Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001363689.2
Sequence Length
4625 nt
GC Content
0.6301
CGGCCCCCAGCGCAAGCGGCGAUGGCGGCGGCGGCGGGAGCUGCAGCGGCGGCGGCCGCCGAGGUGCGGAAGGGGAGGGGGAGAGGCGGGUGCAUGCCCGCGCGCGCGCCCGGGGGAAGCGCGCGCCCGUGCAAUGCUCCGGGGGUGCAACGGGGCCGGGGGGCCCGGGCGGGACUUGCAGCAAUCCAGGGGGCCAGCACCGGGGGCGGAUGAGGGGACCAGGGUGUGGGAGGUGGGGGGAGUGGGCACGGAGGCGCGCGUGCAGCCGCCGGCUGCCCCUGAGUGGGCGACGGGCGCCGGGGCCCCAGGAGCACGCGUGAGGGGCACGAGGGGCCGUCCACCGGGCUGGGGGGCAGCGGGUGCUGGAGGGGUUGGUGCCCGGGGUCCCCGCGGCCUGGGGGACAAAGGGGGAGCGGCGCGUGCAGCCGGGAGGAGGGGGCGGGGCCGGGGCGCGGAGGCCCCGCCCCCUCCCCCUCCUCUUCUCUCGGCCCCAGAGAUGCGGGGUCUACCGAGAGGGAGGGGGUUGAUGCGGGCCCGGGGGAGGGGUCGUGCGGCCCCUCCGGGCAGCCGAGGCCGCGGAAGGGGGGGGCCCCACAGAGGAAGAGGUAGGCCCCGGAGCCUACUCUCUCUUCCCAGGGCCCAGGCAUCCUGGACCCCCCAACUCUCUACUGGGCUGACCAGCCCUCCUGUCCCUUGUCUCCCCUCCCAGGGGGAGGCCCCCGCUGAGAUGGGGGCGCUGCUGCUGGAGAAGGAAACCAGAGGAGCCACCGAGAGAGUUCAUGGCUCUUUGGGGGACACCCCUCGUAGUGAAGAAACCCUGCCCAAGGCCACCCCCGACUCCCUGGAGCCUGCUGGCCCCUCAUCUCCAGCCUCUGUCACUGUCACUGUUGGUGAUGAGGGGGCUGACACCCCUGUAGGGGCUACACCACUCAUUGGGGAUGAAUCUGAGAAUCUUGAGGGAGAUGGGGACCUCCGUGGGGGCCGGAUCCUGCUGGGCCAUGCCACAAAGUCAUUCCCCUCUUCCCCCAGCAAGGGGGGUUCCUGUCCUAGCCGGGCCAAGAUGUCAAUGACAGGGGCGGGAAAAUCACCUCCAUCUGUCCAGAGUUUGGCUAUGAGGCUACUGAGUAUGCCAGGAGCCCAGGGAGCUGCAGCAGCAGGGUCUGAACCCCCUCCAGCCACCACGAGCCCAGAGGGACAGCCCAAGGUCCACCGAGCCCGCAAAACCAUGUCCAAACCAGGAAAUGGACAGCCCCCGGUCCCUGAGAAGCGGCCCCCUGAAAUACAGCAUUUCCGCAUGAGUGAUGAUGUCCACUCACUGGGAAAGGUGACCUCAGAUCUGGCCAAAAGGAGGAAGCUGAACUCAGGAGGUGGCCUGUCAGAGGAGUUAGGUUCUGCCCGGCGUUCAGGAGAAGUGACCCUGACGAAAGGGGACCCCGGGUCCCUGGAGGAGUGGGAGACGGUGGUGGGUGAUGACUUCAGUCUCUACUAUGAUUCCUACUCUGUGGAUGAGCGCGUGGACUCCGACAGCAAGUCUGAAGUUGAAGCUCUAACUGAACAACUAAGUGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAUGAGGAGUCAGGGAAUCAGUCAGAUAGGAGUGGUUCCAGUGGCCGGCGCAAGGCCAAGAAGAAAUGGCGAAAAGACAGCCCAUGGGUGAAGCCGUCUCGGAAACGGCGCAAGCGGGAGCCUCCGCGGGCCAAGGAGCCACGAGGAGUGAAUGGUGUGGGCUCCUCAGGCCCCAGUGAGUACAUGGAGGUCCCUCUGGGGUCCCUGGAGCUGCCCAGCGAGGGGACCCUCUCCCCCAACCACGCUGGGGUGUCCAAUGACACAUCUUCGCUGGAGACAGAGCGAGGGUUUGAGGAGUUGCCCCUGUGCAGCUGCCGCAUGGAGGCACCCAAGAUUGACCGCAUCAGCGAGAGGGCGGGGCACAAGUGCAUGGCCACUGAGAGUGUGGACGGAGAGCUGUCAGGCUGCAAUGCCGCCAUCCUCAAGCGGGAGACCAUGAGGCCAUCCAGCCGUGUGGCCCUGAUGGUGCUCUGUGAGACCCACCGCGCCCGCAUGGUCAAACACCACUGCUGCCCGGGCUGCGGCUACUUCUGCACGGCGGGCACCUUCCUGGAGUGCCACCCUGACUUCCGUGUGGCCCACCGCUUCCACAAGGCCUGUGUGUCUCAGCUGAAUGGGAUGGUCUUCUGUCCCCACUGUGGGGAGGAUGCUUCUGAAGCUCAAGAGGUGACCAUCCCCCGGGGUGACGGGGUGACCCCACCGGCCGGCACUGCAGCUCCUGCACCCCCACCCCUGUCCCAGGAUGUCCCCGGGAGAGCAGACACUUCUCAGCCCAGUGCCCGGAUGCGAGGGCAUGGGGAACCCCGGCGCCCGCCCUGCGAUCCCCUGGCUGACACCAUUGACAGCUCAGGGCCCUCCCUGACCCUGCCCAAUGGGGGCUGCCUUUCAGCCGUGGGGCUGCCACUGGGGCCAGGCCGGGAGGCCCUGGAAAAGGCCCUGGUCAUCCAGGAGUCAGAGAGGCGGAAGAAGCUCCGUUUCCACCCUCGGCAGUUGUACCUGUCCGUGAAGCAGGGCGAGCUGCAGAAGGUGAUCCUGAUGCUGUUGGACAACCUGGACCCCAACUUCCAGAGCGACCAGCAGAGCAAGCGCACGCCCCUGCAUGCAGCCGCCCAGAAGGGCUCCGUGGAGAUCUGCCAUGUGCUGCUGCAGGCUGGAGCCAACAUAAAUGCAGUGGACAAACAGCAGCGGACGCCACUGAUGGAGGCCGUGGUGAACAACCACCUGGAGGUAGCCCGUUACAUGGUGCAGCGUGGUGGCUGUGUCUAUAGCAAGGAGGAGGACGGUUCCACCUGCCUCCACCACGCAGCCAAAAUCGGGAACUUGGAGAUGGUCAGCCUGCUGCUGAGCACAGGACAGGUGGACGUCAACGCCCAGGACAGUGGGGGGUGGACGCCCAUCAUCUGGGCUGCAGAGCACAAGCACAUCGAGGUGAUCCGCAUGCUACUGACGCGGGGCGCCGACGUCACCCUCACUGACAACGAGGAGAACAUCUGCCUGCACUGGGCCUCCUUCACGGGCAGCGCCGCCAUCGCCGAAGUCCUUCUGAAUGCGCGCUGUGACCUCCAUGCUGUCAACUACCAUGGGGACACCCCCCUGCACAUCGCAGCUCGGGAGAGCUACCAUGACUGCGUGCUGUUAUUCCUGUCACGUGGGGCCAACCCUGAGCUGCGGAACAAAGAGGGGGACACAGCAUGGGACCUGACUCCCGAGCGCUCCGACGUGUGGUUUGCGCUUCAACUCAACCGCAAGCUCCGACUUGGGGUGGGAAAUCGGGCCAUCCGCACAGAGAAGAUCAUCUGCCGGGACGUGGCUCGGGGCUAUGAGAACGUGCCCAUUCCCUGUGUCAACGGUGUGGAUGGGGAGCCCUGCCCUGAGGAUUACAAGUACAUCUCAGAGAACUGCGAGACGUCCACCAUGAACAUCGAUCGCAACAUCACCCACCUGCAGCACUGCACGUGUGUGGACGACUGCUCUAGCUCCAACUGCCUGUGCGGCCAGCUCAGCAUCCGGUGCUGGUAUGACAAGGAUGGGCGAUUGCUCCAGGAAUUUAACAAGAUUGAGCCUCCGCUGAUUUUCGAGUGUAACCAGGCGUGCUCAUGCUGGAGAAACUGCAAGAACCGGGUCGUACAGAGUGGCAUCAAGGUGCGGCUACAGCUCUACCGAACAGCCAAGAUGGGCUGGGGGGUCCGCGCCCUGCAGACCAUCCCACAGGGGACCUUCAUCUGCGAGUAUGUCGGGGAGCUGAUCUCUGAUGCUGAGGCUGAUGUGAGAGAGGAUGAUUCUUACCUCUUCGACUUAGACAACAAGGAUGGAGAGGUGUACUGCAUAGAUGCCCGUUACUAUGGCAACAUCAGCCGCUUCAUCAACCACCUGUGUGACCCCAACAUCAUUCCCGUCCGGGUCUUCAUGCUGCACCAAGACCUGCGAUUUCCACGCAUCGCCUUCUUCAGUUCCCGAGACAUCCGGACUGGGGAGGAGCUAGGGUUUGACUAUGGCGACCGCUUCUGGGACAUCAAAAGCAAAUAUUUCACCUGCCAAUGUGGCUCUGAGAAGUGCAAGCACUCAGCCGAAGCCAUUGCCCUGGAGCAGAGCCGUCUGGCCCGCCUGGACCCACACCCUGAGCUGCUGCCCGAGCUCGGCUCCCUGCCCCCUGUCAACACAUGAGAACGGACCACACCCUCUCUCCCCAGCAUGGAUGGCCACAGCUCAGCCGCCUCCUCUGCCACCAGCUGCUCGCAGCCCAUGCCUGGGGGUGCUGCCAUCUUCUCUCCCCACCACCCUUUCACACAUUCCUGACCAGAGAUCCCAGCCAGGCCCUGGAGGUCUGACAGCCCCUCCCUCCCAGAGCUGGUUCCUCCCUGGGAGGGCAACUUCAGGGCUGGCCACCCCCCGUGUUCCCCAUCCUCAGUUGAAGUUUGAUGAAUUGAAGUCGGGCCUCUAUGCCAACUGGUUCCUUUUGUUCUCAAUAAAUGUUGGGUUUGGUAAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2089.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2168.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 945.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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