAAGGGGCAACUGAGAAAGAACAGAGAAGUGACAGCUAGGGGUUGAGAGGGGCCAGAAAAACAUGAAUGCAGGCAGAUUUCGUGAAAUCUGCCACCACUUUAUAACCAGAUGGUUCCUUUCACAACCCUGGGUCAAAAAGAGAAUAAUUUGGCCUAUAAUGUUAAAAGAAAGCAGGAAGGUGGGUAAAUAAAAAUCUUGGUGCCUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-705.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -735.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 453.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((.(((((((((((((...((((((((.......(((((....((((((.(((((.(..((......((((((((((.((((.............(((((...((((((((....))))..))))...)))))(((((((((((.((.((((.(.......).))))))))))))..)))))))))..).)))))))))(((......)))..(((.(((.(((((....((((((((.((.(((......))).)).)))))((((.....).)))(((((((..((((((((..((((((((((......))))))....))))..))))))))...(((((.(((.(((((..((....)))))))..))).)))))((((....))))......))))))).(((((...)))))....)))....(((........))).)))))))))))....))..).)).))).))))))..)))))..................(((((...(((((.(((((.(((..(((.(((((..((.(((.(((((.....(((((.....))))).......(((((((....(((..((....))..)))))))))).(((((..((((...((.....))...))))))))).((((((((((((((((.((((..(((((..((((.((....))))))....))))).)))).)))))).(((.((((((((....((..((((((((((((((..((((...))))((((((....))))))....))))))))))))))..)).....(((.....))))).))))))..)))))))))))))(((..((((((.((.(((.(((((((((((((..((..((..(((....)))..)).))))))))).........)))))).)))..)))))))).)))......((((((((((....((((.((....)).)))).(((((((.(....).)))))))((((((....((...((((........))))....)).)))))).(((((((((....)))))..........))))))))))))))(((((((...))))))))))))..))).))..))))).))))))...((((((((((((.(((...)))..))))((((..(((((((((((((......)))))...))))).........)))..))))((((.........))))..))))))))....))))).)))))..(((((.((((((..(((....((..((((.....)))).)).....)))..))))))....))))).((((((...(((((((((((.(((.((.......))))).((((((((((.......)))))).))))..(((.....))).))))))))))).....))))))...(((((..(((.....))).)))))(((((((((((.....)))))))..))))...((((((((....)))))))).)))))((((((((((((...)))))))))))).(((.((((((........(((........))).....)))))))))(((((((((((((((((.......(((((((..(((((((((....)))))))))..)).))))).......))))))))))))..)))))((((((((..........))))))))...............))))))))))))))).............)))))).))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((.(((((((((((((...((((((((,.,.,..{((((,,..((((((.((({(,(..{{.,....((((((((((.((((,............(((((...((((((((....))))..))))...)))))(((((((((((.((.((((.,,......}.))))))))))))..)))))))))..).)))))))))(((......))}..((.,(((.(((((,.,,||,(((((.((.(((......))).)).)))))(({({,...}|)}}(((((((..((((((((..((((((((((......))))))....))))..))))))))...(((((.(((.(((((..((....)))))))..))).)))))((((....))))......))))))).(((((.,.}}||}..,{,{{{{..,||}}.,,,},})),))))))))))}...,}}..,.)).))).))))))..))))}.,..(((((((((,.........(((((((((((((..(({,.,,.((((((((.((((((..(((....,,{((,({{{,.|,{{....,}.}}.})}}}..}))..))))))))))))))|||{{{,.(((((,.{{((,.,{(,,...}||,.,}}}})))}.((((((((((((((((.((((..(((((..((((.{(....)}))))....))))).)))).)))))).{{{.((((((({..,.({,,{(((((((({((((..((((...)))),{((((....))))},...,)))))))))}}))),,)),,|.,||....,,}).}}.))))))..})))))))))))){{{.,{{((((.((.{({.{(((({(((((((..{(..(({{(,,...,)))}.}).}}))))))).......,.)}}}||,|}|.,|||}}}}}.}))......((((((((((({.{((,,...}}}.)),.(((,(((((((.(....).)))))))))),(({.,,{....{{{|}}.},,..||||..|,||.,||||}.||||{,||{....))))}.....,)}}}))))))))))))))||{||||||,}}}})}||}|||,,,{((((.((.(((...}}}}}.)))))|,,.||||}|||,..,.|{.||{|{.....))))),))}))}},..,)))))))).|||,,,{{{....{.(((((...))))).,.,,,,|}}....,},,}}))))))})),,}}))|}}..(((({.{{||||..(((....{{..((((.....)))).}}.....)))..||||||...,))))).((((((...(((((((((((.(({,((.......))))).((((((((((.......))))))}})))..(((.....))).))))))))))).....))))))...(((((..(((.....))).)))))((({(((((((.....))))))),,))))...((((((((....)))))))).,...(((((((((((((...))))))))))))},{{.{{{({{..,,.,..(({........))).....}}}}})))}(((({((((((((((((.......(((((((..(((((((((....)))))))))..)).))))).......))))))))))))..})))|((((((({..........)))))))),....,,,....,..})))))))))))))).............)))))).))..